製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報受託サービスマイクロアレイSNPアレイ受託解析>Affymetrix® Axiom® Array

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
・マイクロアレイ
+ 遺伝子発現解析
+ CNVアレイ
+ PSC(多能性幹細胞)核型解析アレイ
+ Non-coding RNAアレイ
- SNPジェノタイピングアレイ
illumina BeadChipアレイ
Affymetrix® Genome-Wide Human SNP Array
Affymetrix® Axiom® Array
+ DNAメチル化アレイ
+ ChIP-chipアレイ
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
バイオインフォマティクス
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ

ハイスループットSNPジェノタイピングアレイ受託解析
Affymetrix
® Axiom® Array 受託解析サービス
フィルジェンでは、AKESOgen社との業務提携により、Affymetrix® Axiom® Array を用いた受託解析サービスをご提供致しております。
概要

本サービスで使用するAxiom® Genotyping Solutionは、検証済みのSNPで構成されるAxiom® Genomic Databaseからコンテンツを選択した、レディーメイド又はカスタムメイドのアレイプレート、専用の試薬キット、データ解析ツール及びGeneTitan® Multi-Channel(MC) Instrumentを利用して完全に自動化されたワークフローで構成されています。  

特長


◆Affymetrix®社のAxiom® Arrayを多数用意し、ヒト以外にも複数の動植物に対応
◆大規模受託解析プロバイダーであるAKESOgen社による、ハイコストパフォーマンス解析サービス
◆CLIA/CAP認定ラボでの解析
◆高品質かつ正確なデータを短納期で提供


