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General Metabolics社
超ハイスループット代謝物プロファイリング受託解析サービス


概要


本サービスは、フローインジェクション法により正確な質量と高分解能な質量分析を実現した超ハイスループットの非標識メタボロミクスです。複雑な生物学的マトリックスにおける代謝物を同定し、短時間なデータ取得と効率的なパイプラインを組み合わせることで、他のメタボロミクスのアプローチよりもサンプルスループットを 30 倍向上させることが可能です。そのため、1,000 サンプルを超える大規模なコホートの分析も短時間にデータ取得することが可能です。

フローインジェクション質量分析: ポンプによって連続的にイオン源に送液されている溶媒にインジェクターなどを用いて試料溶液を注入し、カラム等を用いたクロマトグラフィーは行わない状態で試料溶液をイオン源に導入して行う質量分析法。


解析内容

本サービスは、対象を絞らず非標的に広範な極性代謝物を検出し、同定する非標的メタボロミクスです。この代謝物プロファイリング法は全ての主要な代謝経路(アミノ酸代謝、エネルギー代謝、脂質代謝、ステロイド代謝、脂肪酸、アミノ糖および N-グリカン、ビタミンおよび補因子、イノシトールリン酸代謝)の代謝分子に加え、2-ヒドロキシグルタル酸やイタコン酸など代謝経路に通常割り当てられていないが、重要とされる代謝物もカバーしています。
カバレッジの一例として、血漿サンプルにおける解析では、心血管疾患、炎症、がんなどにおいて確立されているマーカーを含め 1,200 種類程度の代謝物のアノテーションが付けられます。


【本サービスの成果物について】

本サービスは、サンプルの前処理、品質チェック、FIA-QTOF-MS 分析からデータ視覚化までを全て実施するトータルサービスです。
ご要望の分析内容により取得するデータは変更される場合がございますが、以下の様な各種解析結果をご提供させていただきます。

プロジェクトレポート(html 形式):
サンプルQC、差分比較および統計(コホート/比較情報が提供されている場合)
各種データファイル(xlsx 形式):
実験概要、完全なデータマトリックス(精選されたデータ)、差分統計(コホート/比較情報が提供されている場合)
※MS1スペクトルの機器取得(Raw)ファイルは、ご要望に応じてご提供いたします。
メタボロミクスデータ用のインタラクティブなオンライン環境(ソフトウェア):
ボルケーノプロット生成、差分特性の強度プロット、パスウェイマッピングとパスウェイエンリッチメント、超ハイスループットデータに適した順序分析と回帰分析。



サンプル条件

以下は、解析に必要なサンプル量の目安です。ご提供頂くサンプルによって、解析に必要なサンプル量や条件が異なります。詳しくは、弊社までお問合せください。
なお、メタボローム解析用のサンプルは、できるたけ新鮮なサンプルをご準備頂くことを推奨いたします。また、代謝化合物の中には、揮発性の性質を持つ化合物もありますので、基本的に凍結乾燥サンプル等は推奨しておりません。また、代謝分子の安定性を保つため、4 ℃以上での保管は避けてください。サンプル採取後、-80 ℃で保存し、凍結・融解を繰り返すことはできるだけ避けてください。
サンプルタイプ 推奨量(目安)
血清・血漿 50μL 以上
細胞 20 万個(2x105 cells)以上
組織 20~50mg ※組織部位により、必要量が変わる場合があります。
その他 別途ご相談ください。

解析サンプルにつきましては、測定プラットフォームを一部自動化している関係上、以下の指定の 96well プレートおよびプレートシールを必ず使用してご送付ください。
指定品以外のプレートなどの場合は、対応できない可能性があります。

血清および血漿サンプル ・96well プレート:
 Abgene
TM 96Well 0.8mL Polypropylene Deepwell Storage Plate(Cat.# AB0859)
・プレートシール:
 Nunc
TM Seals, Tapes, and Foils(Cat.# 232698)
その他、一般的なサンプルタイプ
(抽出代謝物、組織、細胞など)
・Thermo ScientificTM Matrix 0.5mL ScrewTop Tubes in Barcoded Latch Racks(Cat.# 3744-BR)

本解析の 96well プレートでのご準備方法については、こちら(PDF)
これら以外でも、以下の指定品でご準備頂ければ、1.5mL μチューブでのご提出も可能です。ただし、マイクロチューブでご提出頂く場合は、取り扱いおよび作業手数料として、
サンプルあたり 3,000 円(税別)の追加費用が発生いたしますので、ご注意ください。
利用可能なマイクロチューブ: Invitrogen RNase-free Microfuge Tubes(Cat.# AM12400)
※上記以外の容器類をご使用される場合は、必ず事前にご相談ください。


ご注意事項(必ずご確認ください)

【サンプルのご提出方法およびお取り扱いについて】
サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。解析サンプルは十分量の砕いたドライアイスとともに梱包してお送りください。
サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、予めご注意ください。
サンプル送付の際は、受託解析サービス QC シート(弊社までお問合せください)および免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
本サービスは、海外業務提携先での解析となりますので、お送りいただいたサンプルのご返却はできません。貴重なサンプル等はあらかじめご注意ください。
サンプル、QCシートおよび免責事項同意書のご送付先
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
Tel:052-624-4388 Fax:052-624-4389
営業時間:9:00~18:00
※土日祝祭日および営業時間外のサンプル受け取りは不可

【解析サービスに関して】

サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れが起きない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。解析サンプルは十分量の砕いたドライアイスとともに梱包してお送りください。
サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いではお受け取りできませんので、予めご注意ください。
サンプル送付の際は、受託解析サービス QC シート(弊社までお問合せください)および免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
組織サンプルのご送付の際は、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍便にて弊社までご送付ください。解析に際し、必要量に満たないサンプル量だった場合は再送をお願いする場合がありますので、ご確認の上ご送付頂きます様お願いいたします。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
海外提携先へのサンプルの発送につきましては、弊社でも最新の注意を払って対応させて頂きますが、天災等の弊社における制御を超えた不可抗力に対しては責任を負いかねます。サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。また、動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、またはお取り扱いできない場合があります。こうしたサンプルは、弊社提携先にて受入れが不能、または拒否される場合がございますので、予めご了承ください。


価格

サービス名 数量 税別価格 型番
超ハイスループット代謝物プロファイリング
受託解析サービス
10 サンプル(抽出込)
小規模解析向け特別パック
¥550,000
(単価 ¥55,000)
F-GMT-UHMP10
1/2 プレート(48 サンプル) お問合せ -
1 プレート(96 サンプル) お問合せ -
基本的に 96well プレート単位で費用が設定されておりますが、検体数やプロジェクト内容で変動する場合があります。
上記解析費用の他、サンプルの海外輸送費が別途 「50,000円/回」 発生いたします。

【お問合せ】
受託解析部
Phone 052-624-4388

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