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リアルタイムPCRアレイ受託解析サービス<コピー数多型解析>
qBiomarker Copy Number
PCR Array 受託解析

微量サンプルをお送りいただければ、QIAGEN社製 qBiomarker Copy Number PCR Array を用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。

概要


qBiomarker Copy Number PCR Arraysによるコピー数多型解析を行う受託解析サービスです。qBiomarker Copy Number PCR Arrayは、シグナル伝達あるいは疾病と関連するゲノム遺伝子座パネルでコピー数を測定する様にデザインされています。これらのアレイは、生殖細胞でのコピー数変化(コピー数多型、またはCNV)または後天性のコピー数変化(コピー数異常、またはCNA)のどちらでも検出できます。ゲノム遺伝子座は、Database of Genomic Variants(DGV)などの広範に精選されたデータベースおよび臨床または機能的な適合性や出現頻度に基づいた文献レビューから選択されています。

リアルタイムPCR受託解析/パスウェイ遺伝子発現解析/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500


特長


各qBiomarker Copy Number PCR Array は、パスウェイや疾病に関連するGOI/ROIの厳密に選択したセットに対応する qBiomarker Copy Number PCR Arrays で構成されています。統計的解析を用いて、コピー数コールの精度を高めるため、各アッセイは 4 replicate でセットされています。
すべての qBiomarker Copy Number PCR Assay は、独自のゲノム領域内に設定されています。マルチコピーリファレンスアッセイである qBiomarker Multicopy Reference Copy Number PCR Assay (Mref) は、各アレイに含まれています。リファレンスアッセイはヒトゲノムに40回以上存在する安定した配列を認識し、そのコピー数は局在的なゲノム変化の影響を受けないか、最小限の影響しか受けません。テスト中にこのリファレンスアッセイを含めることにより、ΔΔCT法を使用することが可能であり、特定のターゲットに対してコピー数のコールあるいは相対的なコピー数変化のコールを正確に行えます。

qBiomarker Copy Number PCR Array のラインナップ


Product Catarogue No.
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Kinase & Phosphatases VAHS-0001Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human WNT Signaling Pathway VAHS-0002Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Gastric Cancer VAHS-0052Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Glioma VAHS-0053Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Pancreatic Cancer VAHS-0054Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Breast Cancer VAHS-0055Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Lung Cancer VAHS-0056Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Ovarian Cancer VAHS-0057Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Prostate Cancer VAHS-0058Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Alzheimer's Disease VAHS-0502Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Intellectual Disability VAHS-0503Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Schizophrenia VAHS-0504Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Birth Defects VAHS-0510Z
qBiomarker Copy Number PCR Array Human Autism Spectrum Disorders VAHS-3501Z


サンプルのご準備


- ご送付量 状態
組織 10~25mg ペレット
液体窒素凍結
細胞 1×106~5×106 ペレット
液体窒素凍結
血液 >8.5mL PAXgene DNA 採血管
全血 >200μL 冷凍 (-20℃以下) 
ゲノムDNA >1.5μg (min. 0.4μg)
>10ng/μL 
Nuclease-free Water
O.D.260/O.D.280=1.8~2.0
※DNA抽出(オプション)をご希望の場合は、「DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。

【サンプル発送に関する注意事項】
1. サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
2. (サンプル送付先)
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
Phone 052-624-4388 Fax 052-624-4389


解析の流れ


1.組織や細胞からのゲノムDNA抽出

QCシート
とともに、ゲノムDNA、組織、細胞などをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付頂く場合は、当社にてゲノムDNAを抽出致します。(オプション)。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/totalRNA抽出


2.サンプルの品質チェック及び濃度測定

ゲノムDNAサンプルを分光高度計により、濃度測定します。



NanoDrop
TM One
3.サンプルの調整

サンプルの調整を行います。

4.リアルタイムPCR反応

ご指定のqBiomarker Copy Number PCR Array を用いて、「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、リアルタイムPCR反応を行います。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500

5.データ解析

QIAGEN社製 データ解析テンプレート(英語表記のみ)を使用し、得られたCt値をスプレットシートにコピー&ペーストすることで、コピー数が決定されます。


(解析データのご報告)

データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、PCRアレイキット入手及び、サンプル到着後、15~20営業日程度です。
*PCRアレイキット納期(通常3~4週間程度)・解析サンプル数・オプション作業の追加などにより、標準納期に加え、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/データCD



価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
qBiomarker Copy Number PCR Array
受託解析
1プレート
*2プレート以上で受注受付
¥175,000 Cat.#F-QPCR
-(プレートCat.#)-プレート数
 *上記価格には、PCRアレイキットの価格も含まれております。

オプション
商品名 数量 税別価格 Cat.#
ゲノムDNA抽出作業 1 DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。


本ページは、QIAGEN社のHomepageの内容を一部引用しております。

【お問合せ】
受託解析部
Phone 052-624-4388

https://filgen.jp/
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