【アレイラインナップ】
Axiom® Genome-Wide Human Array
Axiom® Genome-Wide Exsome 319 Array Plate 非同義SNPと同義SNP、ならびにスプライシングと停止コドンのバリアントを含めた30万を超えるコーディングSNPを搭載。1000ゲノムプロジェクトPhaseⅠのドラフトエクソームコールから得られた約3万のSNPとインデルを搭載。疾患関連の機能性バリアントをスクリーニングするための最適なアレイ。
Axiom® Genome-Wide Human Origins 1 Array Plate 11種の現代のヒト集団および初期のヒト科生物の62.9万個のSNPを搭載。ヒトや人種分布の起源・進化研究用にHarvard Medical School Dept of GeneticsのDr. David Reichと共同で開発されたアレイ。
Axiom® Genome-Wide CEU 1 Array Plate ヨーロッパ人集団にみられる頻度の低い変異(MAF>1%)のカバー率を最大化したGWAS用アレイプレート。
Axiom® Genome-Wide ASI 1 Array Plate 東アジア人(JPTおよびCHB)のゲノムの共通配列にみられる頻度の低いアレル(MAF>1%)のゲノムカバー率を最大化したGWAS用アレイプレート。
Axiom® Genome-Wide CHB 1 Array Plate 漢民族系中国人のゲノムに見られる頻度の高い変異(MAF>5%)の遺伝的カバレージを最大化したGWAS用アレイプレート。
Axiom® Genome-Wide CHB 2 Array Plate 漢民族系中国人のゲノムに見られる頻度の高い変異(MAF 2-5%)の遺伝的カバレージを最大化したGWAS用アレイプレート。
Axiom® Genome-Wide EUR 1 Array Plate(World Array1) 疾患に関連した頻度の高い変異および頻度の低い変異をカバーし、GWAS、レプリケーション、ファインマッピングを一度にできる様にデザインされたアレイプレート。北ヨーロッパ人種での遺伝的カバレージを最大化する様にマーカーを選択。
Axiom® Genome-Wide EAS 1 Array Plate(World Array2) 疾患に関連した頻度の高い変異および頻度の低い変異をカバーし、GWAS、レプリケーション、ファインマッピングを一度にできる様にデザインされたアレイプレート。ヨーロッパ人種と東アジア人種での遺伝的カバレージを最大化する様にマーカーを選択。
Axiom® Genome-Wide AFR 1 Array Plate(World Array3) 疾患に関連した頻度の高い変異および頻度の低い変異をカバーし、GWAS、レプリケーション、ファインマッピングを一度にできる様にデザインされたアレイプレート。アフリカ系アメリカ人種での遺伝的カバレージを最大化する様にマーカーを選択。
Axiom® Genome-Wide LAT 1 Array Plate(World Array4) 疾患に関連した頻度の高い変異および頻度の低い変異をカバーし、GWAS、レプリケーション、ファインマッピングを一度にできる様にデザインされたアレイプレート。西アフリカ、ヨーロッパ、アメリカ先住民人種での遺伝的カバレージを最大化する様にマーカーを選択。
Axiom® Genome-Wide PanAFR Array Plate ヨルバ族(西アフリカ人)のゲノムに見られる共通および頻度の低い変異(MAF>2%)の遺伝的カバレージが≧90%、ルイヤ族とマサイ族(東アフリカ人)のゲノムに見られる共通および頻度の低い変異(MAF>2%)の遺伝的カバレージが>85%である、全アフリカ人のゲノムカバレージを提供する最初のアレイ。
CarrierScanTM Assay 600の疾患に関する600遺伝子における6,000以上の構造および配列変異を評価。
PharmacoScanTM 遺伝的変異が薬剤のADMEにどの様な影響を与えるかを調べる理想的なプラットフォーム。単一のアッセイで約1,200個の遺伝子内の4,627個のhigh-evidenceからlow-evidenceのマーカーまで、正確かつ再現性よく解析。
Axiom® Precision Medicine Research Array(PMRA) アフリカ、アメリカ、東アジア、ヨーロッパ、南アジアの先住民での遺伝的カバレージを最大化する様にマーカーを選択。GWAS用マーカーに加え、Loss of function SNP, Pharmacogenomics, eQTLマーカーなどを搭載。
Axiom® Biobank Genotyping Array
Axiom® Biobank Genotyping Array バイオバンクサンプルなど、大規模なコホート研究に適する様にデザインされ、低コストな解析を可能にしたアレイプレート。GWAS用マーカー、Exomeマーカーに加え、Loss of function SNP, Pharmacogenomics, eQTLマーカーなどを搭載。
UK Biobank Axiom® Array UK Biobankで採用されたアレイ。約82万のマーカーを搭載。
Axiom® Transplant Genotyping Array 移植に関する研究用に、マーカーをセレクト。iGeneTRAiN Array Design Groupによってデザインされ、SNP、コピー数変異、indelマーカーを計782,000搭載。
Axiom® miRNA Target Site Genotyping Array
Axiom® miRNA Target Site Genotyping Array miRNAのターゲットサイトのジェノタイピングが可能な唯一の市販アレイ。miRNAプロモーター、miRNAシードサイト、miRNAターゲットバインディングサイトなどにある、既知および予測されるSNPやインデルマーカーを搭載。
Axiom® Genome-Wide Non-Human Array
 Plant
Axiom® Apple Genotyping Array Malus domestica 63品種の全ゲノムシークエンシングから得られた約48万マーカーを搭載。FruitBreedomics consortiumとの共同研究によってデザイン。
Axiom® Cotton Genotyping Array G. hirsutum and G.barbadenseで発見された約35,550マーカーを搭載。National Botanical Research Institute, Indiaによってデザイン。
Axiom® Maize Genotyping Array Maize(Zea mays L.)の約60万SNPを搭載。The AgroClustER Synbreed(funded by the German Ministry of Education and Research, BMBF)における共同研究によってデザイン。
Axiom® Rice Genotyping Array GeneChipTM Rice 44K Genotyping Array1の約4万3千マーカーとWhole-genome SNP array(RICE6K)の約6千マーカーを搭載。
Axiom® Strawberry Genotyping Array 8倍体であるイチゴのジェノタイピングを可能にした、初めてのアレイ。
Axiom® Soybean Genotyping Array 栽培品種および野生種Soybeanの約18万SNPを搭載。Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology(KRIBB), Rural Development Administration, およびNational Institute of Crop Scienceとの共同開発。
Axiom® Wheat HD Genotyping Array Plate A&B 2アレイ合計で、コムギの約817,000SNPを搭載。UKのCereal Functional Genomics Group at the School of Biological Sciences, University of Bristol と Biotechnology and Bioscienced Research Council(BBSRC)との共同開発。
Axiom® Wheat Breeder's Genotyping Array Plate Axiom® Wheat Breeder's Genotyping Arrayに搭載のSNPから育種の研究用に選択された約35,000SNPを搭載。
 Animal
Axiom® Genome-Wide BOS1 Array 肉牛、乳牛の10のウシ品種において、限られたSNP数で最大の遺伝学的カバレージを得るため、独自のプロセスによりデザイン。
Bovine-Ovine-Caprine Affymetrix Expert Design Programによって設計された動物遺伝子型決定のためのアレイ。ウシ、ヒツジ、ヤギについてそれぞれ United States Department of Agriculture Research Service(USDA ARS)、International Sheep Genomics Consortium(ISGC)および International Goat Genome Consortium によって同定されたSNPsを搭載。
Axiom® Genome-Wide Chicken Genotyping Array ブロイラーや採卵用の鶏の複数の品種をカバーした、市販ではじめての鶏用ゲノムワイドジェノタイピングアレイ。アカデミックおよび家禽業界のリーダーによる共同研究によりデザイン。
Axiom® Buffalo Genotyping Array Plate 複数の種にわたるWater BuffaloのSNPのゲノムワイドなカバレージを最大化したアレイ。International Buffalo Genome Consortiumにて開発。
Axiom® Equine Genotyping Array 複数の種にわたるEquineの67万以上のSNPを搭載。University of Minnesita、Equine Genetic Diversity Consortiumによる共同研究によりデザイン。
Axiom® Salmon Genotyping Array Plate Atlantic salmonの約13万SNPを搭載。The Roslin Institute(University of Edinburgh), Edinburgh Genomics, Landcatch Natural Selection Ltd., University of Striling, and Unicersity of Glasgowとの共同研究。
Axiom® Trout Genotyping Array Rainbow Trout(Oncorhynchus mykiss)の約57,000SNPを搭載。National Center for Cool and Cold WaterAquaculture, USDA-ARS(USA)およびAquaGen社(Norway)との共同研究。
Axiom® Canine Genotyping Array Set A -
Axiom® Canine Genotyping Array Set B SNP検証研究、候補遺伝子研究、ファインマッピング研究のターゲットジェノタイピング用に1,500~500,000個のタグ付けされたSNPを搭載。
Axiom® Porcine Genotyping Array レプリケーション、ゲノムワイド関連解析用に、500,000~260万個のタグ付けされたSNP搭載。
Axiom® Microbiome Array
Axiom® Microbiome 96-Array Plate 本アレイは、1回のアッセイでサンプル中の既知微生物を包括的に検出するためのソリューションです。古細菌、細菌、真菌、原生生物、ウイルスの5つのドメインを網羅しており、種レベルおよび株レベルの検出が可能です。


