製品・サービス情報
|
|
ArrayStar社 遺伝子発現制御機構解析
non-coding RNA マイクロアレイ受託解析サービス |
|
 |
| Arraystar社の各種アレイを用いた受託解析サービスをご提供いたします。ベストセラーであるLncRNAマイクロアレイをはじめ、CircRNAマイクロアレイ,
T-UCRマイクロアレイ, piRNAマイクロアレイの受託サービスを提供しています。 |
 piRNA Arrays 受託解析サービス
|
Piwi-interacting RNA(piRNA)は、約23-36塩基長の1本鎖small non-coding RNAです。piRNAは、アルゴノートタンパク質のPiwi（P-element
Induced Wimpy Testis）サブファミリーと相互作用します。piRNAは非常に多彩であり、近縁種間であっても配列保存度が低いものとなっています。数百存在するmicroRNAとは対照的に、数万ものpiRNA配列がヒトやマウス、ラットにおいて知られています。piRNAは、長さおよび発現様式、ゲノム構成において、microRNAと非常に異なっています。piRNAの機能としては、生殖細胞におけるトランスポゾンのサイレンシングによるゲノム安定性の維持などが知られていますが、他にも機能を有する可能性があります。Arraystar
piRNA microarrayは、ヒトおよびマウス、ラットに対応し、ロング オリゴヌクレオチド プローブの採用およびデュプレックスデザインにより、数万のpiRNAを高い特異性および感度でプロファイルし、piRNAの生物学や分子機能、生殖細胞やがん、その他の細胞型におけるバイオマーカー的機能に関する研究を支援します。
【特長】
|
・ |
piRNAを包括的にプロファイリング |
| ・ |
ロング オリゴヌクレオチド プローブの採用による高い特性を実現 |
【マイクロアレイ情報】
|
| 生物種 |
ヒト |
マウス |
ラット |
| リファレンスゲノム |
hg19 |
mm9 |
rn4 |
| piRNA数 |
23,677 |
43,537 |
39,727 |
| プローブ長 |
60 nt |
| ラベリング法 |
T4 RNA リガーゼによる脱リン酸化RNAとの Cy3 標識 |
| アレイフォーマット |
4x44K |
|
【ワークフロー】
|
本サービスでは、サンプル調整からデータ解析までのフルサービスを提供します。段階的な品質管理は、信頼できる結果の取得を確かなものとする様にデザインされています。お客様にはサンプルをご提供頂くだけです。
サンプルのご準備については、同社の Sample Submission Guideline をご参照ください。
・RNA 品質チェック（QC）
・Cy3 ラベリング
・アレイハイブリダイゼーション、洗浄、スキャンニング
・データ抽出、解析、要約
|
【バイオインフォマティクス】
|
piRNAマイクロアレイのデータから、遺伝子発現値およびアノテーションがまとめられます。発現変動 piRNA は、変動および統計的有意差によって同定されます。
図1. piRNAマイクロアレイのデータ解析およびグラフ化は、標準の解析パッケージに含まれています。 |
【参考文献】
|
1. |
PIWIL3/OIP5-AS1/miR-367-3p/CEBPA feedback loop regulates the biological
behavior of glioma cells. Liu X, et al. Theranostics, 2018 |
| 2. |
RASSF1C modulation of Piwi-interacting RNAs(piRNAs) in lung cancer YG Amaar,
et Cancer Research, 2015 |
| 3. |
Roles of piRNAs in microcystin-leucine-arginine(MC-LR) induced reproductive
toxicity in testis on male offspring. Zhang L, et al. Food and Chemical
Toxicology, 2017 |
| 4. |
Piwi-interacting RNAs as novel prognostic markers in clear cell renal cell carcinomas. J Busch, et al. J Exp Clin Cancer Res., 2015 |
| 5. |
Altered Expression of PIWI RNA in the Rat Brain After Transient Focal Ischemia. Ashutosh Dharap, Venkata Prasuja Nakka and Raghu Vemuganti. STROKEAHA, 2010. |
【税別価格】
|
| アレイ名 |
フォーマット |
サンプル数 |
税別単価※ |
Cat.# |
piRNA Array
受託解析サービス |
ヒト |
1サンプルから受付 |
￥147,000 |
F-AS-PIH-（サンプル数） |
| マウス |
F-AS-PIM-（サンプル数） |
| ラット |
F-AS-PIR-（サンプル数） |
※ 1サンプルの解析料金です。海外提携先への送料が別途必要となります。 |
|
解析の流れと必要サンプル量
＊本サイトの情報は、Arraystar社のHomepageの情報を一部引用しております。
|
|
