製品・サービス情報
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※フィルジェン株式会社 設立20周辺記念
次世代シークエンス受託解析キャンペーン実施中！
キャンペーン期間：2025/1/31まで ⇒キャンペーンちらし（PDF） |
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次世代シークエンシング（NGS)受託解析サービス
全エクソームシークエンス受託解析サービス |
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フィルジェンでは、Novogene社/Biomarker Technologies(BMKGENE)社と業務提携し、次世代シークエンスサービス（次世代シーケンスサービス/NGS）/Agilent社SureSelectを用いたエクソームエンリッチメント受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC
Genomics Workbench（QIAGEN社/CLC bio）”も販売しています。
 概要
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全エクソームエンリッチメント解析（全エクソームシークエンス解析）では、ゲノム上のタンパク質コード領域をシークエンスします。このため、全ゲノムシークエンスの代替となる、費用対効果の高い解析法となっています。例えば、ヒト疾患と関連する遺伝子変異の多くが、タンパク質コード領域に見出されています。本サービスでは、Agilent社のSureSelectキットとillumina社のシークエンスプラットフォームを組み合わせることにより、全エクソームをシークエンスします。 |
 特長
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Agilent SureSelect キットを使用 |
| ・ |
ヒト、マウスにも対応 |
| ・ |
有償オプションとしてバイオインフォマティクス解析も提供 |
 サービス内容
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ご送付いただいたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）からシークエンス作業まで実施します。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。バイオインフォマティクス解析は、提携先が用意する解析パッケージ、又は弊社の提供するデータマイニングサービスからお選びいただけます。
【シークエンスプラットフォーム】
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illumina NovaSeq 6000, PE150 |
【エクソームエンリッチメント】
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・SureSelect Human All Exon V6
・SureSelect Human All Exon V6+UTR
・SureSelect Mouse All Exon |
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【シークエンス量】
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・6Gb, 12Gb raw data/sample
| ※ |
QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 |
| ※ |
保証量は、お申込みいただいたシークエンス量の98％となります。 |
| ※ |
上記データ量の他にも、シークエンス量は1Gb単位で調整可能です。 |
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【作業内容】
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1.サンプルQCチェック
2.エクソームキャプチャ＆ライブラリー作製
3.シークエンス作業
4.バイオインフォマティクス解析（有償オプション） |
【バイオインフォマティクス解析】
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＜解析パッケージ＞
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マッピング、変異検出、検出された変異へのアノテーションの各解析をまとめたパッケージをご用意しています。
| 全エクソームシークエンス |
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ヒトサンプルで同一個体由来のTumor-Normalペアサンプルの場合、somatic mutationの検出及びアノテーションも実施いたします。
ヒトサンプルの場合、さらなるオプション解析として、Advanced解析（Cancer, Monogenic disorder, Complex/Multifactorial
disorder）も用意しております。
※パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 |
＜解析データ例＞
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Annotation Results of detected variants(a bridged).
解析例は、ヒト全エクソームシークエンス解析を示しています。
ご希望される方には、ヒト全エクソームシークエンス解析のデモレポートをお送りしておりますので、ご連絡ください。（biosupport@filgen.jp) |
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 納品物
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・サンプルQCレポート
・FASTQ形式のシークエンスデータ
・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合）
・プロジェクトレポート
※USB等の記録メディアにて納品いたします。
※プロジェクトによっては、納品物が変更される場合もあります。 |
サンプル条件
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| サンプルタイプ |
Amount(Qubit) |
液量 |
濃度 |
純度（NanoDrop） |
| 推奨量 |
最少量 |
| ゲノムDNA |
≧2μg |
≧1μg |
≧20μL |
≧20ng/μL |
O.D.260/280：1.8-2.0
no degradation or RNA contamination |
| FFPE DNA |
- |
≧0.8μg |
- |
- |
Fragments should be longer than 1500bp |
| 1. |
電気泳動写真を添付してください。
※泳動条件は、次を推奨します。：1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40min. |
| 2. |
RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。 |
| 3. |
DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブをご使用ください。（スクリューキャップ式を推奨します。） |
| 4. |
DNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE Bufferにて保存してください。
※長期保存の場合は、-20℃又は、-80℃で保存してください。 |
| 5. |
UVスペクトルベースの濃度測定法では、DNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。 |
| 6. |
サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 |
| 7. |
サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、予めご了承ください。 |
| 8. |
FFPE由来DNAの場合は、条件が異なりますので、お問合せください。 |
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価格・納期
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【価格】
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| サービス名 |
保証データ量/サンプル |
数量 |
税別単価 |
Cat.# |
ヒト全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Human All Exon V6 |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoH6-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoH12-（サンプル数） |
ヒト全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Human All Exon V6＋UTR |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoUH6-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoUH12-（サンプル数） |
マウス全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Mouse All Exon |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoM6-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoM12-（サンプル数） |
ヒト全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Human All Exon V6
バイオインフォマティクス解析付 |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoH6D-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoH12D-（サンプル数） |
ヒト全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Human All Exon V6＋UTR
バイオインフォマティクス解析付 |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoUH6D-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoUH12D-（サンプル数） |
マウス全エクソーム受託解析サービス
SureSelect Mouse All Exon
バイオインフォマティクス解析付 |
6Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoM6D-（サンプル数） |
| 12Gb raw data |
1サンプル以上 |
お問合せ |
F-Novo-ExoM12D-（サンプル数） |
| ※ |
FFPE由来DNAサンプルの場合は、お問合せください。 |
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【納期】
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約1.5ヶ月間（バイオインフォマティクス解析付：約2～2.5ヶ月間）
※納期は、QCチェック合格後の日数です。
※年末年始、夏季休業、祝日、解析状況等により、上記より日数を頂く場合がございます事、予めご了承ください。 |
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サービスの流れ
注意事項
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本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Novogene社/Biomarker Technologies(BMKGENE)社）にて実施されます。 |
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本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。 |
| ・ |
やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求させて頂きます。 |
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サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 |
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ご提供頂いたサンプルの返却は、致しておりません（サンプルは解析終了後に破棄されます）。 |
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生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 |
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サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒否されたりする場合があります。 |
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