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Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞リアルタイムPCR受託解析＞qBiomarker Somatic Mutation PCR Array

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リアルタイムPCRアレイ受託解析サービス＜体細胞DNA変異解析＞
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array 受託解析

微量サンプルをお送りいただければ、QIAGEN社製 qBiomarker Somatic Mutation PCR Array を用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。


概要


qBiomarker Somatic Mutation PCR Array による体細胞DNA変異解析を行う受託解析サービスです。qBiomarker Somatic Mutation PCR Array は、翻訳研究ツールで、生物学的パスウェイあるいは疾病に関連する重要な遺伝子の体細胞変異状態のプロファイリングを迅速かつ正確に行えます。変異は、臨床または機能的関連性および出現頻度に基づいて、広範な体細胞突然変異のデータベース（例；COSMIC）と査読済み科学文献から選択されています。

リアルタイムPCR受託解析/パスウェイ遺伝子発現解析/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500


特長


リアルタイムPCRは、DNA変異検出において、感度と信頼性が最も高い方法です。対立遺伝子特異的増幅と加水分解プローブ検出を組み合わせた qBiomarker Somatic Mutation real-time PCR assay は、野生型ゲノムDNAのバックグラウンドからわずか1％の体細胞突然変異を検出することが可能です。アレルの特異的な増幅は、PCRプライマーの3'末端でのマッチとミスマッチをTaqポリメラーゼにより判別する Amplification Refractory Mutation System (ARMS) テクノロジーをベースにしています。（図1. ARMSテクノロジーの原理）
 
図1． ARMSテクノロジーの原理


qBiomarker Somatic Mutation PCR Array のラインナップ


Product Catarogue No.
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for EGFR Pathway SMH-001AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for ErbB2 Pathway SMH-002AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for FLT3 Pathway SMH-003AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for PDGFR Pathway SMH-004AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human FGFR Pathway SMH-005AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human KIT Pathway SMH-006AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human c-MET Pathway SMH-007AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array
for Human Receptor Tyrosine Kinase(RTK) Pathways (Panel I)		 SMH-008AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array
for Human Receptor Tyrosine Kinase(RTK) Pathways (Panel II)		 SMH-009AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array
for Human APC/CTNNB1 (beta-catenin) Pathway		 SMH-010AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human p53/Rb Pathway SMH-011AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human RAS-RAF Pathway SMH-013AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human PI3K-AKT Signaling Pathway SMH-014AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Breast Cancer SMH-020AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Colon Cancer SMH-021AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Hematopoietic Neoplasms SMH-022AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Lung Cancer SMH-023AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Skin Cancers SMH-024AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Brain Cancers SMH-025AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Lymphoid Neoplasms SMH-026AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Soft Tissue Tumors SMH-027AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Thyroid Cancer SMH-028AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Melanoma SMH-029AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Bladder Cancer SMH-030AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Endometrial Cancer SMH-032AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Endometrial Cancer SMH-032BA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Kidney Cancer SMH-033CA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Liver Cancer SMH-034AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Pancreatic Cancer SMH-035AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Prostate Cancer SMH-036BA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Head & Neck Cancer SMH-037AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Esophageal Cancer SMH-038AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Ovarian Cancer SMH-039AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Gastric Cancer SMH-041AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Acute Myeloid Leukemia SMH-045AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human Myelodysplastic Syndromes SMH-046AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human APC Gene SMH-801AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human BRAF Gene SMH-802AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human CTNNB1 Gene SMH-803AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human EGFR Gene SMH-804AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human KIT Gene SMH-805AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human KRAS Gene SMH-806AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human PDGFR Gene SMH-807AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human PIK3CA Gene SMH-808AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human PTEN Gene SMH-809AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human RUNX1 Gene SMH-810AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human STK11 Gene SMH-811AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human TP53 Gene SMH-812AA
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array for Human DNA QC Pathway SMH-999AA


サンプルのご準備


- ご送付量 状態
組織 10～25mg ペレット
液体窒素凍結
細胞 1×106～5×106 ペレット
液体窒素凍結
血液 ＞8.5mL PAXgene DNA 採血管
全血 ＞200μL 冷凍 (-20℃以下) 
ゲノムDNA ＞3μg (min. 0.5μg)
＞40ng/μL 		 Nuclease-free Water
O.D.260/O.D.280=1.8～2.0
※DNA抽出（オプション）をご希望の場合は、「DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。

【サンプル発送に関する注意事項】
1． サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点（PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
2． （サンプル送付先）
フィルジェン株式会社　受託解析部　宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
Phone 052-624-4388　Fax 052-624-4389　E-mail biosupport@filgen.jp


解析の流れ


１．組織や細胞からのゲノムDNA抽出

QCシートとともに、ゲノムDNA、組織、細胞などをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付頂く場合は、当社にてゲノムDNAを抽出致します。（オプション）。

  

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/totalRNA抽出

２．サンプルの品質チェック及び濃度測定
 
ゲノムDNAサンプルを分光高度計により、濃度測定します。
NanoDropTM One
３．サンプルの調整

サンプルの調整を行います。

４．リアルタイムPCR反応

ご指定のqBiomarker Somatic Mutation PCR Array を用いて、「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、リアルタイムPCR反応を行います。

   リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/Applied Biosystems社製 ABI7500
ABI7500

５．データ解析

QIAGEN社製 データ解析テンプレート（英語表記のみ）を使用し、得られたCt値をスプレットシートにコピー＆ペーストすることで、コピー数が決定されます。

（解析データのご報告）
データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、PCRアレイキット入手及び、サンプル到着後、15～20営業日程度です。
＊PCRアレイキット納期（通常3～4週間程度）・解析サンプル数・オプション作業の追加などにより、標準納期に加え、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。

リアルタイムPCR受託解析/SuperArray社製 RT2 Profiler PCR Array/データCD


価格


商品名 数量 税別価格 Cat.#
qBiomarker Somatic Mutation PCR Array
受託解析		 1プレート
*2プレート以上で受注受付		 ￥225,000 Cat.#F-QPCR
-（プレートCat.#）-プレート数
　*上記価格には、PCRアレイキットの価格も含まれております。

オプション
商品名 数量 税別価格 Cat.#
ゲノムDNA抽出作業 1 「DNA・RNA抽出受託サービス」のページをご参照ください。

本ページは、QIAGEN社のHomepageの内容を一部引用しております。
お問い合わせ　受託解析部： biosupport@filgen.jp　P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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