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Home製品・サービス情報受託サービスリアルタイムPCR受託解析>miScript miRNA PCR Array 受託解析

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+ Taqman® Gene Expression Assays
+ Taqman® MicroRNA Assays
+ Taqman® SNP Genotyping Assays
+ TaqMan® Copy Number Assays
+ TaqMan® Array Cards
(384-well Micro Fludic Card)
+ TaqMan® Array Gene Signature 96-Well Plate
+ RT2ProfilerTM PCR Array
+ RT2 lncRNA PCR Array
- miScript miRNA PCR Array
+ EpiTect® Methyl Ⅱ PCR Array
  
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リアルタイムPCR受託解析サービス<miRNA発現定量解析>
miScript miRNA PCR Array 受託解析
微量サンプルをお送りいただければ、SABiosciences/QIAGEN社製 miScript miRNA PCR Arrayシステムを用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。


概要


リアルタイムPCR法により、miScript miRNA PCR Arrayシステム(SABiosciencesTM/QIAGEN社製)によるmiRNAに特化した発現受託解析サービスです。
microRNA(miRNA)は、様々な生物に存在するnoncodingRNA(約22nts)で、転写後遺伝子制御に関与しています。microRNAは、発生や分化・細胞シグナリング・感染応答を含む多くの生物学的なプロセスにおいて、重要な役割を果たしています。また、microRNA発現の調節異常が、がんを含むいくつかの疾病プロセスの原因あるいは指標であることも示唆されています。弊社では、QIAGEN社製のmicroRNA精製・定量および機能研究に必要なツールを用いた受託解析サービスを提供しています。
miScript miRNA PCR Arraysは、mature microRNAに特異的なforwardプライマー(miScript Primer Assays)を用いてつくられた製品です。網羅的なアレイパネルであるmiRNomeや、生物学的パスウェイに特化したアレイパネルをラインナップしており、様々な生物種に対応しています。(表1参照)
各アレイパネルには、サンプル調整からデータ解析までの全実験をモニタリングできるコントロールがセットされています。これらのmiRNA PCR Arrayの各アッセイは、リアルタイムPCRによる高感度で特異的なmature microRNA検出を確保するために、ウェット実験検証済みです。(操作手順は、図3を参照)
また、遺伝子、パスウェイに関する多数の貴重な情報およびバイオインフォマティクス・ツールをQIAGENのGeneGlobe(R)のポータルサイト(https://www.qiagen.com/jp/geneglobe)で検索・収集することが可能です。

リアルタイムPCR受託解析/パスウェイ遺伝子発現解析/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500


表1 解析可能なmiScript miRNA PCR Arrays 例

図2 miScript miRNA PCR Array レイアウト例

miScript miRNA PCR Arrayには、84種類のmicroRNA用miScript Primer Assaysと、データ標準化用・逆転写用・PCR用のそれぞれのコントロールがセットされています。


