製品・サービス情報
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Biognosys社 大規模プロジェクト用 プロテオーム解析
MRM/PRM ターゲットプロテオミクスサービス |
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 概要
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本サービスは、複雑な生体サンプルから選択されたタンパク質に対して、特異的かつ高感度な多重定量を可能にした標的タンパク質解析技術である Multiple
Reaction Monitoring (MRM; 多重反応モニタリング）、および Parallel Reaction Monitoring
(PRM; 並列反応モニタリング）を利用しています。6桁のダイナミックレンジで1ランごとに最大150の標的タンパク質を相対的だけでなく、絶対的に定量化することができます。
本サービスは、30サンプル以上の大規模プロジェクト用の解析となります。
少数サンプルでの解析には対応しておりませんので、予めご了承ください。 |
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カタログダウンロード
（PDF) |
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【MRMとPRM】
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本解析で採用されている分析方法は、Multiple Reaction Monitoring (MRM; 多重反応モニタリング）、および Parallel
Reaction Monitoring (PRM; 並列反応モニタリング）の2つの主要なアプローチに依存しています。MRMは、ターゲットプロテオミクスのために確立された手法となっており、主にトリプル四重極質量分析計で分析が行われますが、一方でPRMは近年導入され始めた技術であり、最新世代の高分解能質量分析計で分析が行われます。
⇒Biognosys社による技術情報はこちら |
【特長】
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・少量のサンプルで解析可能
・培養細胞、血液、組織、尿、CSFなどのサンプル準備に合わせた専用プロトコールをご用意 |
【アプリケーション例】
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・ヒト細胞培養サンプルにおけるタンパク質定量のためのハイスループットMRMメソッド開発
・心血管疾患マーカーの定量化のためのMRMパネルの開発
・トウモロコシの経路モデリングのための多重化MRMパネルの開発 |
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 サービスプラットフォーム
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本サービスは、MRM法およびPRM法を採用した質量分析による標的タンパク質定量解析サービスです。お客様の解析内容に合わせて選択されたタンパク質、1ランにつき最大150種類の標的タンパク質の解析が可能です。
【プラットフォーム情報】
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お客様のプロテオミクスのニーズに合わせて、4種類のサービスプラットフォームをご用意しています。
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【Relative Quant】 - カスタムアッセイパネルの開発とサンプル測定
本サービスは、数百～数千サンプルの中から選択された、最大150種類の標的タンパク質の相対定量解析に最適です。 |
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【Absolute Quant】 - 絶対定量用安定同位体ペプチドを含むカスタムパネルの開発とサンプル測定
本サービスは、安定同位体ペプチドを用いたサンプル調整およびアッセイ開発により、ご希望に合わせて選択された最大150種類の標的タンパク質の絶対定量解析を数百または数千サンプル規模で行うことができます。 |
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【PlasmaDive】 - PlasmaDiveを使用した血漿サンプルの絶対定量
本サービスは、Biognosys社製ソフトウェア 「PlasmaDive」を使用することで、あらかじめ設計された100種類のヒト血漿タンパク質の絶対定量解析を数百～数千サンプル規模で行うことができます。 |
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【PlasmaDeepDive】 - PlasmaDeepDiveを使用した血漿サンプルの絶対定量
本サービスは、Biognosys社製ソフトウェア「PlasmaDeepDive」を使用することで、あらかじめ設計された100種類の低濃度ヒト血漿タンパク質の絶対定量解析を数百～数千サンプル規模で行うことができます。 |
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【対応サンプルについて】
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本サービスでは、プラットフォームを問わず、様々な生物種および任意の生物試料に対して利用可能です。
以下は、頻繁に要求されるサンプルタイプの詳細情報を示しています。
| サンプルタイプ |
培養細胞 |
血液（血漿） |
組織（凍結） |
尿 |
CSF |
| 必要サンプル量 |
105～106個 |
5～10μL |
5～10mg |
100～200μL |
50～100μL |
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ご依頼方法
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| 1. |
解析内容の打ち合わせ
大まかなサンプルの種類、サンプル数などの内容をお知らせください。本サービスは大規模プロジェクト用のサービスとなっており、プロジェクト内容について、解析元であるBiognosys社とお客様の間でWeb会議が必ず必要になります。プルジェクト内容がまとまり次第、弊社からお見積りをご案内させて頂きます。
