製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞エクソームエンリッチメント受託解析 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ 全エクソームシークエンス ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ RNA-Seq + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ ChIP-Seq ・ ヒト全ゲノムメチル化 ・ smallRNA-Seq ・ lncRNA-Seq ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq + ゲノミクス解析 ・ ヒト全ゲノムシークエンシング ・ ゲノムシークエンシング ・ PacBio ロングリード ・ ナノポアシークエンシング + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノム ・ 微生物ゲノムアンプリコン + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング（NGS)受託解析サービス 全エクソームシークエンス受託解析サービス フィルジェンでは、Novogene社と業務提携し、次世代シークエンスサービス（次世代シーケンスサービス/NGS）/Agilent社SureSelectを用いたエクソームエンリッチメント受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench（QIAGEN社/CLC bio）”も販売しています。 概要 全エクソームエンリッチメント解析（全エクソームシークエンス解析）では、ゲノム上のタンパク質コード領域をシークエンスします。このため、全ゲノムシークエンスの代替となる、費用対効果の高い解析法となっています。例えば、ヒト疾患と関連する遺伝子変異の多くが、タンパク質コード領域に見出されています。本サービスでは、Agilent社のSureSelectキットとillumina社のシークエンスプラットフォームを組み合わせることにより、全エクソームをシークエンスします。 特長 ・ Agilent SureSelect キットを使用 ・ ヒト、マウスにも対応 ・ 有償オプションとしてバイオインフォマティクス解析も提供 サービス内容 ご送付いただいたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）からシークエンス作業まで実施します。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。バイオインフォマティクス解析は、提携先が用意する解析パッケージ、又は弊社の提供するデータマイニングサービスからお選びいただけます。 【シークエンスプラットフォーム】 illumina NovaSeq 6000, PE150 【エクソームエンリッチメント】 ・SureSelect Human All Exon V6 ・SureSelect Human All Exon V6+UTR ・SureSelect Mouse All Exon 【シークエンス量】 ・6Gb, 12Gb raw data/sample ※ QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 ※ 保証量は、お申込みいただいたシークエンス量の98％となります。 ※ 上記データ量の他にも、シークエンス量は1Gb単位で調整可能です。 【作業内容】 1.サンプルQCチェック 2.エクソームキャプチャ＆ライブラリー作製 3.シークエンス作業 4.バイオインフォマティクス解析（有償オプション） 【バイオインフォマティクス解析】 ＜解析パッケージ＞ マッピング、変異検出、検出された変異へのアノテーションの各解析をまとめたパッケージをご用意しています。 全エクソームシークエンス ヒトサンプルで同一個体由来のTumor-Normalペアサンプルの場合、somatic mutationの検出及びアノテーションも実施いたします。 ヒトサンプルの場合、さらなるオプション解析として、Advanced解析（Cancer, Monogenic disorder, Complex/Multifactorial disorder）も用意しております。 ※パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 ＜解析データ例＞ Annotation Results of detected variants(a bridged). 解析例は、ヒト全エクソームシークエンス解析を示しています。 ご希望される方には、ヒト全エクソームシークエンス解析のデモレポートをお送りしておりますので、ご連絡ください。（biosupport@filgen.jp) 納品物 ・サンプルQCレポート ・FASTQ形式のシークエンスデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合） ・プロジェクトレポート ※USB等の記録メディアにて納品いたします。 ※プロジェクトによっては、納品物が変更される場合もあります。 サンプル条件 サンプルタイプ Amount(Qubit) 液量 濃度 純度（NanoDrop） 推奨量 最少量 ゲノムDNA ≧2μg ≧1μg ≧20μL ≧20ng/μL O.D.260/280：1.8-2.0 no degradation or RNA contamination FFPE DNA - ≧0.8μg - - Fragments should be longer than 1500bp 1. 電気泳動写真を添付してください。 ※泳動条件は、次を推奨します。：1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40min. 2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。 3. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブをご使用ください。（スクリューキャップ式を推奨します。） 4. DNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE Bufferにて保存してください。 ※長期保存の場合は、-20℃又は、-80℃で保存してください。 5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、DNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 *UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。 6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 7. サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、予めご了承ください。 8. FFPE由来DNAの場合は、条件が異なりますので、お問合せください。 価格・納期 【価格】 サービス名 保証データ量/サンプル 数量 税別単価 Cat.# ヒト全エクソーム受託解析サービス SureSelect Human All Exon V6 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoH6-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoH12-（サンプル数） ヒト全エクソーム受託解析サービス SureSelect Human All Exon V6＋UTR 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoUH6-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoUH12-（サンプル数） マウス全エクソーム受託解析サービス SureSelect Mouse All Exon 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoM6-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoM12-（サンプル数） ヒト全エクソーム受託解析サービス SureSelect Human All Exon V6 バイオインフォマティクス解析付 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoH6D-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoH12D-（サンプル数） ヒト全エクソーム受託解析サービス SureSelect Human All Exon V6＋UTR バイオインフォマティクス解析付 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoUH6D-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoUH12D-（サンプル数） マウス全エクソーム受託解析サービス SureSelect Mouse All Exon バイオインフォマティクス解析付 6Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoM6D-（サンプル数） 12Gb raw data 1サンプル以上 お問合せ F-Novo-ExoM12D-（サンプル数） ※ FFPE由来DNAサンプルの場合は、お問合せください。 【納期】 約1.5ヶ月間（バイオインフォマティクス解析付：約2～2.5ヶ月間） ※納期は、QCチェック合格後の日数です。 ※年末年始、夏季休業、祝日、解析状況等により、上記より日数を頂く場合がございます事、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 注意事項 ・ 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Novogene社）にて実施されます。 ・ 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。 ・ やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求させて頂きます。 ・ サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 ・ ご提供頂いたサンプルの返却は、致しておりません（サンプルは解析終了後に破棄されます）。 ・ 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 ・ サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2024 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.