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質量分析サービス
タンパク質プロファイリングサービス

本サービスは、様々な種類の複雑なサンプルに含まれるタンパク質のプロファイリングを可能にしたサービスです。タンパク質をトリプシン消化し、取得されたペプチドを LC-MS/MS によって分析します。質量分析における分析時間を選択することが可能です。分析時間が長いほど同定されるタンパク質数は多くなり、それらのタンパク質配列のカバレッジが高くなります。これにより、複雑なサンプルに対しても品質の高いデータを取得することができ、信頼性の高いタンパク質プロファイリングを実施することが可能です。
本サービスは、各タンパク質の発現量ではなく、タンパク質の同定に重点を置いた解析となっています。



解析のワークフロー


1. サンプル調整: 還元/アルキル化、およびトリプシン消化
2. サンプルの分離と分析: LCおよびMS/MS(Nano LC-MS/MS解析)
NanoAcquity HPLC(Waters)システムと接続した Orbitrap Velos Pro (Thermo Fisher Scientific)を使用
3. データ解析:
Mascotを使用したタンパク質同定、Scaffoldソフトウェアを使用したタンパク質の視覚化および検証

【納品物】
・サンプル情報、作業内容、データの要約を含む解析レポート(PDF形式)
・定性および定量的なタンパク質同定データを含んだデータリスト(Excel形式)
・独自のデータマイニングが可能な Scaffold ファイル(sf3形式)
※Scaffold ファイルは、フリーソフトウェア「Scaffold Viewer」を用いて閲覧できます。


配列カバー率


ゲルの場合

溶液の場合


サンプル条件


サンプルタイプ 輸送温度 必要サンプル量
SDS-PAGEバンド
対象生物種をご指定ください。
4℃または-20℃ ゲルレーンを1cm角に切り分け、各ゲル片を別々のチューブに分けてご準備ください。
抽出タンパク質
対象生物種をご指定ください。
-20℃ 総タンパク質量 20μg 以上
ゲルからの場合は、切り分けた分画ごとに質量分析を実施いたしますので、溶液で質量分析を実施するケースよりも取得できるデータの信頼性は低くなる傾向があります。


【注意事項】
1. ゲルの場合
ゴム手袋を装着し、クリーン環境下で作業してください。ゲル切り出し後は、1.5ml マイクロチューブへ移し、100μL H2O に浸漬した状態でお送りください。銀染色の場合は、シルバーステインプラスキット(Bio-Rad)の使用は避けてください。
2. タンパク質溶液の場合
推奨される溶媒は、水または<50mMの揮発性塩(重炭酸アンモニウムなど)です。界面活性剤、グリセロールおよび不揮発性の塩の使用はできるだけ避けてください。
溶液のクリーンアップが必要な場合は、追加料金が発生する場合がありますので、あらかじめご了承ください。

【サンプル発送方法】


サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
QCシートおよび免責事項同意書」をご記入の上、サンプルと同封して弊社までお送り下さい。
弊社までのサンプル発送費用は、お客様負担となりますので、ご注意ください(荷受人負担での発送荷物は受け取り不可)。
ご提供頂いたサンプルにつきましては、海外での受託解析であるため、基本的にサンプルのご返却は行っておりませんので、予めご了承ください。

◆サンプル発送先◆ 
※土日祝祭日のサンプル受け取りは不可
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389


価格


本サービスでは、お客様のプロジェクトに合わせて解析時の分析時間をご提案させていただきます。分析時間は、1、5、10、20時間の4種類からお選び頂けます。分析時間を長くすることで、比例してタンパク質の同定数は多くなります。
サービス名 分析時間 税別価格 Cat.#
タンパク質プロファイリングサービス  1時間 お問合せ F-MSB05-[サンプル数]
5時間 F-MSB06-[サンプル数]
10時間 F-MSB07-[サンプル数]
20時間 F-MSB08-[サンプル数]
※本サービスは海外業務提携先で実施する解析のため、上記の解析料金のほか、サンプルの海外輸送費が別途発生いたします。


本ページは、MSBioworks社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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