製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報受託サービスDNAシークエンシング受託解析次世代シークエンシング(概要)>lncRNA-Seq 受託解析

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
次世代シークエンシング
+ 概要
+ 受託解析サービスの流れ
+ QCシート
対応アプリケーション
+ 遺伝子パネル解析
エクソームエンリッチメント
Disease Panels
カスタムターゲットエンリッチメント
+ トランスクリプトミクス解析
RNA-Seq
tRNA-Seq
受託解析サービス
tRF&tiRNA-Seq
受託解析サービス
+ エピゲノミクス解析
ChIP-Seq
ヒト全ゲノムメチル化
smallRNA-Seq
lncRNA-Seq
(h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter
+ ゲノミクス解析
ヒト全ゲノムシークエンシング
新規ゲノムシークエンシング
ゲノムリシークエンシング
PacBio RSⅡ ロングリード
+ メタゲノム解析
メタゲノム
微生物ゲノムアンプリコン
+ Hi-Cシークエンス解析
Proximo Hi-C Genome Scaffolding
ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
バイオインフォマティクス
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ

次世代シークエンシングサービス
lncRNA-Seq 受託解析サービス
フィルジェンでは、次世代シークエンス(次世代シーケンス)/lncRNA-Seq受託解析サービスをご提供しております。Novogene社との業務提携により、サービスをご提供しております。

概要


タンパク質をコードしない、200nts以上の長さのRNAを、long non-coding(lnc) RNAと呼びます。lncRNAは、哺乳動物系におけるX染色体不活性化、インプリンティング、多能性のメンテナンス、系列決定およびアポトーシスなどの細胞プロセスに重要な役割を果たしています。
lncRNAの発現解析は、治療に対する反応の予測、予後、疾病の診断のための新しいバイオマーカーとして有用です。


(Functions of LncRNAs)

(Classification of LncRNAs)


サービスの仕様

使用機種 illumina HiSeq4000
ライブラリー種類 PE150
保証データ量 10Gb, 20Gb
作業内容 サンプルQCチェック, ライブラリー作製, シークエンス作業, バイオインフォマティクス解析(オプション)
納品データ
(標準)
HDD/USB(NTFSフォーマット)にて、以下のデータを納品
・シークエンスデータ(.fastq)
・解析データ(.bam, .gff, .xls, .txt)
・解析レポート(.pdf, .html)
*解析データおよびレポートは、バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合に納品。
最低注文数 2サンプル
納期(標準) 約2ヶ月(バイオインフォマティクス解析付: 約2.5ヶ月)
* 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果やライブラリー作製などの問題で、再度サンプルをお送りする場合は別途送料(海外)をご請求させて頂きます。

データ解析パイプライン


必要サンプル量

(Animal)
・Total RNA: 2μg以上(4μg以上を強く推奨)
・容量: 20μg以上
・濃度: 50ng/uL以上
・RIN: 6.8以上(smooth base line)
・O.D.260/280: 1.7以上
・O.D.260/230: 1.8以上
・Buffer: RNase-free H2O

(Plant and Fungus)
・Total RNA: 2μg以上(4μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 50ng/μL以上
・RIN: 6.3以上(smooth base line)
・O.D.260/280: 1.7以上
・O.D.260/230: 1.8以上
・Buffer: RNase-free H2O
1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 0.5% TBE solution; 180V for 16 min.
2. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
3. TotalRNAは、RNase-free H2Oに溶解し、-80℃で保存してください。
4. DNase処理を行うことを強く推奨します。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いRNAを準備してください。
6. スピンカラムにより、Total RNA抽出や精製をすると、microRNAやsmallRNAが除去される可能性がありますので、使用するキットの仕様を必ず確認してください。
7. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

illumina HiSeq 4000

標準データ解析例


標準データ解析レポート(HTML形式のレポート)には、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、lncRNAのフィルタリング、lncRNA発現解析、lncRNAターゲット予測、lncRNA標的遺伝子の機能分析などの結果がまとめられています。



価格

サービス内容 数量 税別単価 1) Cat.#
lncRNA-Seq受託解析サービス
lncRNA-Seq 受託解析サービス 10Gb
(raw data)
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-LRS10-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
lncRNA-Seq受託解析サービス(標準データ解析付き)
lncRNA-Seq 受託解析サービス 10Gb
標準データ解析付
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-LRS10D-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
* 10Gb以上をご希望の場合は、別途お問合せください。
1) 海外へのサンプル輸送費用およびハードディスク費用が別途必要です。

 
お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
Copyright (C) 2004-2018 Filgen, Inc. All Rights Reserved.