製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要） 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング - 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ 全エクソームシークエンス(Novogene) ・ ヒト全エクソームシークエンス(BMKgene) ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ 真核生物用 RNA-Seq(Novogene) ・ 原核生物用 RNA-Seq(Novogene) ・ 真核生物用 RNA-Seq(BMKgene) ・ 原核生物用 RNA-Seq(BMKgene) + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ ChIP-Seq ・ ヒト全ゲノムメチル化 ・ smallRNA-Seq ・ lncRNA-Seq ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq + ゲノミクス解析 ・ ヒト全ゲノムシークエンス(Novogene) ・ 動植物全ゲノムシークエンス(Novogene) ・ ナノポアシークエンス(Novogene) ・ PacBio(Revio/Sequel IIe)(Novogene) ・ ヒト/動植物全ゲノムシークエンス(BMKgene) ・ 動植物 de novo ゲノムシークエンス(BMKgene) + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノムシークエンス(BMKgene) ・ ショットガンメタゲノムシークエンス(Novogene) ・ 微生物ゲノムアンプリコン(Novogene) + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング (NGS) 受託解析サービス フィルジェンでは、今、最も注目を集める最先端テクノロジー、次世代シークエンシング（次世代シーケンシング/NGS）受託解析サービスをご提供しております。 信頼性の高い海外サービスプロバイダーと業務提供し、幅広い充実したサービスをご提供しています。 豊富なアプリケーションに対応できる様に、illumina NovaSeq6000, illumina HiSeq X Ten, illumina HiSeq 4000/2500、illumina MiSeq、NextSeq500、PacBio SequelⅡなど、複数の次世代シークエンサーをご用意しております。 ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench（QIAGEN社/CLC bio）”も販売いたしております。  対応アプリケーション ■シングルセル解析 ノボジーン社 シングルセル遺伝子発現 受託解析サービス 10x Genomics Chromium システムと Illumina NGS プラットフォームを組み合わせることで、シングルセル遺伝子発現、シングルセル免疫プロファイリング、シングルセルATAC を含む、高品質なエンドツーエンドシングルセルソリューションとサービスを提供しています。 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 シングル核 RNA シークエンス （snRNA-seq/10x Genomics Chromium) 受託解析サービス シングルセル RNA シークエンシング（scRNA-seq) には否定できない利点がある一方で、シングルセル懸濁液の作成が困難で、新鮮なサンプルを必要とする特定の組織では課題に直面します。BMLGene では、最先端の 10X Genomics Chromium 技術を用いたシングル核 RNA シークエンシング（snRNA-seq）を提供することで、この課題に対処しています。 ■遺伝子パネル解析 ノボジーン社 全エクソームシークエンス 受託解析サービス エクソン領域をターゲットとしたエンリッチメントキットを使用し、その領域における多型や変異を検出することができます。 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 ヒト全エクソームシークエンス 受託解析サービス 様々な研究目的に対応できる様に、2つの異なるエクソンキャプチャー戦略（Sure Select Human All Exon v6(Agilent) または xGen Exome Hybridization Panel v2(IDT)から選択）を備えた包括的かつ柔軟なヒト全エクソームシークエンスサービスを提供しています。 ■空間トランスクリプトーム解析 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 空間トランスクリプトーム (BMKMANU) 本サービスは、BMKGene社が開発した独自のプラットフォーム BMKMANU を使用した空間トランスクリプトーム解析サービスです。非常に汎用性が高く、様々な組織や必要な詳細レベルに合わせて微調整できるマルチレベルの解像度設定を提供します。 本サービスでは、解像度の異なる2つのチップによる解析をご用意しています。 ・BMKMANU S1000 空間トランスクリプトーム ・BMKMANU S3000 空間トランスクリプトーム 空間トランスクリプトーム (10x Genomics Visium) 本サービスは、illumina シークエンサーと 10x Genomics Visium を組み合わせた、空間トランスクリプトーム解析サービスです。10x Visum の原理は、組織切片が置かれるキャプチャー領域が指定された特殊なチップにあります。このキャプチャー領域には、バーコード化されたスポットがあり、それぞれが組織内の固有の空間位置に対応しています。組織からキャプチャーされた RNA 分子は、逆転写の過程で固有の分子識別子（UMA）で標識されます。これらのバーコード化スポットとUMIは、シングルセル分解能で遺伝子発現の正確な空間マッピングと定量化を可能にします。空間的にバーコード化されたサンプルとUMIの組み合わせにより、生成されるデータの精度と特異性が保証されます。 ■トランスクリプトミクス解析 ノボジーン社 真核生物用 RNA-Seq 受託解析サービス 真核生物を対象としたサービスです。cDNAライブラリーを作製し、転写産物のリードをタグとしてカウントすることで、ゲノムワイドな発現プロファイルの結果が得られます。新規エクソンや融合遺伝子の検出も可能。 原核生物用 RNA-Seq 受託解析サービス 原核生物を対象にしたサービスです。TSS解析、5'UTR解析、オペレーター解析などの機能ゲノミクス研究、sRNAの同定、アンチセンス転写物の同定など、RNA調節機構の研究に有効です。 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 真核生物用 mRNA-Seq 受託解析サービス 真核生物を対象としたサービスです。cDNAライブラリーを作製し、転写産物のリードをタグとしてカウントすることで、ゲノムワイドな発現プロファイルの結果が得られます。poly(A)を用いたmRNAキャプチャー。オプション（無償）のdirectional library 調製により、ストランド特異的なシークエンスデータを取得可能です。遺伝子発現と転写産物構造解析を含むバイオインフォマティクス解析（有償）をご用意しています。 原核生物用 mRNA-Seq 受託解析サービス 原核生物を対象にしたサービスです。ストランド特異的なシークエンスデータを得られます。バイオインフォマティクスパイプラインには、遺伝子発現解析だけでなく、オペロン、UTR、プロモーターの同定を含む転写産物構造の解析も含まれます。sRNAのアノテーション、つまり二次構造とターゲット予測などの解析も含まれます。   EIRNA Bio社 Ribosome Profiling 受託解析サービス リボソームに覆われた mRNA 断片の塩基配列を決定し、生体内で 1 塩基の分解能で翻訳のグローバルなスナップショットを提供するトランスラトーム解析です。また、翻訳中の mRNA に加え、通常の RNA-seq も解析するサービスです。   ■トランスラトミクス解析 EIRNA Bio社 Ribosome Profiling 受託解析サービス リボソームに覆われた mRNA 断片の塩基配列を決定し、生体内で 1 塩基の分解能で翻訳のグローバルなスナップショットを提供するトランスラトーム解析です。また、翻訳中の mRNA に加え、通常の RNA-seq も解析するサービスです。   ■エピゲノミクス解析 ノボジーン社 ChIP-Seq 受託解析サービス クロマチン免疫沈降で得られたDNA断片をシークエンシングし、ゲノム配列上にマッピングし、ピーク領域の検出を行います。 ヒト全ゲノムメチル化 受託解析サービス バイサルファイト処理したゲノムDNA全体を次世代シークエンシングすることで、網羅的かつ詳細にメチル化を解析します。 smallRNA-Seq 受託解析サービス microRNAを含むsmallRNAの発現解析を行います。新規smallRNAの同定も可能です。 lncRNA-Seq 受託解析サービス タンパク質をコードしない200nts以上の長さのRNAである、long non-coding(lnc)RNAの発現解析を行います。 Arraystar社 tRNA-Seq 受託解析サービス tRNAの内部および末端修飾を効率的に除去し、高効率と高精度のRNA-seqを行います。tRNAのアノテーション、発現差解析など豊富なバイオインフォマティクス解析を含むサービスです。 