サービス内容


ご送付頂いたDNAサンプルを用いて、品質チェック(QCチェック)からAxiom Arrayのアッセイ・スキャンニングまで実施いたします。これらの作業は、CLIA/CAP認定を受けた弊社海外提携先のラボにて実施されます。

【作業内容】
 1. サンプルQCチェック
 2. Axiom Arrayのアッセイ
 3. スキャニング

(サンプルQCチェックについて)
QC結果が良好な場合、作業は継続されますが、そうでない場合、解析の進め方について、ご連絡させて頂きます。通常、以下の中からご選択いただきます。

 A. 追加の精製・濃縮を行う。(本作業で問題の解決が見込まれる場合): 別途作業費用を請求させて頂きます。
 B. 代替サンプルをお送り頂く: 別途海外提携先へのサンプル輸送費が必要となります。
 C. お客様の同意の上、作業を継続します。: 結果如何によらず、通常料金を請求させて頂きます。


納品物


・Raw data(CEL file)

※CD-R等の記録メディアにて納品いたします。
※プロジェクトによって、納品物が変更される場合もあります。


サンプル条件


サンプルタイプ 輸送温度 サンプル量
濃度(※1) 液量
ゲノムDNA 冷凍保存の場合: ドライアイス詰めで冷凍便 800ng以上 200ng/μL以上 40μL以上
4℃保存の場合: アイスパックと共に冷蔵便
※1 Picogreen、Qubitなど、蛍光ベースの装置で測定してください。
1. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
2. DNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE Bufferにて保存してください。
 ※長期保存の場合は、-20℃又は-80℃で保存してください。


