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1 組織や細胞、血液からtotal RNA抽出

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QCシートとともにお送り頂いた組織や細胞、血液から、total RNA(smallRNAを含む)を抽出します(オプション)。 |
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2 サンプルの品質チェック

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total RNAサンプルは、Agilent 2100バイオアナライザにより、品質(QC; Quality Control)チェックを行います。 |
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RNA QCチェック結果が芳しくない場合には、サンプルの再提出をお願いすることがあります。 (再提出分は、無償対応いたしておりますが、それ以降の調整は、別途追加料金(QCチェック費用:「30,000円(税別)/1回(12サンプル)」)が必要となります。) |
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3 サンプルのPoly(A) Tailing, Ligation, Biotin標識

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QCチェックを通過したサンプルを、「Genisphere® FlashTagTM Biotin HSR」を用いて、Poly(A) Tailing, Ligation, Biotin標識を行います。
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4 ハイブリダイゼーション/自動洗浄・染色

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上記で調整したサンプルを、「GeneChipTM Scanner 7000 3G System」及び、「GeneChipTM Hybridization, Wash, and Stain Kit Hybridizaiton Controls」を用いて、にて、ハイブリダイゼーションさせ、自動洗浄・染色させます。
・ 単色(Cy5)ハイブリダイゼーション |
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5 スキャニング・データ解析(数値化)

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ハイブリダイゼーション後のアレイを、GeneChipTM Scanner 3000 7G Systemにて読み取り、画像ファイルを各スポットの発現強度の数値データに変換し、バックグラウンド減算処理・ノーマライズ補正・発現比算出などを行います。
このデータを、MicroArray Data Analysis toolで読み込むためのファイル形式に変換します。

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6 解析データのご報告

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データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
また、当社オリジナルマイクロアレイデータ解析ソフトウェア「MicroArray Data Analysis tool」も無償提供致しております。
各種複数条件におけるフィルタリング機能、データベースへのハイパーリンク機能、スキャッタープロット機能などを搭載しております。
また、スタンフォード大学で提供されているフリーの統計解析ソフトウェア「Cluster3.0」に対応したフォーマットのデータを出力する機能も搭載しています。
納期は、サンプ到着後、3~4週間程度です。
*オプション抽出サービスをお申し込み頂いた場合は、別途抽出サービスの納期(通常、キット及びサンプル受け入れ後、5~10営業日)が追加となります。
*サンプル数、オプション作業の追加などにより、標準納期より、お時間を頂戴する場合があります。
詳しくは、当社までお問い合わせください。
【実験データの解析結果例】
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RNA品質チェックデータ(BioAnalyzer) |
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数値解析データ(EXCEL)/スキャッタープロット図 |

MicroArray Data Analysis tool |
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