製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞RNA-Seq 受託解析 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ 全エクソームシークエンス ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ RNA-Seq + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ ChIP-Seq ・ ヒト全ゲノムメチル化 ・ smallRNA-Seq ・ lncRNA-Seq ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq + ゲノミクス解析 ・ ヒト全ゲノムシークエンシング ・ ゲノムシークエンシング ・ PacBio ロングリード ・ ナノポアシークエンシング + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノム ・ 微生物ゲノムアンプリコン + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング(NGS)サービス RNA-Seq 受託解析サービス   フィルジェンでは、Novogene社との業務提携による次世代シークエンシング（次世代シーケンシング/NGS）/RNA-Seq受託解析サービスをご提供しております。 概要 RNA-Seqは、細胞内に含まれるmRNA分子を網羅的かつ定量的に解析します。転写産物のリード数から遺伝子発現量を定量化し、同時にその配列情報から、選択的スプライシングや新規転写産物、融合遺伝子の検出を行う技術です。Novogene社のRNA-Seq受託解析サービスは、安価な価格と充実したバイオインフォマティクス解析が特徴です。解析対象となる生物種からご希望のデータ量を選択することができます。 特長 ◆次世代シークエンステクノロジーによる網羅的なmRNAのシークエンス ◆真核生物用と原核生物用をご用意しています。 ◆様々なバイオインフォマティクス解析もご用意しています。（有償オプション） サービス内容 ご送付頂いたRNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。バイオインフォマティクス解析は、提携先であるNovogene社が用意する解析パッケージ、又は弊社の提供するデータマイニングサービスからお選び頂けます。 【シークエンスプラットフォーム】 illumina NovaSeq X Plus / NovaSeq 6000, PE150 【シークエンス量】 ・真核生物：　3Gb, 6Gb, 9Gb, 12Gb raw data/sample ・原核生物：　1.2Gb, 2.4Gb, raw data/sample *QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 *保証量は、お申し込みいただいたシークエンス量の98％となります。 *シークエンス量は、1Gb単位で調整可能です。 illumina NovaSeq X Plus 【作業内容】 1.　サンプルQCチェック 2.　mRNA濃縮 3.　ライブラリー作製 4.　シークエンス作製 5.　バイオインフォマティクス解析（有償オプション） *真核生物用では、Oligo(dT) beads, 原核生物用では、rRNA除去によりmRNAを濃縮いたします。 *真核生物用のライブラリータイプは、non-directional となりますが、starand-specific タイプにも対応いたします（別途有償）。 【バイオインフォマティクス解析】 <解析パッケージ> 真核生物では、定量化パッケージとトランスクリプトームパッケージの2種類をご用意しております。また、リファレンスデータが利用できない真核生物にも対応いたします（De Novo）。原核生物用のバイオインフォマティクス解析については、お問合せください。 真核生物（with Reference） 真核生物（De Novo） 定量化パッケージでは、図の青色の項目の解析が実施され、トランスクリプトームパッケージでは、さらに緑色の項目の解析も実施されます。真核生物（with Reference）について、生物種がヒト又はマウスの場合は、Fusion Gene Analysisが、それ以外の生物種の場合は、Novel Gene Predictionが実施されます。 　*解析によっては、2グループ以上や生物学的リプリケートが必要となります。 　*各パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 <解析データ例> Gene Expression Levels Differentially Expressed Genes(DEGs) Analysis Volcano plot for DEGｓ Cluster analysis of DEGs ご希望される方には、トランスクリプトームパッケージのデモレポートをお送りしておりますので、ご連絡をください（biosupport@filgen.jp）。 <データマイニングサービス> 「データマイニングサービス」のページをご参照ください。 納品物 ・サンプルQCレポート ・FASTQ形式のシークエンスデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合） ・プロジェクトレポート *USB等の記録メディアにて納品いたします。 *プロジェクトによって、納品物が変更される場合もあります。 サンプル条件 RNA-Seqタイプ サンプルタイプ Amount 液量 濃度 RIN（Agilent2100） 純度 （NanoDropTM） 真核生物用 （non-directional library） Total RNA (Animal) ≧1μg ≧20μL ≧50ng/μL ≧6.8 smooth base line O.D.260/280：≧2.0 O.D.260/230：≧2.0 no degradation no contamination Total RNA （Plant and Fungus） ≧1μg ≧20μL ≧50ng/μL ≧6.3 smooth base line 真核生物用 （strand-specific library） Total RNA (Animal) ≧2μg ≧20μL ≧50ng/μL ≧6.8 smooth base line Total RNA （Plant and Fungus） ≧2μg ≧20μL ≧50ng/μL ≧6.3 smooth base line 原核生物用 Total RNA ≧3μg ≧20μL ≧50ng/μL ≧6.0 smooth base line 1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。 *泳動条件は、次を推奨します 1.0% agarose gel; 0.5%xTBE solution; 180V 16 min. 2. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。（スクリューキャップ式を推奨します。） 3. TotalRNAは、RNase-free H2Oに溶解し、-80℃で保存してください。 4. DNase処理を行うことを強く推奨します。 5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 *UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いRNAを準備してください。 6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 7. サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、あらかじめご了承ください。 価格・納期 【価格】 サービス名 サンプル数 税別単価 1) Cat.# 真核生物 RNA-Seq 受託解析サービス 3Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE3-（サンプル数）  RNA-Seq 受託解析サービス 6Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE6-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 9Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE9-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 12Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE12-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 3Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE3D-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 6Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付   1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE6D-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 9Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付   1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE9D-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 12Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付   1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqE12D-（サンプル数） 原核生物 RNA-Seq 受託解析サービス 1.2Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqP1-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 2.4Gb raw data/sample 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqP2-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 1.2Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付   1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqP1D-（サンプル数） RNA-Seq 受託解析サービス 2.4Gb raw data/sample バイオインフォマティクス解析付   1サンプル以上 お問合せ F-Novo-RseqP2D-（サンプル数） 1)海外へのサンプル輸送費用およびHDD/USB費用が別途必要です。 *上記の真核生物用RNA-SeqのCat.＃は、ライブラリータイプがnon-directionalの場合となります。 【納期】 約1.5ヶ月（バイオインフォマティクス解析付：約2～2.5ヶ月） *納期は、QCチェック合格後となります。 *年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 ご注意事項 * 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Novogene社）にて実施されます。 * 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。 * やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。 * サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 * ご提供いただいたサンプルの返却は、致しておりません（サンプルは、解析終了後に破棄されます）。 * 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 * サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受け入れが不能又は拒否されたりする場合があります。 　 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2024 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.