価格・納期


【価格】
サービス名 アレイ
フォーマット
数量(サンプル数) 税別価格 カタログ番号
最少受入数 ご注文単位
Axiom® Genome-Wide Human Array
Axiom® Genome-Wide Exsome 319 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-902106
Axiom® Genome-Wide Human Origins 1 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901853
Axiom® Genome-Wide CEU 1 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901608
Axiom® Genome-Wide ASI 1 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901640
Axiom® Genome-Wide CHB 1 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901764
Axiom® Genome-Wide CHB 2 Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901842
Axiom® Genome-Wide EUR 1 Array Plate(World Array1)
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901787
Axiom® Genome-Wide EAS 1 Array Plate(World Array2)
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901847
Axiom® Genome-Wide AFR 1 Array Plate(World Array3)
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901848
Axiom® Genome-Wide LAT 1 Array Plate(World Array4)
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901849
Axiom® Genome-Wide PanAFR Array Plate
受託解析サービス1)
96 96 96 お問合せ F-AKS-901788
CarrierScanTM Assay 受託解析サービス 96 96 96 お問合せ F-AKS-931931
PharmacoScanTM 受託解析サービス 24 882) 223) お問合せ F-AKS-903010TS
Axiom® Precision Medicine Research Array(PMRA)
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-902981
Axiom® Biobank Genotyping Array
Axiom® Biobank Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-902186
UK Biobank Axiom® Array
受託解析サービス
96 480 96 お問合せ F-AKS-902583
Axiom® Transplant Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-902865
Axiom® miRNA Target Site Genotyping Array
Axiom® miRNA Target Site Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-903010TS
Axiom® Genome-Wide Non-Human Array
 Plant
Axiom® Apple Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550573
Axiom® Cotton Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550563
Axiom® Maize Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550494
Axiom® Rice Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550625
Axiom® Strawberry Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550466
Axiom® Soybean Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550469
Axiom® Wheat HD Genotyping Array Plate A&B
受託解析サービス4)
96 96 96 お問合せ F-AKS-5504912
Axiom® Wheat Breeder's Genotyping Array Plate
受託解析サービス
384 384 384 お問合せ F-AKS-550468
 Animal
Axiom® Genome-Wide BOS1 Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-901791
Bovine-Ovine-Caprine 受託解析サービス 96 96 96 お問合せ F-AKS-550627
Axiom® Genome-Wide Chicken Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-902148
Axiom® Buffalo Genotyping Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550431
Axiom® Equine Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550538
Axiom® Salmon Genotyping Array Plate
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550540
Axiom® Trout Genotyping Array(384フォーマット)
受託解析サービス
384 384 384 お問合せ F-AKS-550571
Axiom® Canine Genotyping Array Set A
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550771
Axiom® Canine Genotyping Array Set B
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550772
Axiom® Porcine Genotyping Array
受託解析サービス
96 96 96 お問合せ F-AKS-550588
Axiom® Microbiome Array
Axiom® Microbiome Array 受託解析サービス 96 192 96 お問合せ F-AKS-902904
1) 3種類のアレイプレートで1セットです。
2) 4プレート96アレイの内、コントロールサンプルとして8アレイを使用します。
3) 1プレート24アレイの内、コントロールアレイとして2アレイを使用します。
4) 2種類のアレイプレートで1セットです。
アレイに搭載されている遺伝子群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。
サンプル最少受け入れ数やご注文単位は、事前の予告無く変更される場合があります。

【納期】
サンプル受領及びアレイ・試薬入荷後から、5~6週間程度
※海外提携先にアレイの在庫が無い場合、アレイの入荷に別途3週間~1ヶ月程度かかることがあります。
※年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。


サービスの流れ


フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター

1. お見積もり
 ご希望されるサンプル数などの情報を基に、価格・必要サンプル量などをご連絡いたします。
 ※正式なお見積もりは、代理店よりご提出させて頂きます。
 ↓

2. サンプル送付
 弊社宛てに、解析サンプル及びQCシートをご送付ください。
 ※送料は、お客様負担となります。(着払いではお受け取りできませんので、ご注意ください。)
 ご送付いただいた内容物を弊社で確認し、弊社から、AKESOgen社(アメリカ)にサンプルを送付いたします。
 ※本サービスは、海外での解析という性質上、サンプルを受け取った以降のキャンセルはお引き受けできませんので、ご注意ください。

 (サンプル送付先)
 フィルジェン株式会社 バイオサイエンス部 受託解析センター宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
 Tel 052-624-4388 / Fax 052-624-4389 / E-mail biosupport@filgen.jp

 (注意点)
サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。
サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、砕いたドライアイスとともに梱包し、冷凍便にてお送りください。
弊社営業日は、土日祝日や年末年始などを除く平日9時~18時までとなっておりますので、サンプルの弊社到着日にご注意ください。また、休日を挟まない様にご発送ください。
サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシート及び免責同意書を同封してお送りください。これらが同封されていない、あるいは、記入漏れ等がある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
組織・細胞をご送付の際は、ペレット状態にし、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍便にて凍結状態にてご送付ください。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせて頂きます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご注意ください。
ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
ご提供いただくサンプル及び本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。
ご提供いただいたサンプルの返却は致しておりません。実験後のサンプルは、基本的に、弊社又は弊社業務提携先にて破棄いたしますこと、予めご了承ください。
本確認事項を満たさない事で、別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。

AKESOgen社

3. 解析作業の実施
 ↓

4. 納品
 解析終了後、CD/DVD-Rなどにより、解析データを納品いたします。
 ※納品物は、基本的に代理店を介してお送りいたします。
 ※納品データは、必ずお客様にてバックアップをお取りください。
 ※弊社での保管期間を経過したデータは、破棄されます。(弊社データ保管期間は、発送から3ヶ月間です。)


ご注意事項


本サービスの解析は、弊社の海外提携先(AKESOgen社(アメリカ))にて実施します。
本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。
やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。
品質チェック(QCチェック)等の問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担いただきます。
・  余ったサンプルの返却はできません。(サンプルは、解析終了後に破棄されます。)
・  生データを含む解析結果は、発送から3ヵ月後に消去されるため、必ずバックアップをお取りください。
・  動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取扱いできないことがあります。
※こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合もあります。


本ページは、AKESOgen社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
Copyright (C) 2004-2018 Filgen, Inc. All Rights Reserved.