製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞PacBio ロングリード 受託解析 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス + 遺伝子パネル解析 ・ 全エクソームシークエンス ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + トランスクリプトミクス解析 ・ RNA-Seq + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ ChIP-Seq ・ ヒト全ゲノムメチル化 ・ smallRNA-Seq ・ lncRNA-Seq ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ MeRIP-Seq ・ DRIPc-Seq ・ eccDNA-Seq + ゲノミクス解析 ・ ヒト全ゲノムシークエンシング ・ ゲノムシークエンシング ・ PacBio ロングリード ・ ナノポアシークエンシング + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノム ・ 微生物ゲノムアンプリコン + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング(NGS)サービス PacBio（Revio/Sequel IIe） ロングリードシークエンス 受託解析サービス フィルジェンでは、各種 PacBio シークエンサー（Revio および Sequel IIe）を用いたロングリードシークエンス受託解析サービスをご提供しております。Novogene社との業務提携により、サービスを提供しております。 概要 Pacific Biosciences of California (PacBio)社の基盤技術 SMRT®（一分子リアルタイム）シークエンスは、PCR 増幅工程が不要で、GC 含有量に関わらず幅広いゲノム領域で均一なシークエンス結果を得ることができます。微生物などの新規ゲノム解析やコンティグ配列の整列などの解析に対応可能です。 特長 ◆ 長いリード長：数十キロベース長のリードにより、新規ゲノムのアセンブルや転写産物の全長配列情報が得られます。 ◆ 高いコンセンサス精度：系統誤差（規則的なエラー）のないシークエンシングにより、99.999％を超えるコンセンサス精度が達成されます。 ◆ 均一なカバレッジ：GC含量に左右されず、シークエンス全体にわたって均一なデータカバレッジを得ることができます。 ◆ 一分子の解像度：native DNA 分子からは、99.99％を超える高精度でロングリードシークエンスデータを得ることができます。 サービスの仕様 ご送付頂いたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）からシークエンスまで実施いたします。 オプションでバイオインフォマティクス解析もご提供しています。 ◆ヒト/動植物ゲノム解析 PacBio Revio DNA sequencing (Human/Plant/Animal) 内容 詳細 備考 PacBio HiFi ライブラリー調製 15K library - PacBio Revio Sequencing Cell で受付 1. HiFi リード限定。 2. 水棲生物/昆虫由来のサンプルの場合は事前にご相談ください。 3. メチル化サイトのデータは、5mC data (CpG モチーフの 5mC コール）のみ生成可能。 4. 1 セルで複数サンプル同時解析は可能ですが、事前にご相談ください。 バイオインフォマティクス解析 SV の検出 - SV+SNP+InDel の検出 - PacBio Sequel II/IIe DNA sequencing (Human/Plant/Animal) 内容 詳細 備考 PacBio HiFi library prep / sample 15K library - PacBio Sequel II/IIe CCS Sequencing Cell で受付 1. データ出⼒見込みは、ヒトのシークエンシングではセルあたり 25-32Gb HiFi リード、動植物のシークエンシングではセルあたり 20-25Gb HiFiリード。 ※海洋・水生関連種や昆虫種については、セルあたりのデータ出力量は保証できません。 2. CCSモードでは、デフォルトで5mCデータ（CpGモチーフの5mCコール）のみが生成可能です。 3. 複数のサンプルを1つのセルにプールする必要がある場合、1セルにプールできるのは同⼀症例から2-3サンプルまでです。別のお客様のサンプルを1つのセルにプールすることはありません。 サブリード生成 - CCS モードでは HiFi reads データのみを納品します。サブリード/サブリード＋HiFi リードが必要な場合は、別途有償にて対応いたしますので、お問合せください。 ◆微生物ゲノム解析 PacBio Sequel II/IIe DNA sequencing (Bacteria/fungal/Metagenomimcs) 内容 詳細 備考 CLR library prep / sample バクテリア/真菌用の 10K library；メタゲノミクス用ライブラリーはサンプルの質に依存します。 - PacBio Sequel II/IIe CLR Sequencing Gb 単位で受付 メタゲノミクスには 10Gb を推奨 バイオインフォマティクス解析 Bacteria / Fungi resequencing analysis リファレンスゲノムを用いたリシークエンス解析に対応。メタゲノム解析には対応していません。 PacBio Sequel II/IIe 細菌ゲノムコンプリートマップ解析/真菌ゲノムファインマップ解析 サービス名 内容 備考 Bacterial Genome Complete Map (de novo 解析) CLR ライブラリー調製、Sequel II/IIe シークエンス（100X Subreads)、De novo データ解析 - Fungal fine map (de novo 解析) - CLR モード CLR ライブラリー調製、シークエンス（200X subreads + 50X Illumina PE150）*、データ解析 *Xはゲノムサイズ（Mb) 1. De novo データ解析 2. ゲノムサイズ 20Mb 未満、20M～100Mb で価格が異なります。 Fungal fine map (de novo 解析) - CCS モード HiFi ライブラリー調製、シークエンス（100X Hifi reads + 50X Illumina PE150)*、データ解析 *Xはゲノムサイズ（Mb） 1. De novo データ解析 2. ゲノムサイズ 20Mb 未満、20M～100Mb で価格が異なります。 納品物 ・サンプルQCレポート ・リードデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申込み頂いた場合） ・プロジェクトレポート ※USBメモリ/HDD等の記録メディアにて納品いたします。 ※プロジェクトによって、納品物が変更される場合もあります。 