tRF＆tiRNA-Seq 受託解析サービス 多くの疾患に関連が見られる tRF&tiRNA のシークエンスおよびこれらの特化したバイオインフォマティクス解析を実施します。 (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter 受託解析サービス mRNAに加えて、lncRNAの遺伝子プロモーターにおける（ヒドロキシ）メチル化解析が可能です。 エピトランスクリプトームシークエンス 受託解析サービス 抗N6-メチルアデノシン（m6A）抗体によるm6A免疫沈降～MeRIP-Seqデータ解析までのフルパッケージです。モチーフ解析、メチル化ピーク変動解析、GOおよびパスウェイ解析などが含まれます。 R-loop profiling 受託解析サービス R-loop profiling では、ゲノムにおける LncRNA/mRNA の組織化された R-loop の分布をプロファイルします。本サービスのバイオインフォマティクス解析中の R-loop 分布をプロファイルします。 ecoDNA-Seq 受託解析サービス eccDNA-Seq では、制限エンドヌクレアーゼ切断によって環状 mtDNA を線形化し、線形化された mtDNA と直鎖状染色体 DNA を直鎖 DNA 特異的エキソヌクレアーゼによって消化することで、サンプル中の eccDNA を無傷のまま濃縮します。ローリングサークル増幅（RCA）によって eccDNA を増幅し、eccDNA のシグナルとデータ品質を大幅に向上させます。micro-eccDNA と mega-eccDNA を同時にプロファイリング可能です。 ■ゲノミクス解析 ノボジーン社 ヒト全ゲノムシークエンス受託解析サービス Illumina NovaSeq X Plus/NovaSeq6000 プラットフォーム、Oxford Nanopore PromethION、PacBio Revio/Sequel II システムから目的に合わせたシークエンスが可能です。 動植物全ゲノムシークエンス受託解析サービス SNP、InDel、CNV、and SV などのゲノム変異を同定することを目的とするサービスです。 ナノポアシークエンス受託解析サービス Illumina NovaSeq、PacBio Sequel、Oxford PromethION などの様々なプラットフォームからのシークエンシング結果を取り入れ、それぞれのユニークなゲノムに合わせた最適なアセンブリソリューションを提供します。 PacBio（Revio/Sequel IIe）受託解析サービス PacBio Revio/Sequel IIe を用いたロングリード解析です。 新規ゲノムやコンティグ整列などに利用可能。 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 ヒト/動植物全ゲノムシークエンス受託解析サービス illumina Novaseq, BGI T7, Nanopore Promethion P48, PacBio Revio の 4 種類のシークエンスプラットフォームの利用が可能。バリエーションコールと機能アノテーションを含む包括的なバイオインフォマティクス解析を提供。複数のデータベースを用いて同定された変異を持つ遺伝子の機能的アノテーションを行い、対応するエンリッチメント解析を行います。 動植物 de novo ゲノムシークエンス受託解析サービス シークエンシングとバイオインフォマティクス解析を統合したワンストップスリューションであり、高品質の de novo アセンブルゲノムを実現。Illumina による最初のゲノムサーベイでは、ゲノムのサイズと複雑性を推定し、この情報を基に次のステップである PacBio HiFi によるロングリードシークエンシングを実施。その後、コンティグの de novo アセンブルが行われます。続いて HiC アセンブリを使用することで、コンティグをゲノムに固定し、染色体レベルのアセンブリを取得します。最後にショートリードとロングリードによるトランスクリプトームを利用し、遺伝子予測と発現遺伝子の配列決定によって、ゲノムにアノテーション付けを行います。 ■メタゲノム解析 ノボジーン社 ショットガンメタゲノム 受託解析サービス NovaSeq6000を用いて解析します。 環境中微生物のゲノムDNAをすべて抽出・収集し、これらの全ゲノムを網羅的にシークエンスします。得られた配列データをリファレンス配列と相同性検索をすることで、菌種の帰属や菌種組成、挿入、欠失などの情報が得られます。また、機能遺伝子のデータベースに対して相同性検索を行うことで、その細菌嚢がどの様な機能遺伝子をもっているかの情報を得ることもできます。 微生物ゲノムアンプリコン 受託解析サービス 細菌の16S、真菌の18SおよびITS（internal transcribed spacer）を指標とした解析を行います。複数設計されたプライマーセットよりご希望のプライマーセットを選択して頂けます。また、ご自身で設計したプライマーセットでの解析にも対応しています。 