製品・サービス情報
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1Gb単位で必要なデータ量にて注文可能!
次世代シークエンシング(NGS)サービス
ゲノムリシークエンシング 受託解析サービス |
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フィルジェンでは、Novogene社との業務提携により、次世代シークエンシング(次世代シーケンシング/NGS)/ゲノムリシークエンシング受託解析サービスをご提供しております。
ワールドスタンダードとなった次世代シークエンス(NGS)データ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。 |
概要
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ゲノムリシークエンシング受託解析サービスでは、得られたリード配列を既知のゲノム配列にマッピングさせ、SNPや挿入・欠失、その他ゲノム配列の構造変化を調べるゲノムリシークエンシング解析に対応しています。 |
illumina HiSeq 2500/2000 |
illumina MiSeq |
サービスの仕様
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使用機種
(ライブラリー種類) |
illumina社 HiSeq X Ten
Paired-end reads 150bp |
保証データ量 |
・指定のデータ量(1-90Gb)で解析可能 |
作業内容 |
QCチェック、ライブラリー作製、シークエンス作業 |
納品データ(標準) |
FastQ file(fastq.gz) |
最低注文数 |
1サンプル |
納期(標準) |
約2ヶ月 |
* |
本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルをお送りする場合は、別途送料をご請求させて頂きます。 |
* |
電気泳動写真を必ず添付してください。 |
* |
RNase処理を行い、DNAの分解がされていないことを確認してください。 |
* |
DNase、RNaseフリーのスクリューキャップ式1.5mLチューブをご使用ください。 |
* |
ゲノムDNAは、凍結融解を出来る限り避け、4℃でTE bufferにて保存してください。長期保存の場合は、-20℃または、-80℃で保存してください。 |
* |
UVスペクトルベースの方法では、RNA、dsDNA、ssDNA、フリーの核酸などの多くの核酸も同時に検出するため、ゲノムDNAの測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 |
* |
サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 |
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必要サンプル量
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・ゲノムDNA: 1μg以上(2μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 20ng/μL以上
・O.D.260/280: 1.8-2.0
・Buffer: TE bufferまたはddH2O
(注意事項)
1. |
電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 50min. |
2. |
RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。 |
3. |
ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。 |
4. |
UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認することを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。 |
5. |
サンプル送付先および注意実行につきましては、「受託解析サービスの流れ」を参照してください。 |
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NGS Variant 解析サービス(オプション) 解析例(使用ソフトウェア:CLC Genomics Workbench)
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リファレンス配列にリード配列をマッピングし、SNPの存在する配列上の位置・変化した塩基の種類・変異領域をカバーするリード数、アミノ酸置換などをまとめたリストをエクセル形式で納品します。 |
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価格
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サービス内容 |
保証
データ量 |
数量 |
税別単価 *1 |
Cat.# |
Plant & Animal |
ゲノムリシークエンシング受託解析サービス
(HiSeq X Ten PE 150bp) |
1Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH1 |
2Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH2 |
3Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH3 |
4Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH4 |
5Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH5 |
6Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH6 |
7Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH7 |
8Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH8 |
9Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH9 |
10Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH10 |
20Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH20 |
30Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH30 |
40Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH40 |
50Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH50 |
60Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH60 |
70Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH70 |
80Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH80 |
90Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH90 |
110Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH110 |
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス
(HiSeq X Ten PE 150bp) |
110Gb |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-GH110X |
オプション データ解析 |
お問合せ |
- |
Bacteria |
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス |
ゲノムサイズ
の100× |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-BGH100× |
Hungal |
ゲノムリシークエンシング
+バイオインフォマティクス受託解析サービス |
ゲノムサイズ
の50× |
1サンプル |
お問合せ |
F-Novo-FGH50× |
* |
110Gb以上をご希望の場合は、別途お問合せください。 |
* |
本サービスでは、1サンプル分のQCチェック費用およびライブラリー作成費用が含まれています。マルチプレックスで解析をご希望の場合は、追加ライブラリー作成の価格が追加となります。 |
*1 |
海外へのサンプル輸送費用および納品用ハードディスク費用が別途必要です。 |
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