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Home製品・サービス情報受託サービスリアルタイムPCR受託解析>miRCURY LNA miRNA Focus PCR Panels 受託解析

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 リアルタイムPCRアレイ

+ Taqman® Gene Expression Assays
+ Taqman® MicroRNA Assays
+ Taqman® SNP Genotyping Assays
+ TaqMan® Copy Number Assays
+ TaqMan® Array Gene Signature 96-Well Plate
+ RT2ProfilerTM PCR Array
+ RT2 lncRNA PCR Array
- miRCURY LNA miRNA Focus PCR Panels
+ qBiomarker Copy Number PCR Array
+ qBiomarker Somatic Mutation PCR Array
  
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リアルタイムPCR受託解析サービス<miRNA発現定量解析>
miRCURY LNA miRNA Focus PCR Panels 受託解析

微量サンプルをお送りいただければ、QIAGEN社製 miScript miRNA PCR Arrayシステムを用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。



概要


miRCURY LNA miRNA PCR システム(QIAGEN社製)によるmiRNAに特化した発現受託解析サービスです。
ユニバーサルRT反応の利点とLNA技術によるqPCRプライマーの感度および特異性とをバランスよく組み合わせたシステムです。血清や血漿などの低濃度のサンプルでも信頼性の高い結果が得られます。
microRNA(miRNA)は、様々な生物に存在するnoncodingRNA(約22nts)で、転写後遺伝子制御に関与しています。microRNAは、発生や分化・細胞シグナリング・感染応答を含む多くの生物学的なプロセスにおいて、重要な役割を果たしています。また、microRNA発現の調節異常が、がんを含むいくつかの疾病プロセスの原因あるいは指標であることも示唆されています。弊社では、QIAGEN社製のmicroRNA精製・定量および機能研究に必要なツールを用いた受託解析サービスを提供しています。
血清/血漿、がんまたはエキソソーム研究など、特定の領域用のパネルが用意されています。

リアルタイムPCR受託解析/パスウェイ遺伝子発現解析/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500


図1 miRCURY LNA miRNA PCR システムの概略図


miScript miRNA PCR Arrayのラインナップ


メーカーサイトより、メーカーの各PCR Array の詳細情報を閲覧することができます。ラインナップは更新されています。下記以外の製品についても、お問合せください。
PCR Array 生物種 サンプル数
/プレート
MTP type Cat.#
Apoptosis Human 1 96 YAHS-214Z
Mouse 1 96 YAMM-214Z
Breast Cancer Human 1 96 YAHS-209Z
Cancer Human 1 96 YAHS-102Y
Cancer PathwayFinder Mouse 1 96 YAMM-202Z
Cancer Stem Cells Human 1 96 YAHS-218Z
Cardiovascular Disease Human 1 96 YAHS-213Z
Mouse 1 96 YAMM-213Z
Cell Development & Differentiation Human 1 96 YAHS-203Z
CSF-Exosome Human 1 96 YAHS-124Y
Diabetes Mouse 1 96 YAMM-215Z
Rat 1 96 YARN-215Z
Fibrosis Human 1 96 YAHS-217Z
Immunopathology Human 1 96 YAHS-204Z
Mouse 1 96 YAMM-204Z
Rat 1 96 YARN-204Z
Inflammatory Response and Autoimmunity Human 1 96 YAHS-205Z
Mouse 1 96 YAMM-205Z
Rat 1 96 YARN-205Z
Liver miFinder Human 1 96 YAHS-216Z
Mouse 1 96 YAMM-216Z
miFinder Human 1 96 YAHS-201Z
Mouse 1 96 YAMM-201Z
Rat 1 96 YARN-201Z
Neurological
Development & Disease
Human 1 96 YAHS-207Z
Mouse 1 96 YAMM-207Z
Rat 1 96 YARN-207Z
Ovarian Cancer Human 1 96 YAHS-210Z
Pain: Neuropathic & Inflammatory Human 1 96 YAHS-220Z
Prostate Cancer Human 1 96 YAHS-212Z
Serum & Plasma Human 1 96 YAHS-106Y
Mouse 1 96 YAMM-206Z
T-Cell & B-Cell Activation Human 1 96 YAHS-211Z
Tumor Suppressor Human 1 96 YAHS-219Z
Urine-Exosome Human 1 96 YAHS-123YA


受託解析サービスの流れ


1.組織や細胞からのtotalRNA抽出
QCシートとともに、totalRNA、組織、細胞などをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付頂く場合は、当社にてtotalRNAを抽出致します。(オプション)。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/totalRNA抽出


2.サンプルの品質チェック及び濃度測定
totalRNAサンプルを、Agilent 2100バイオアナライザー及び分光高度計により、品質チェック及び濃度測定を行います。
サンプルが、品質チェックした結果、リアルタイムPCR実験に適さない場合には、下記のいずれかをご選択頂くことになります。

  ● サンプルの再送付
  ● 解析中止
解析を中止する場合は、totalRNA抽出作業料金をご請求させて頂きます。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/BioAnalyzerによるRNA検定


3.サンプルの調整

miRNAサンプルからcDNAを調整します。
miRCURY LNA RT Kit を使用し、miRCURY LNA Focus PCR Panel の各ウェルに分注します。

4.リアルタイムPCR反応


「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、リアルタイムRT-PCR反応を行います。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500


5.データ解析

QIAGEN社製データ解析テンプレート(英語表記のみ)を使用し、得られたCt値をスプレッドシートにコピー&ペーストすることで、ΔΔCt法により、発現のFold Changeを解析します。