Biomarker Technologies (BMKGENE)社 ショットガンメタゲノム 受託解析サービス NovaSeq X を用いて解析します。 環境中微生物のゲノムDNAをすべて抽出・収集し、これらの全ゲノムを網羅的にシークエンスします。得られた配列データをリファレンス配列と相同性検索をすることで、菌種の帰属や菌種組成、挿入、欠失などの情報が得られます。また、機能遺伝子のデータベースに対して相同性検索を行うことで、その細菌嚢がどの様な機能遺伝子をもっているかの情報を得ることもできます。 ■Hi-Cシークエンス解析 Phase Genomics社 ProximoTM Hi-Cゲノム スキャフォールディング 受託解析サービス 新たな方法を用いたスキャフォールディングアプローチによって、DNAの近接度（プロキシミティ）を in vivo で測定し、その情報を利用してコンティグから染色体スケールのスキャフォールドを行います。 ProxiMetaTM Hi-Cメタゲノム デコンボリューション 受託解析サービス in vivo Chromosome Conformation Capture によるDNAの近接情報の物理的補足に基づいて、自然な条件下にある混合サンプルの全ゲノムアセンブリを可能にします。同じ種・株に由来するシークエンスの分類を可能にし、数十、数百の稀少で培養可能な新規微生物のゲノムを取得します。 CytoTerraTM Cytogenomics 受託解析サービス CytoTerra Cytogenomics Platform は、従来の細胞遺伝学のゲノムワイドな構造変異検出力と、染色体マイクロアレイおよびFISHの分子レベルの制度を、コスト効率の高い単一のNGSベースのアッセイに統合したプラットフォームです。 OncoTerraTM Oncology 受託解析サービス 高解像度ゲノム技術を活用して、精密腫瘍学の可能性を広げます。超長距離シークエンシングの独自の強みを活かし、FFPEサンプルに含まれる豊富な診断および予後情報を、コスト効率に優れたスケーラブルなNGSベースのアッセイで実現しました。 ■抗原特異的プロファイリング CDI Laboratories社 HuScanTM PhIP-Seq Antibody Profiling 受託解析サービス T7 バクテリオファージ免疫沈降シークエンス（PhIP-Seq）は、ハイスループット DNA シークエンスと次世代プロテオミクスを組み合わせて、抗原特異的抗体の個人固有のフィンガープリントを決定する多重化分析の方法です。 全ヒトプロテオーム全体に対し、エピトープレベルの抗体プロファイリングを提供します。 MouseScanTM PhIP-Seq Antibody Profiling 受託解析サービス T7 バクテリオファージ免疫沈降シークエンス（PhIP-Seq）は、ハイスループット DNA シークエンスと次世代プロテオミクスを組み合わせて、抗原特異的抗体の個人固有のフィンガープリントを決定する多重化分析の方法です。 全マウスプロテオーム全体に対し、エピトープレベルの抗体プロファイリングを提供します。 ■ReptorTM 免疫レパートリーシークエンス解析 Abterra bio社 Hybridoma Sequencing Service ハイブリドーマ細胞株が産生する抗体の可変重領域（VH）と可変軽領域（VL）をコードする cDNA の配列情報を取得する解析サービスです。アイソタイプを決定するために、全長可変領域および定常領域の約9ヌクレオチドを配列決定します。 Buk B cell Sequencing Service B細胞の表面に存在する膜型免疫グロブリンであるB細胞受容体（BCR）の配列情報を取得します。 バルクB細胞（組織、細胞、血液、ファージミド）をご提供頂き、BCRレパートリー分析を行います。時系列/空間/ケースごとにデータを取得することで、その多様性を把握、比較することができます。 Display Library Sequencing ファージライブラリーをNGS分析することで、ライブラリーの多様性をハイスループットで評価できるサービスです。 ファージディスプレイ技術は、標的特異的ペプチド/タンパク質をスクリーニング及び単離するための強力な技術です。 バクテリオファージに遺伝子を挿入し、外来ペプチドまたは抗体をその表面に発現させたファージライブラリーと、標的分子を反応させ、選択操作（バイオパニング）を行うことにより、標的分子に結合するファージ群を濃縮することができます。 バイオパニングプロセスを通じて一部のクローンが支配的になり、最終的なスクリーニング後に利用可能なクローンの数が限られるということが、ファージディスプレイ技術の欠点の一つとして挙げられますが、本サービスでは、バイオパニングの各ラウンド後に得られた濃縮ファージライブラリーについてNGS分析を行うことで、どのクローンが陽性である可能性が高いかについての洞察を提供することができます。 次世代シークエンサーとは？ 