図3 miScript miRNA PCR Arrayの操作手順



miScript miRNA PCR Arrayのラインナップ


以下のSpecies欄の[Catarogue No.]をクリックして頂くと、メーカーの各PCR Arrayの詳細情報(lncRNAリスト、Referenceなど)を閲覧することができます。
PCR Array Discription 生物種 miRBase Ver. プレート数/サンプル MTP type Cat.#
(メーカー詳細情報へのリンク)
miRNome - 96well format miRNA genome(miRNome) as annotated in miRBase
Human:1008
Mouse:940
Rat:653
Dog:277
Rhesus Macaque:469
Human 16 12 96 MIHS-216Z
Mouse 16 12 96 MIMM-216Z
Rat 16 8 96 MIRN-216Z
Dog 16 4 96 MIFD-216Z
Rhesus Macaque 18 6 96 MIQQ-218Z
miFinder 84most abundantly expressed and best characterized miRNAs Human 10 1 96 MIHS-001Z
Mouse 10 1 96 MIMM-001Z
Rat 10 1 96 MIRN-001Z
Dog 17 1 96 MIFD-001Z
Rhesus Macaque 18 1 96 MIQQ-001Z
Pig 10 1 96 MISS-001Z
Apoptosis 84miRNAs that regulate programmed cell death by inhibiting pro-apoptotic and anti-apoptotic gene expression Human 18 1 96 MIHS-114Z
Mouse 18 1 96 MIMM-114Z
Rat 18 1 96 MIRN-114Z
Brain Cancer 84miRNAs known to after their expression during nervous system-related carcinogenesis Human 16 1 96 MIHS-108Z
Mouse 16 1 96 MIMM-108Z
Rat 16 1 96 MIRN-108Z
Breast Cancer 84miRNAs known or predicted to after their expression during breast cancer initiation or progression Human 17 1 96 MIHS-109Z
Mouse 17 1 96 MIMM-109Z
Rat 17 1 96 MIRN-109Z
Cancer PathwayFinder 84miRNAs differentially expressed in tumors versus normal tissue Human 10 1 96 MIHS-102Z
Mouse 10 1 96 MIMM-102Z
Rat 16 1 96 MIRN-102Z
Cancer Stem Cells 84miRNAs involved in cancer stem cell(CSC)biology Human 20 1 96 MIHS-118Z
Mouse 20 1 96 MIMM-118Z
Rat 20 1 96 MIRN-118Z
Cardiovascular Disease 84miRNAs known to exhbit altered expression during cardiov ascular desease and development Human 18 1 96 MIHS-113Z
Mouse 18 1 96 MIMM-113Z
Rat 18 1 96 MIRN-113Z
Dog 16 1 96 MIFD-113Z
Rhesus Macaque 18 1 96 MIQQ-113Z
Cell Development & Differentiation 84miRNAs differentially expressed during cellular defferentiation and organism development Human 10 1 96 MIHS-103Z
Mouse 10 1 96 MIMM-103Z
Rat 16 1 96 MIRN-103Z
Diabetes 84miRNAs experimentally identified and/or bioinformatically predicted to epigenetically regulate diabetes-related biological processes Human 19 1 96 MIHS-115Z
Mouse 19 1 96 MIMM-115Z
Rat 19 1 96 MIRN-115Z
Fibrosis 84miRNAs known to play a role in fibrosis Human 19 1 96 MIHS-117Z
Mouse 19 1 96 MIMM-117Z
Rat 19 1 96 MIRN-117Z
Immunopathology 84miRNAs defferentially expressed during normal and pathological responses by the immune system Human 14 1 96 MIHS-104Z
Mouse 14 1 96 MIMM-104Z
Rat 16 1 96 MIRN-104Z
Inflammatory Response and Autoimmunity 84miRNAs predicted to regulate the expression of proinflammatory or antiinflammatory genes Human 14 1 96 MIHS-105Z
Mouse 14 1 96 MIMM-105Z
Rat 16 1 96 MIRN-105Z
Liver miFinder 84miRNAs abundantly expressed or best characterized in liver tissue Human 19 1 96 MIHS-116Z
Mouse 19 1 96 MIMM-116Z
Rat 19 1 96 MIRN-116Z
Neurological Development & Disease 84miRNAs differentially expressed during neuronal development or the progression of neurological diseases Human 16 1 96 MIHS-107Z
Mouse 16 1 96 MIMM-107Z
Rat 16 1 96 MIRN-107Z
Ovarian Cancer 84miRNAs known to after their expression during ovarian cancer initiation and progression Human 17 1 96 MIHS-110Z
Mouse 17 1 96 MIMM-110Z
Rat 17 1 96 MIRN-110Z
Pain: Neuropathic & Inflammatory 84miRNAs involved in the transduction, maintenance, and modulation of pain responses Human 20 1 96 MIHS-120Z
Mouse 20 1 96 MIMM-120Z
Rat 20 1 96 MIRN-120Z
Prostate Cancer 84miRNAs known to alter their expression during prostate cancer progression and development Human 18 1 96 MIHS-112Z
Mouse 18 1 96 MIMM-112Z
Rat 18 1 96 MIRN-112Z
Serum & Plasma 84miRNAs detectable and differentially expressed in serum, plasma, and other bodily fruids Human 16 1 96 MIHS-106Z
Mouse 16 1 96 MIMM-106Z
Rat 16 1 96 MIRN-106Z
T-Cell & B-Cell Activation 84miRNAs involved in the activation and differentiation of T cells and B cells Human 18 1 96 MIHS-111Z
Mouse 18 1 96 MIMM-111Z
Rat 18 1 96 MIRN-111Z


