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次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス
微生物ゲノムアンプリコン 受託解析サービス

フィルジェンでは、微生物ゲノムアンプリコン受託解析サービスをご提供しております。Novogene社との業務提携により、サービスをご提供しております。


概要


細菌の16S、真菌の18SおよびITS(internal transcribed spacer)を指標とした解析を行います。複数設計されたプライマーセットよりご希望のプライマーセットを選択して頂けます。また、ご自身で設計したプライマーセットでの解析にも対応しています。


【ワークフロー】

【プライマーデザイン】

【データ解析パイプライン】

【Library Construction】


必要サンプル量


・ゲノムDNA: 150ng以上(300ng以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 5ng/μL以上
・O.D.260/280: 1.8-2.0
・Buffer: TE BufferまたはddH2O

1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min.
2. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。
3. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
4. ゲノムDNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferまたはddH2Oにて保存してください。
*長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNA, dsDNA, ssDNA, フリーの核酸等も同時に検出するため、ゲノムDNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノムDNAを準備してください。
6. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。

illumina HiSeq 2500


標準データ解析例


微生物ゲノムアンプリコンデータ解析サービスは、実験手順、シークエンスデータのクオリティー情報、菌種組成、系統図、α多様性、およびβ多様性などについてまとめています。



価格


サービス内容 数量 税別単価 Cat.#
微生物ゲノムアンプリコン
受託解析サービス(60,000 reads)
バイオインフォマティクス解析付
 
5-9サンプル お問合せ F-Novo-AS3-(サンプル数)
10-24サンプル お問合せ
 25-49サンプル お問合せ
50-99サンプル  お問合せ
微生物ゲノムアンプリコン
受託解析サービス(100,000 reads)
バイオインフォマティクス解析付
   
5-9サンプル お問合せ F-Novo-AS5-(サンプル数)
10-24サンプル お問合せ
 25-49サンプル お問合せ
50-99サンプル  お問合せ
 1)海外へのサンプル輸送費用およびハードディスク費用が別途必要です。

 
お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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