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質量分析サービス
DIA 定量プロテオーム解析サービス

Data Independent Acquisition (DIA) は、複雑な混合物から迅速かつ高感度のタンパク質プロファイリングを可能にする新しい定量的プロテオミクス技術です。



サービス内容

1. サンプル調整: タンパク質抽出、トリプシン消化、および脱塩
2. サンプルの分離と分析: 気相分別ライブラリーの調製、UPLC-MS/MS 解析
Nanoflow UPLC システムと接続した Orbitrap Exploris 480 mass spectrometry (Thermo Fisher Scientific) を使用
3. データ解析: Scaffold DIA によるタンパク質同定と定量化、および Perseus による差分分析
4. レポート作成
【納品物】
 ・実験手順、機器パラメータなどを含む解析レポート(PDF形式)
 ・質量分析データ(Excel形式)


必要サンプル条件

◆タンパク質同定・発現早退定量の場合の1サンプル当たりの総タンパク質量
 推奨量:>150μg、最低量:>50μg、濃度:>1μg/μL

タンパク質抽出の際に使用するチューブによっては、PPまたはPEなど、チューブ材質由来のピークが検出され、ペプチドのイオン化を阻害し、データ解析に重大な影響を及ぼす可能性がありますので、ご注意ください。また、過剰にボルテックスなどをかけない様にご注意ください。
タンパク質に界面活性剤など(ポリマー)が多量に残留していると、ポリマーがサンプル由来のペプチドイオン化を阻害し、データ解析に重大な影響を及ぼす可能性がありますので、ご注意ください。
動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、またはお取り扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受入れが不能または拒否されたりする場合もございますので、事前にお問合せください。

組織・細胞からのタンパク質抽出、血清・血漿からのタンパク質精製・抽出につきましては、オプションとなっております。基本的には、解析費用内で実施可能ですが、作業内容によっては、追加費用が発生する場合がございますので、予めご了承ください。
詳細につきましては、生物種・サンプルの形態等含め、弊社までお問合せください。


分析タイプの違いについて


本サービスは、解析時の分析時間で3つのサービスタイプをご用意しております。
ご提供頂くサンプルの生物種や形態で同定できるタンパク質数は変動いたしますが、単純に分析時間を長くすれば、サンプル中に含まれる同定タンパク質数が増加します。
以下は、K562細胞から解析を行った場合の分析時間と断片化ペプチド、タンパク質の同定数の推移です。




価格

サービス名 分析タイプ 税別価格(1サンプル) Cat.#
DIA 定量プロテオーム解析サービス 30 min. LC-MS/MS ¥125,000 F-MSB-DIA01-[サンプル数]
60 min. LC-MS/MS ¥180,000 F-MSB-DIA02-[サンプル数]
90 min. LC-MS/MS ¥275,000 F-MSB-DIA03-[サンプル数]
本サービスでは、データ品質や統計的優位性を保つため、各グループの生物学的レプリケートを n=3 以上で構成していただくことを推奨いたします。
本サービスは、海外業務提携先で実施する解析のため、上記の解析料金の他、サンプルの海外輸送費が別途発生します。


ご注意事項(必ずご確認ください)

1.解析サービスに関して
本サービスの解析は、弊社の海外提携先(MS Bioworks社)にて実施されます。

2.サンプルの送付および取り扱いに関して
2.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバック等に入れてください。十分量の砕いたドライアイスとともに梱包してください。
2.2 サンプルは、なるべく休日を挟まない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料は、お客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
2.3 サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシート及び免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
2.4 解析元による抽出作業の結果、解析に必要な量が確保できないかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
2.5 オプションのタンパク質抽出をご依頼頂いた場合、ご送付頂く組織・細胞は、できるだけ新鮮なものをご用意ください。本抽出サービスでは、解析に必要な量の確保を保証するものではありません。解析に必要な量が確保できない場合、サンプルの再送をお願いする場合がございます。再調整が困難な貴重なサンプルの場合などは、ご注意ください。
2.6 タンパク質の場合は凍結状態にして、組織・細胞などの場合はペレット状態にして、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。
2.7 サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
2.8 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取り扱いできないことがあります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。
2.9 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
2.10 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
2.11 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題について、弊社は一切の責任を負わないものとします。

(サンプル、QCシートおよび免責事項同意書のご送付先
 フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
 〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
 Phone: 052-624-4388 Fax: 052-624-4389 E-mail: biosupport@filgen.jp  

3.キャンセルに関して
本サービスは、海外提携先(MS Bioworks社)での解析という性質上、サンプル受領後のキャンセルはお引き受け出来ません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。

4.納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から 90 日間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。


本ページは、MSBioworks社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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