受託解析サービスの流れ


1.組織や細胞からのtotalRNA抽出

QCシートとともに、totalRNA、組織、細胞などをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付頂く場合は、当社にてtotalRNAを抽出致します。(オプション)。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/totalRNA抽出

2.サンプルの品質チェック及び濃度測定

totalRNAサンプルを、Agilent 2100バイオアナライザー及び分光高度計により、品質チェック及び濃度測定を行います。
サンプルが、品質チェックした結果、リアルタイムPCR実験に適さない場合には、下記のいずれかをご選択頂くことになります。

  ● サンプルの再送付
  ● 解析中止
解析を中止する場合は、totalRNA抽出作業料金をご請求させて頂きます。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/BioAnalyzerによるRNA検定

3.サンプルの調整

miRNAサンプルからcDNAを調整します。
QuantiTect SYBR Green PCR Mastermix、miScript Universal Primer、水と混和し、miScript miRNA PCR Arrayの各ウェルに分注します。
4.リアルタイムPCR反応

ご指定のPCRアレイを用いて、「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、リアルタイムRT-PCR反応を行います。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500

5.データ解析

SABiosciences(QIAGEN)社製データ解析テンプレート(英語表記のみ)を使用し、得られたCt値をスプレッドシートにコピー&ペーストすることで、ΔΔCt法により、発現のFold Changeを解析します。

サンプルQCチェック
リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/増幅曲線
増幅曲線

解析数値データ

スキャッタープロット
(解析データのご報告)
データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、PCRアレイキット入手及び、サンプル到着後、15~20営業日程度です。
*PCRアレイキット納期(通常3~4週間程度)・解析サンプル数・オプション作業の追加などにより、標準納期に加え、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/データCD



ご準備頂くサンプル

ご送付量 状態
組織 50mg~100mg TRIzol®, Isogen®
5~30mg ペレット, RNAlater®
細胞 5×106~1×107 TRIzol®, Isogen®, ペレット, Buffer RLT
totalRNA 500ng以上(min.250ng) Nuclease-free Water
O.D.260/O.D.280=1.6以上(*2)
RIN推奨値 7.0以上
50ng/uL程度
血液 0.5~1mL TRIzol® LS(*1)
2.5mL PAXgene® RNA採血管
* RNA抽出作業は、オプション(¥15,000(税別)/サンプル)となります。
* 組織・細胞・全血からのtotalRNA抽出は、抽出1回あたりのサンプル量です。
  ご希望の解析内容に応じたプレートの種類やプレート数によっては、複数回になる場合があります。
* 必要なtotalRNA量
  totalRNA推奨量は、1プレートあたりの必要量です。
  ご希望の解析内容(プレート種類)に応じたプレート数を乗じたサンプル量をご準備下さい。
   計算例 totalRNA推奨量(ug)=0.5×解析プレート数×1.2
* 本受託解析サービスに用いるtotalRNAの推奨抽出精製キットは、「miRNeasy Mini Kit(QIAGEN, Cat.#217004)」です。
* 複数回にまたがるアッセイ間や使用キットのロットが異なる場合、解析結果に差が生じる場合があります。
*1 全血をご準備の際、予め「全血:RNase-free water=1:1」に混合したものをご準備ください。
  詳細は、試薬プロトコールをダウンロードの上、ご参照ください。
  この混合溶液(最大)2mLを抽出1回とカウントさせて頂きます。
*2 O.D.値は、bufferによって大きく値が変わります。


