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質量分析サービス
タンパク質配列マッピング解析サービス

タンパク質配列マッピング解析サービスは、LC/MS/MS分析において、3種の酵素(トリプシン、キモトリプシン、及び、エラスターゼ)を用いて、サンプル処理を行い、それぞれの酵素処理によるデータ及び3種のデータを合わせたデータによってペプチド同定とタンパク質配列決定を行います。このアプローチにより、タンパク質の同定効率を最大限に高めることができます。


タンパク質配列マッピング解析のワークフロー



GST-MAPK3の配列決定例


3つの酵素(トリプシン、キモトリプシン、エラスターゼ)からの解析データを組み合わせたデータ。配列カバー率100%。


使用機種




ご送付サンプルについて


サンプルタイプ 輸送温度 必要サンプル量
SDS-PAGEバンド
または、2Dゲルスポット

対象生物種をご指定ください。
4℃ ターゲットを含む3つのゲルバンドが必要
各バンドに≧500ngの標的タンパク質が含まれている必要があります。
ゲルバンドの大きさは、~1x5㎜
ゲルスポットの大きさは、~直径2㎜
組み換えタンパク質
または、精製タンパク質溶液

対象生物種をご指定ください。
-80℃ 標的タンパク質 15μg以上

【注意事項】

1.ゲルの場合
ゴム手袋を装着し、クリーン環境下で作業してください。ゲル切り出し後は、1.5mlマイクロチューブへ移し、100μl H2Oに浸漬した状態でお送りください。銀染色の場合は、シルバーステインプラスキット(Bio-Rad)の使用は避けてください。

2.タンパク質溶液の場合
推奨される溶媒は、水または<50mMの揮発性塩(重炭酸アンモニウムなど)です。界面活性剤、グリセロールおよび不揮発性の塩の使用はできるだけ避けてください。
溶液のクリーンアップが必要な場合は、追加料金が発生する場合がありますので、あらかじめご了承ください。

【サンプル発送方法】
サンプル発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
QCシートおよび免責事項同意書」をご記入の上、サンプルと同封して弊社までお送りください。
弊社までのサンプル発送費用は、お客様負担となりますので、ご注意ください(荷受人負担での発送荷物の受け取り不可)。
ご提供頂いたサンプルにつきましては、海外業務提携先で受託解析作業を実施するため、基本的にサンプルの返却は行っておりませんので、あらかじめご了承ください。

(サンプルの送付先) ※土日祝祭日のサンプルの受け取りは不可
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388  Fax 052-624-4389  E-mail biosupport@filgen.jp


価格/納期/納品データ


【価格】
サービス名 サンプルタイプ 数量 税別価格 Cat.#
タンパク質配列マッピング解析サービス ゲルまたは溶液 1サンプルから受注受付 ¥162,000/サンプル F-MSB03-[サンプル数]
※本サービスは、海外業務提携先で実施する解析サービスであるため、上記の解析料金の他、サンプルの海外輸送費が別途発生いたします。

【納期および納品データ】

納期: 約1~1.5ヶ月

納品データ: CDまたはDVDにより、解析データをご提供いたします。

・サンプル情報、作業内容、標的タンパク質について取得した配列カバレッジマップ、データの要約を含む解析レポート(PDF形式)
 サンプルレポートをご覧頂けます。→ダウンロード


・定性および定量的なタンパク質同定データを含んだデータリスト(excell形式)

・独自のデータマイニングが可能なScaffoldファイル(sf3形式)
 ※Scaffoldファイルは、フリーソフトウェア「Scaffold Viewer」を用いて閲覧できます。


本ページは、MSBioworks社のホームページに掲載されている情報を引用させて頂いております。

お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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