サンプル条件 ◆ヒト/動植物ゲノム解析 プラットフォーム サンプル種類 サンプル量（Qubit®） 純度 PacBio Sequel II/IIe HMW Genomic DNA ≧30μg O.D.260/280=1.8-2.0 O.D.260/230=2.0-2.2 Fragments should be≧60Kb PacBio Revio HMW Genomic DNA ≧9μg O.D.260/280=1.8-2.0 O.D.260/230=2.0-2.2 Fragments should be≧30Kb ◆微生物ゲノム解析 プラットフォーム サンプル種類 サンプル量（Qubit®） 純度 PacBio Sequel II/IIe HMW Genomic DNA / Genomic DNA ≧10μg（濃度≧100ng/μL） O.D.260/280=1.8-2.0 no degradation, no contamination Illumina Genomic DNA ≧1μg 1. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。（スクリューキャップ式を推奨します。） 2. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 3. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 4. サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、あらかじめご了承ください。 価格・納期 【価格】 ◆ヒト/動植物ゲノム解析 PacBio Revio DNA sequencing (Human/Plant/Animal) サービス名 価格 型番 ヒト PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス お問合せ F-Novo-HPBR-(サンプル数)-SC(cell数) ヒト PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV） お問合せ F-Novo-HPBR-(サンプル数)-SC(cell数)＋D1 ヒト PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV+SNP+InDel） お問合せ F-Novo-HPBR-(サンプル数)-SC(cell数)＋D2 動植物 PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス お問合せ F-APPBR-(サンプル数)-SC(cell数) 動植物 PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV） お問合せ F-APPBR-(サンプル数)-SC(cell数)-D1 動植物 PacBio Revio DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV+SNP+InDel） お問合せ F-APPBR-(サンプル数)-SC(cell数)-D2 PacBio Revio DNA sequencing (Human/Plant/Animal) サービス名 価格 型番 ヒト PacBio Sequel II/IIe (CCS) DNA シークエンシング受託解析サービス お問合せ F-Novo-HPBS-(サンプル数)-SC(cell数) ヒト PacBio Sequel II/IIe (CCS) DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV) お問合せ F-Novo-HPBS-(サンプル数)-SC(cell数)-D1 ヒト PacBio Sequel II/IIe (CCS) DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV+SNP+InDel） お問合せ F-Novo-HPBS-(サンプル数)-SC(cell数)-D2 動植物 PacBio Sequel II/IIe (CCS) DNA シークエンシング受託解析サービス お問合せ F-Novo-APPBS-(サンプル数)-SC(cell数) 動植物 PacBio Sequel II/IIe (CCS) DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付（SV) お問合せ F-Novo-APPBS-(サンプル数)-SC(cell数)-D1 ◆微生物ゲノム解析 PacBio Sequel II/IIe DNA sequencing (Bacterial/fungal/Metagenomics) サービス名 価格 型番 微生物 PacBio Sequel II/IIe (CLR) DNA シークエンシング受託解析サービス お問合せ F-Novo-BFMPBS-(サンプル数)-(データ量)G 微生物 PacBio Sequel II/IIe (CLR) DNA シークエンシング受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付 お問合せ F-Novo-BFPBS-(サンプル数)-(データ量)G-D PacBio Sequel II/IIe 細菌ゲノムコンプリートマップ解析/真菌ゲノムファインマップ解析 サービス名 価格 型番 Bacterial Genome Complete Map 受託解析サービス お問合せ F-Novo-BGCM-(サンプル数)-D Fungal fine map (CLR) 受託解析サービス お問合せ F-Novo-FFFMclr-(サンプル数)-gs(ゲノムサイズ)M-D Fungal fine map (CCS) 受託解析サービス お問合せ F-Novo-FFFMccs-(サンプル数)-gs(ゲノムサイズ)M-D 【納期】 約2.5～3ヶ月 *1. 納期は、QCチェック合格後となります。 *2. 年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 納品物 * 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Novogene社）にて実施されます。 * 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。 * やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。 * サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 * ご提供いただいたサンプルの返却は、致しておりません。（サンプルは、解析終了後に破棄されます。） * 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去されます。 * サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。 　 お問い合わせ　受託解析部： biosupport@filgen.jp　P.052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2023 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.