 ご使用頂くチューブ及びマーキングについて
RNAをご送付頂く場合、1.5mLエッペンドルフ型チューブをご使用ください。
組織や細胞をご送付頂く場合、適当な大きさのチューブ類をご利用ください。
チューブには、蓋上面と本体サイド面の両方に、油性マジックでサンプル名(QCシート内のTubeラベル項目)をご記入ください。また、シールを貼る場合、剥がれにくいシールを使用してください。なお、シールを貼る前に、チューブ自身にもサンプル名を油性マジックなどで記入してください。(これは、万一シールが剥がれた場合、サンプルを特定するために必要となります。)

 totalRNAをご送付頂く場合のサンプルの準備・調整方法
totalRNA調製は、miRNeasy Mini Kit(QIAGEN, Cat.#217004)をご使用頂くことを推奨しています。なお、TRIzolをご使用される場合は、含フェノール等を除くために、miRNeasyにてクリーンナップすることをお勧めします。
高品質なRNAを調整するため、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。
totalRNAは、必ずRNase‐free H2Oに溶解してください。界面活性剤・DEPC・高イオン強度(>10mM TE,>10mM NH4 Acetateなど)を含んだバッファを使用されますと、正確なQCチェックが行えなかったり、逆転写反応を阻害しますので、使用しないでください。

 RNA抽出サービスをお申し込み頂いた場合のサンプル準備・調整方法
RNA抽出サービスをご利用の方は、以下のプロトコールに従って、サンプルをご準備ください。
高品質なRNAを調整するため、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。
ペレット調製方法
組織 新鮮な組織に液体窒素を入れ、粉状になるように粉砕する。
粉末をチューブ底に集め、-80℃で保存する。
細胞 細胞5×105個~1×107個に対し、ご使用の培養液1mLを添加し、2,000rpm,2分遠心し、上清を除去する。
1×PBS 1mLをいれて洗浄し、2,000rpmで2分遠心し、上清除去を2回繰り返し、ペレットにしてチューブ底に集める。
液体窒素にて凍結後、-80℃で保存する。
TRIzol Reagent(Thrmo Fisher Scientific, cat.#155596026)をご利用の場合
組織 新鮮な組織に液体窒素を入れ、粉状になるように粉砕する。
粉状組織10~100mgに対し、1mL TRIzol Reagent を添加し、Homogenizationを行う。
-80℃で保存する。
細胞 細胞5×105個~1×107個に対し、ご使用の培養液1mLを添加し、2,000rpm,2分遠心し、上清を除去する。
1×PBS 1mLをいれて洗浄し、2,000rpm,2分遠心,上清を除去する(2回行う)。
ペレット(細胞5×105~1×107個)に対し、1mL TRIzol Reagent をいれ、18~23Gの針をつけたプラスチックシリンジ(滅菌済みのものを使用)、あるいは、ピペット(滅菌済みチップを使用)を使い、サラサラの液になるまで、何回も針を通過させて液を上下させる。
-80℃で保存する。
備考: 血液やウイルス含有物など液体系サンプルの場合は、TRIzol LS Reagent (Thermo Fisher Scientific, cat.No.10296-010)をご利用ください。

 注意事項
サンプル準備について
サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、中身の漏れがないようにしてください。
サンプルの入ったチューブ(-80℃以下で凍結した状態)に油性マジックやシールなどでサンプル名が明記されていることを確認し、ビニールバックなどにいれ、砕いたドライアイスと共に梱包してください。(右図をご参照ください。)
解析に必要なRNA量が確保できない場合は、サンプルの再送をお願いすることがあります。
RNA抽出サービスは、リアルタイムPCR解析に必要なRNA量の確保を保証するものではありません。
再調整が困難な貴重なサンプルの場合などは、ご注意ください。(サンプルの補償・保険制度はありません。)
ご送付頂くサンプルが、ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てください。
ご提供頂くサンプルおよび本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
RNA抽出サービスは、抽出結果の如何に関わらず、3回目以降は作業実施回数分をご請求させていただきます。
サンプル送付について
弊社営業日は、土日祝日や年末年始などを除く、平日9時から18時までとなっておりますので、サンプルの弊社到着日にご注意ください。
QCシートをサンプルと同送してください。
弊社では、QCシートに基づき、作業を行います。
「解析PCRアレイ名」「PCRアレイCat.#」をQCシートにご記入ください。
かならず、ご記入漏れがない状態で、サンプルとを同送してください。
お送り頂くサンプルは、必ず所定量になる様調整してください。所定量と異なる場合、解析サービスを行えない場合がございますので、ご了承ください。
ご送付の際には、十分量のドライアイスを同梱し、冷凍宅急便をご指定の上、ご送付ください。
輸送時のトラブルに関しては、弊社ではその責任を負いかねます。
お送り頂いたサンプルは、ご返却いたしかねます。
実験後のサンプルにつきましては、弊社側にて破棄させて頂きますので、ご了承下さい。
お送り頂くサンプルを用いた、関連解析や再実験などをご依頼頂くご予定がある場合は、事前にお知らせ下さい。

