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Home製品・サービス情報受託サービス次世代シークエンシング(概要)>Proximo(TM)Hi-Cゲノムスキャフォールディング受託解析サービス

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ProximoTM Hi-C シークエンス受託解析サービス

Phase Genomics社のProximo
TM Hi-C シークエンス受託解析サービスでは、Phase Genomics 社 Proximo Hi-C キットを用いたライブラリー調製およびシークエンシングを行います。Proximo キットは、サンプルの種類に合わせてカスタマイズされた試薬が含まれており、より確実な解析結果をもたらします。最適化された 5 種類のキット(ヒト、動物、植物、真菌、微生物)によって、あらゆる生物種に対して確かな結果を提供します。



特長

サンプル種類に特化した試薬
高分子DNAの抽出が不要
高品質で長距離のシークエンスデータ
ショートリード対応: illumina または Element シークエンシング対応のライブラリー調製(※受託サービスではイルミナシークエンサーにてデータ取得を行います。)
1 キットあたり使いやすい 2 パック


解析の流れ

組織サンプルから FASTQ ファイル取得までのサービスです。

サンプルからシークエンスまでの Proximo ワークフロー

受託サービスの他、Proximo Hi-C kit をご購入頂くことも可能です。
近接ライゲーションライブラリー調製は、ワークフローの中でも特殊な部分です。Phase Genomics 社の Proximo Hi-C ライブラリー調製キットは、高分子量(HMW)DNA の抽出を必要としない、効率的なプロトコルを提供します。
8 ステップのライブラリー調製ワークフローは、下記の通りです。


Proximo Hi-C ライブラリー調製ワークフロー

本キットは、デュアルインデックスの近接ライゲーションライブラリーを生成し、Illumina または Element シークエンサーにてシークエンス可能です(受託サービスでは、Illumina シークエンサーでデータ取得を行います)。本ライブラリーは、約 5,000 万~1 億のペアエンドリード取得を必要とします。

なお、Hi-C ゲノムスキャフォールディング解析においては、全ゲノムシークエンスによるドラフトアセンブリデータが必要となりますこと、ご注意ください。
※本サービスには、ゲノムスキャフォールディング解析は含まれておりません。


ご提供いただくサンプルおよび情報

●Draft assembly(FASTA形式): Hi-C ライブラリーQCチェック用
●固定済みサンプル
 例)植物の葉:0.5g、動物組織:0.5g、培養細胞:108個、血液細胞:250μL
 *組織サンプルを送付いただく場合、生物種によっては輸出・輸入制限のある場合がありますこと、予めご了承ください。


価格

サービス内容 数量 税別単価 Cat.#
ProximoTM Hi-C シークエンス受託解析サービス 1サンプル お問合せ お問合せ


ご注意事項

【解析サービスに関して】
本サービスは、弊社の海外提携先(Phase Genomics社)にて解析を実施いたします。
お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティレベル2)までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル(HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お受けできませんので、ご了承ください。
ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
ご提供頂くサンプル及び本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では、一切の責を負いかねます。
本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果等の問題でサンプルを再送する場合は、別途送料をご請求させて頂きます。
本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。

【サンプルの送付および取り扱いに関して】
サンプル発送は、必ず「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。
送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。
サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバック等に入れて、砕いたドライアイスとともに梱包してください。
QCシートおよび免責事項同意書をご記入の上、サンプルと同封してご送付ください。これらのシートが同封されていない場合、またはご記入漏れがある場合、解析サービスの着手が遅れる場合がございますのでご注意ください。
新鮮サンプルの場合、上記必要量のペレットを液体窒素凍結後、-80℃保存し、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。
本サービスは、海外での解析となりますので、お送り頂いたサンプルのご返却はできません。貴重なサンプル等はあらかじめご注意ください。

◆サンプル送付先 
※土日祝祭日および営業時間外のサンプル受け取りは不可
フィルジェン株式会社 受託解析部 宛
〒459-8011 愛知県名古屋市緑区定納山一丁目1409番地
Phone 052-624-4388 Fax 052-624-4389
営業時間: 9:00~18:00


本ページは、Phase Genomics 社のウェブサイトに掲載されている情報や画像を一部引用しています。
【お問合せ】
受託解析部
Phone 052-624-4388

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