サンプルQCチェック
リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/増幅曲線
増幅曲線

解析数値データ

スキャッタープロット

(解析データのご報告)

データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、PCRアレイキット入手及び、サンプル到着後、15~20営業日程度です。
*PCRアレイキット納期(通常3~4週間程度)・解析サンプル数・オプション作業の追加などにより、標準納期に加え、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/データCD



ご準備頂くサンプル

- ご送付量 状態
組織 50mg~100mg TRIzol®, Isogen®
5~30mg ペレット, RNAlater®
細胞 5×106~1×107 TRIzol®, Isogen®, ペレット, Buffer RLT
totalRNA 200ng以上(min.50ng) Nuclease-free Water
O.D.260/O.D.280=1.6以上(*1)
RIN推奨値 7.0以上, 25ng/μL程度
血液 2.5mL PAXgene® RNA採血管
*1 O.D.値は、bufferによって大きく値が変わります。
RNA抽出作業は、オプション(¥15,000(税別)/サンプル)となります。
組織・細胞・全血からのtotalRNA抽出は、抽出1回あたりのサンプル量です。
ご希望の解析内容に応じたプレートの種類やプレート数によっては、複数回になる場合があります。
複数回にまたがるアッセイ間や使用キットのロットが異なる場合、解析結果に差が生じる場合があります。

【ご使用頂くチューブ及びマーキングについて】

RNAをご送付頂く場合、1.5mLエッペンドルフ型チューブをご使用ください。
組織や細胞をご送付頂く場合、適当な大きさのチューブ類をご利用ください。
チューブには、蓋上面と本体サイド面の両方に、油性マジックでサンプル名(QCシート内のTubeラベル項目)をご記入ください。また、シールを貼る場合、剥がれにくいシールを使用してください。なお、シールを貼る前に、チューブ自身にもサンプル名を油性マジックなどで記入してください。(これは、万一シールが剥がれた場合、サンプルを特定するために必要となります。)

【totalRNAをご送付頂く場合のサンプルの準備・調整方法】

totalRNA調製は、miRNeasy Mini Kit(QIAGEN, Cat.#217004)をご使用頂くことを推奨しています。なお、TRIzolをご使用される場合は、含フェノール等を除くために、miRNeasyにてクリーンナップすることをお勧めします。
高品質なRNAを調整するため、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。
totalRNAは、必ずRNase‐free H2Oに溶解してください。界面活性剤・DEPC・高イオン強度(>10mM TE,>10mM NH4 Acetateなど)を含んだバッファを使用されますと、正確なQCチェックが行えなかったり、逆転写反応を阻害しますので、使用しないでください。

【注意事項】

サンプル準備について
サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、中身の漏れがないようにしてください。
サンプルの入ったチューブ(-80℃以下で凍結した状態)に油性マジックやシールなどでサンプル名が明記されていることを確認し、ビニールバックなどにいれ、砕いたドライアイスと共に梱包してください。(右図をご参照ください。)
解析に必要なRNA量が確保できない場合は、サンプルの再送をお願いすることがあります。
RNA抽出サービスは、リアルタイムPCR解析に必要なRNA量の確保を保証するものではありません。
再調整が困難な貴重なサンプルの場合などは、ご注意ください。(サンプルの補償・保険制度はありません。)
ご送付頂くサンプルが、ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てください。
ご提供頂くサンプルおよび本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
RNA抽出サービスは、抽出結果の如何に関わらず、3回目以降は作業実施回数分をご請求させていただきます。

サンプル送付について
弊社営業日は、土日祝日や年末年始などを除く、平日9時から18時までとなっておりますので、サンプルの弊社到着日にご注意ください。
QCシートをサンプルと同送してください。
弊社では、QCシートに基づき、作業を行います。
「解析PCRアレイ名」「PCRアレイCat.#」をQCシートにご記入ください。
かならず、ご記入漏れがない状態で、サンプルとを同送してください。
お送り頂くサンプルは、必ず所定量になる様調整してください。所定量と異なる場合、解析サービスを行えない場合がございますので、ご了承ください。
ご送付の際には、十分量のドライアイスを同梱し、冷凍宅急便をご指定の上、ご送付ください。
輸送時のトラブルに関しては、弊社ではその責任を負いかねます。
お送り頂いたサンプルは、ご返却いたしかねます。
実験後のサンプルにつきましては、弊社側にて破棄させて頂きますので、ご了承下さい。
お送り頂くサンプルを用いた、関連解析や再実験などをご依頼頂くご予定がある場合は、事前にお知らせ下さい。

【サンプル及びQCシートのご送付先】

フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389  E-mail biosupport@filgen.jp


価格


PCR Array 数量 税別価格 Cat.#
miRCURY LNA miRNA Focus
PCR Panels 受託解析
1プレート/サンプル
*4サンプル以上で受注受付
¥280,000/サンプル Cat.#F-QPCR-mi-
(プレートCat.#)-(プレート数)
上記価格には、PCRアレイキットの価格も含まれております。
アレイに搭載されている遺伝子群は、事前の予告無くバージョンアップされる場合があります。
同一種類の特異的な遺伝子を搭載したプレートであっても、Cat.#やバージョンが異なるPCRアレイ間の解析結果を比較することはできません。過去の解析結果との比較をご検討される際には、ご注意ください。

オプション
商品名 数量 税別価格 Cat.#
totalRNA抽出作業 1サンプル DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。


本ページは、QIAGEN社のHomepageの内容を一部引用しております。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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