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次世代シークエンシングサービス
small RNA-Seq 受託解析サービス
フィルジェンでは、Novogene社と業務提携し、次世代シークエンス(次世代シーケンス)/smallRNA-Seq受託解析サービスをご提供しております。ワールドスタンダードとなった次世代シークエンスデータ解析用ソフトウェア”CLC Genomics Workbench(CLC bio社)”も販売いたしております。


概要
microRNAを含むsmall RNAを解析対象とした次世代シークエンスによる発現解析サービスです。生物種を問わず解析することができます。既知のsmall RNAとmicroRNAの発現量はもちろん、マイクロアレイではできなかった新規smallRNA候補の発見も可能です。


サービスの仕様

使用機種 illumina社 HiSeq2500
ライブラリー種類 Single-end 50bp
保証データ量 6M reads, 10M readsから選択
作業内容 QCチェック、ライブラリー作製、シークエンス作業、バイオインフォマティクス解析(オプション)
納品データ HDD/USB(NTFSフォーマット)にて、以下のデータを納品
・シークエンスデータ(fastq)
・解析データ(.bam, .vcf, .gff, .xls, .txt)
・解析レポート(.pdf, .html)
*解析データおよびレポートは、バイオインフォマティクス解析をお申し込み頂いた場合に納品
最低注文数 2サンプル
納期(標準) 約2ヶ月(バイオインフォマティクス解析付: 約2.5ヶ月)
* 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受け出来ません。
やむを得ない理由でキャンセルする場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。
QC結果やライブラリー作製などの問題で再度サンプルをお送りする場合は、別途送料をご請求させて頂きます。


必要サンプル量
(Animal)
・Total RNA: 3μg以上(6μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 50ng/μL以上
・RIN: 8以上(smooth base line)
・O.D.260/280: 1.7以上
・O.D.260/230: 1.8以上
・Buffer: RNase-free H2O

(Plant and Fungus)
・Total RNA: 3μg以上(6μg以上を強く推奨)
・容量: 20μL以上
・濃度: 50ng/μL以上
・RIN: 7.5以上(smooth base line)
・O.D.260/280: 1.7以上
・O.D.260/230: 1.8以上
・Buffer: RNase-free H2O

(注意事項)
1. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。
*電気泳動は、次の条件で実施してください。 1.0% agarose gel; 0.5% TBE solution; 180V for 16 min.
2. DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。(スクリューキャップ式を推奨します。)
3. TotalRNAは、RNase-free H2Oに溶解し、-80℃で保存してください。
4. DNase処理を行うことを強く推奨します。
5. UVスペクトルベースの濃度測定法では、RNAの濃度測定が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。
*UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いRNAを準備してください。
6. スピンカラムにより、Total RNA抽出や精製をすると、microRNAやsmallRNAが除去される可能性がありますので、使用するキットの仕様を必ず確認してください。
7. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。


smallRNA-Seqのワークフロー
totalRNA サンプルQC Small RNA回収
Small RNAライブラリー作製
ライブラリーQC シークエンス


価格
サービス名 数量 税別単価 1) Cat.#
small RNA-Seq受託解析サービス
(10M reads)
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-SRdeq6-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
small RNA-Seq受託解析サービス
(20M reads)
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-SRdeq10-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
small RNA-Seq受託解析サービス
(10M reads) 標準データ解析付
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-SRdeq6D-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
small RNA-Seq受託解析サービス
(20M reads) 標準データ解析付
  
2-4サンプル お問合せ F-Novo-SRdeq10D-(サンプル数)
5-9サンプル お問合せ
10サンプル以上 お問合せ
1) 海外へのサンプル輸送費用及び納品用ハードディスク費用が別途必要です。

お問い合わせ biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 filgen.jp
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