 サンプル及びQCシートのご送付先


フィルジェン株式会社 受託解析部 1グループ 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389  E-mail biosupport@filgen.jp


価格


PCR Array 生物種 Cat.#
(メーカー
詳細情報
へのリンク)
数量 税別価格
miRNome(96well format)
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-216Z 2サンプル
*2サンプル単位での受注受付
¥2,970,000
Mouse MIMM-216Z ¥2,940,000
Rat MIRN-216Z ¥2,000,000
Dog MIFD-216Z ¥1,020,000
Rhesus Macaque MIQQ-218Z ¥1,470,000
miFinder
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-001Z 1サンプル
*2サンプル以上で受注受付
¥250,000
Mouse MIMM-001Z
Rat MIRN-001Z
Dog MIFD-001Z
Rhesus Macaque MIQQ-001Z
Pig MISS-001Z
Apoptosis
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-114Z
Mouse MIMM-114Z
Rat MIRN-114Z
Brain Cancer
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-108Z
Mouse MIMM-108Z
Rat MIRN-108Z
Breast Cancer
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-109Z
Mouse MIMM-109Z
Rat MIRN-109Z
Cancer PathwayFinder
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-102Z
Mouse MIMM-102Z
Rat MIRN-102Z
Cancer Stem Cells
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-118Z
Mouse MIMM-118Z
Rat MIRN-118Z
Cardiovascular Disease
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-113Z
Mouse MIMM-113Z
Rat MIRN-113Z
Dog MIFD-113Z
Rhesus Macaque MIQQ-113Z
Cell Development & Differentiation
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-103Z
Mouse MIMM-103Z
Rat MIRN-103Z
Diabetes
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-115Z
Mouse MIMM-115Z
Rat MIRN-115Z
Fibrosis
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-117Z
Mouse MIMM-117Z
Rat MIRN-117Z
Immunopathology
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-104Z
Mouse MIMM-104Z
Rat MIRN-104Z
Inflammatory Response and Autoimmunity
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-105Z
Mouse MIMM-105Z
Rat MIRN-105Z
Liver miFinder
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-116Z
Mouse MIMM-116Z
Rat MIRN-116Z
Neurological Development & Disease
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-107Z
Mouse MIMM-107Z
Rat MIRN-107Z
Ovarian Cancer
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-110Z
Mouse MIMM-110Z
Rat MIRN-110Z
Pain: Neuropathic & Inflammatory
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-120Z
Mouse MIMM-120Z
Rat MIRN-120Z
Prostate Cancer
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-112Z
Mouse MIMM-112Z
Rat MIRN-112Z
Serum & Plasma
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-106Z
Mouse MIMM-106Z
Rat MIRN-106Z
T-Cell & B-Cell Activation
miScript miRNA PCR Array受託解析サービス
Human MIHS-111Z
Mouse MIMM-111Z
Rat MIRN-111Z
 *上記価格には、PCRアレイキットの価格も含まれております。
 *アレイに搭載されている遺伝子群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。
  同一種類の特異的な遺伝子を搭載したプレートであっても、Cat.#やバージョンが異なるPCRアレイ間の解析結果を比較することはできません。過去の解析結果との比較をご検討される際には、ご注意ください。
 *複数回にまたがるアッセイ間や使用キットのロットが異なる場合、解析結果に差が生じる場合があります。


オプション
商品名 数量 税別価格 Cat.#
totalRNA抽出作業 1サンプル DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。


メーカーハンドブック


 ⇒QIAGEN社のハンドブック(PDF)


本ページは、SABiosciences社、QIAGEN社のHomepageの内容を一部引用しております。
お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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