製品情報・受託サービス情報
What's New! 製品・サービス情報 ダウンロード e-mail_news登録   
会社情報
概要 ミッション アクセス リクルート 連絡先 ビジネスパートナー ライセンス 個人情報保護方針
Home製品・サービス情報受託サービスDNAシークエンシング受託解析次世代シークエンシング(概要)>メタゲノム受託解析

製品・サービス情報
  
受託サービス
サービス別ラインナップ
次世代シークエンシング
+ 概要
+ 受託解析サービスの流れ
+ QCシート
+ データマイニングサービス

対応アプリケーション

+ 遺伝子パネル解析
エクソームエンリッチメント
Disease Panels
カスタムターゲットエンリッチメント
リキッドバイオプシー用
OptiSeq がんパネル解析サービス
+ トランスクリプトミクス解析
RNA-Seq
tRNA-Seq
受託解析サービス
tRF&tiRNA-Seq
受託解析サービス
+ エピゲノミクス解析
ChIP-Seq
ヒト全ゲノムメチル化
smallRNA-Seq
lncRNA-Seq
(h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter
+ ゲノミクス解析
ヒト全ゲノムシークエンシング
ゲノムシークエンシング
PacBio RSⅡ ロングリード
+ メタゲノム解析
メタゲノム
微生物ゲノムアンプリコン
+ Hi-Cシークエンス解析
Proximo Hi-C Genome Scaffolding
ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution
  
科学機器
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
試薬・材料・消耗品
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ
  
バイオインフォマティクス
ソフトウェア
製品別ラインナップ
メーカー別ラインナップ


次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス
メタゲノム 受託解析サービス

フィルジェンでは、メタゲノム受託解析サービスをご提供しております。Novogene社との業務提携により、サービスをご提供しております。


概要


メタゲノム解析は、環境中の微生物のゲノムDNAをすべて抽出・収集し、これらの全ゲノムを網羅的にシークエンス(シーケンス)します。得られた配列データをリファレンス配列と相同性検索をすることで、菌種の帰属や菌種組成、挿入、欠失などの情報が得られます。また、機能遺伝子のデータベースに対して、相同性検索を行うことで、その細菌嚢がどの様な機能遺伝子をもっているかの情報も得ることができます。


受託解析サービスのワークフロー



必要サンプル量

・ゲノムDNA: 800ng以上(1.6μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 50ng/uL以上
・O.D.260/280: 1.8-2.0
・Buffer: TE BufferまたはddH2O

1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min.
2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

illumina HiSeq 4000


標準データ解析例


標準データ解析レポート(HTML形式のレポート)には、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、アライメント結果、メチル化シトシンの同定、メチル化レベル、DMR解析などの結果がまとめられています。



価格


サービス内容 数量 税別単価 1) Cat.#
メタゲノム受託解析サービス
(6Gb) 標準データ解析付
  
1-4サンプル お問合せ F-Novo-MG6D-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
メタゲノム受託解析サービス
(12Gb) 標準データ解析付
  
1-4サンプル お問合せ F-Novo-MG12D-(サンプル数) 
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
 1)海外へのサンプル輸送費用およびハードディスク費用が別途必要です。

 
お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
Copyright (C) 2004-2019 Filgen, Inc. All Rights Reserved.