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Home製品・サービス情報受託サービスリアルタイムPCR受託解析Taqman® SNP Genotyping Assays>解析の流れ

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リアルタイムPCR受託解析サービス
TaqMan® SNP Genotyping Assays 受託解析
概要・価格 / 解析の流れ / ご準備頂くサンプル / サンプル送付方法 / QCシート

微量サンプルをお送りいただければ、ご希望のプローブを用いて実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。


解析の流れ


1.ProbeとPrimerの準備

TaqMan
® SNP Genotyping Assays検索

解析ご希望のSNPマーカーにより、TaqMan® SNP Genotyping Assays から、probe & primer を選択します。
既製品がない場合には、primer & probe設計を行います。(Customとなります。)



(お客様)

解析ご希望のSNP ID No. (RefSNP) を、弊社「受託解析部 1グループ」までご連絡下さい。

Customの場合、TaqMan Probe設計箇所を含む前後500~1000塩基程度(計1000~2000塩基程度)の配列(テキスト形式)にてご用意ください。なお、設計に用いる塩基配列の間違いを防ぐため、遺伝子IDなどでは、お受けできかねますので、ご了承ください。
設計合成に4~5週間程度必要となります。なお、設計配列を事前(合成前)にご確認頂けません(合成完了後には確認できます)。設計が出来なかった場合、または設計ご依頼後のキャンセルにおいて、設計料として、40,000円(税別)をご請求させて頂きます。

(連絡先:biosupport@filgen.jp)

リアルタイムPCR受託解析/SNPジェノタイピング/Taqman Genomic Assays


2.GenomeDNAサンプルのお預かり / 組織や細胞からGenomeDNA抽出(オプション)

GenomeDNAサンプルをご送付頂きます。
組織や細胞をご送付いただく場合は、GenomeDNAを抽出します(オプション)。

リアルタイムPCR受託解析/SNPジェノタイピング/ゲノムDNA抽出


3.サンプルの濃度測定

分光光度計により、抽出サンプル濃度を測定します。電気泳動によるQCチェックは、基本的に行いませんので、ご了承ください。
*ゲノムDNAをご送付頂く場合は、電気泳動によるチェックは基本的に行ないません。

4.リアルタイムPCR反応

ご指定のサンプル・プライマー・プローブを用いて、「Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム」により、PCR反応を行います。反応は、「N=3」以上でご依頼いただくことをお勧めします。

リアルタイムPCR受託解析/SNPジェノタイピング/Applied Biosystems製 ABI7500
ABI7500


5.データ解析

Applied Biosystems 7500 リアルタイムPCRシステム付属ソフトウェアを用いて、PCRサイクル数「40」の測定結果を用いて、測定プレート毎に、Auto Callによる自動解析を行います。(解析ソフトウェアの設定上、複数のプレートにまたがる測定結果をまとめて解析することはできませんので、ご了承ください。)
アレルが決定できない場合は、さらにPCRサイクル数「10」を追加した測定結果により、自動解析を行います。その結果、アレルが決定できない場合、「アレル未決定」とさせていただきます。その場合でも通常価格をご請求させて頂きますので、予めご了承ください。

増幅曲線

数値データ

プロット
(クリックして拡大)

(解析データのご報告)
データ解析結果を、CD-ROMに収めて、ご報告いたします。
納期は、サンプルご送付後、15~20営業日程度です。
Customの場合は、Probeの設計合成に、4~5週間程、追加でお時間がかかります。
*サンプル数、オプション作業の追加などにより、標準納期より、お時間を頂戴する場合があります。詳しくは、担当までお問い合わせ下さい。



引用文献など
 本ページの内容は、Thermo Fisher Scientific社/applied biosystems の Homepage の一部を引用させて頂いております。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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