従来のサンガー法とは異なり、次世代シークエンサーは、1回のランで数千万～数十億bpの塩基配列情報を得ることができ、ヒトの全ゲノム配列解読も可能な高性能かつハイスループットな技術です。コストパフォーマンスにも優れ、短いゲノム配列を大量に読むことによって、より信頼度の高いデータを得ることができます。新規ゲノム配列決定やSNP検索以外にも、ゲノム染色体異常（欠失や転座）、遺伝子発現解析、smallRNA解析やChIP-Seqなど、様々なアプリケーションへの応用が可能です。 業務提携先について ■Abterra Biosciences社 Abterra Bioscience社（アメリカ）は、免疫レパートリー解析や抗原特異的抗体の探索、ハイブリドーマ情報の無いモノクローナル抗体のリシークエンスなど、抗体シークエンスのサービスを提供しています。 ■ArrayStar社 ArrayStar社（アメリカ）は、ベストセラーであるLncRNAマイクロアレイをはじめ、ncRNAマイクロアレイ、プロモーターマイクロアレイ、次世代シークエンスなど、エピジェネティック研究向けのマイクロアレイ及び受託サービスを提供しています。世界中の研究機関で利用され、2009年の設立以来190を超える学術誌に掲載されています。 ■Biomarker Technologies（BMKGENE）社 Biomarker Technologies(BMKGENE)社（中国）は、ゲノミクス、トランスクリプトミクス、単細胞オミクス、エピジェネティクスをカバーする包括的なシークエンスサービスを提供する世界最大級のシークエンスプロバイダーです。独自に開発した空間トランスクリプトームプラットフォームを有しており、サンプルからバイオインフォマティクスに至るまで、包括的なワンストップの空間トランスクリプトームシークエンスサービスを提供しています。 ■CD Genomics社 CD Genomics社（アメリカ）は、次世代シークエンシング、ロングリードシークエンシングなどの様々な最先端の技術プラットフォームに関する豊富な経験を有し、製薬会社やバイオテクノロジー企業、学界、政府機関に信頼性の高いサービスを提供し、高い評価を得ている企業です。 ■CDI Laboratories社 CDI Laboratories社（アメリカ）は、独自の技術のよるプロテオミクスの研究開発に力を入れており、世界最大のタンパク質コレクションを搭載した、タンパク質相互作用解析用プロテインマイクロアレイ「HuProt Human Proteome Microarray」をはじめ、モノクローナル抗体や、カスタム抗体作製サービス、次世代シークエンスによる抗原特異的プロファイリングサービスなどを提供しています。 ■DiaCarta社 DiaCarta社（アメリカ）は、独自の核酸分子クランプを採用したテクノロジーによって、変異遺伝子を高感度かつ高精度に増幅させることで、がんの変異遺伝子の検出ができる、ターゲットシークエンスサービス、および変異検出キットを販売しています。 ■EIRNA Bio社 EIRNA Bio社（アイルランド）は、トランスラトミクスに特化した最先端技術を使用したリボソームプロファイリング（Ribo-seq）などのサービスを提供しています。リボソームに覆われた翻訳中のmRNA断片の塩基配列を決定し、生体内で1塩基の分解能で翻訳のグローバルなスナップショットを提供しています。 ■ノボジーン社 ノボジーン株式会社（東京都中央区）は、ゲノムサービスおよびソリューションのリーディング・グローバル・プロバイダーで、東京大学柏の葉キャンパス内にシークエンスラボを持ち、世界各地にあるノボジーングループの世界最大規模のシークエンスラボ・ネットワークも活用しています。主に国内の大学や製薬企業等を主要顧客としてゲノム受託解析サービスを提供していますが、そのサービスの範囲は広く、全ゲノム解析や全エクソーム解析、トランスクリプトーム解析、メタゲノム解析、シングルセル遺伝子発現解析など、ショートリード型シークエンサーをベースにしたサービスはもちろんのこと、PacBio社やオックスフォードナノポア社が提供するロングリード型シークエンサーをベースにしたサービスも幅広く提供しています。 ■Phase Genomics社 Phase Genomics社（アメリカ）は、高次のDNA構造を利用して、動植物ゲノムのスキャホールドおよびメタゲノムのアセンブリを劇的に向上させる、ProximoTM Hi-Cスキャフォールディング解析、ProxiMetaTM Hi-Cメタゲノムデコンボリューション解析を提供しています。 受託解析サービスの流れ ⇒詳細情報 ⇒DiaCarta社 詳細情報 カタログダウンロード カタログダウンロード(PDF) （関連製品） 　QIAGEN社（CLC bio）　次世代シークエンスデータ解析ソフトウェア 　 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2024 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.