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| 2. |
ご注文およびサンプル送付
ご注文を頂いた後、解析サンプルとQCシート/免責事項同意書をお送りください。ご送付頂いた内容物を確認後、Biognosys社にサンプルを発送いたします。 |
| 3. |
サンプル調整
細胞、または組織の溶解、並びにタンパク質抽出を行います。タンパク質のトリプシン消化、精製、QCチェックを行います。 |
| 4. |
MRM/PRMデータ取得
データ取得は、トリプル四重極質量分析計（MRM）または高分解能質量分析計（PRM）で実行されます。 |
| 5. |
標的タンパク質解析
アッセイライブラリーによりペプチドを同定し、Biognosys社製ソフトウェア「SpectroDiveTM」により、定量化します。 |
| 6. |
納品
解析結果は解析元とお客様間でセミナーまたはウェビナーで提示および議論された後、最終的にPDFやExcel形式で納品いたします。
納期は、サンプル到着後1～1.5か月程度となります。
・エクゼクティブサマリー
・Material ＆ Methods（論文投稿に適した形式）
・正規化されたデータ
検出されたすべてのタンパク質とその相対的なタンパク質強度、または安定同位体標準が使用されている場合は絶対量
タンパク質注釈（Uniprotのナレッジベースに基づく）
・データ解析
変動タンパク質の因子と有意差
ご要望に合わせて実施された分析 |
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 価格
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| サービス名 |
プラットフォーム |
税別価格 |
カタログ＃ |
| MRM/PRM ターゲットプロテオミクスサービス |
Relative Quant |
お問合せ |
F-BGS-RQ-［サンプル数］ |
| Absolute Quant |
F-BGS-AQ-［サンプル数］ |
| PlasmaDive |
F-BGS-PD-［サンプル数］ |
| PlasmaDeepDive |
F-BGS-PDD-［サンプル数］ |
※より精度の高いデータを取得するために、必ず生物学的レプリケート数を3以上で構成していただくことをお願いしております。 |
ご注意事項（必ずご確認ください）
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【解析サービスに関して】
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本サービスは、弊社の海外提携先（Biognosys社）にて解析を実施いたします。 |
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お預かりできるサンプルは、BSL2（バイオセーフティレベル2）までのものに限らせていただきます。感染性が著しく高いサンプル（HIV, HCV, HBVウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など）は、お受けできませんので、ご了承ください。 |
| ・ |
ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得たサンプルをご提供ください。 |
| ・ |
ご提供頂くサンプルおよび本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。 |
| ・ |
本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果等の問題でサンプルを再送する場合は、別途送料をご請求させて頂きます。 |
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本確認事項を満たさない事で、別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。 |
【サンプルの送付および取り扱いに関して】
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サンプルの発送は、必ず、「サンプル送付方法およびご注意点(PDF)」をご参照の上、その内容に従って行ってください。 |
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送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。
サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバック等に入れ、砕いたドライアイスとともに梱包してください。 |
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QCシートおよび免責事項同意書をご記入の上、サンプルと同封してご送付ください。これらのシートが同封されていない場合、またはご記入漏れがある場合、解析サービスの着手が遅れる場合がございますのでご注意ください。 |
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新鮮サンプルの場合、上記必要量のペレットを液体窒素凍結後、-80℃保存し、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。 |
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本サービスは、海外での解析となりますので、お送り頂いたサンプルのご返却はできません。貴重なサンプル等はあらかじめご注意ください。 |
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◆サンプル送付先 ※土日祝祭日および営業時間外のサンプル受け取りは不可
フィルジェン株式会社 受託解析部 1グループ 宛
〒459-8011 名古屋市緑区定納山1丁目1409番地
Tel 052-624-4388 Fax 052-624-4389
営業時間：9：00～18：00 |
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本ページは、Biognosys社のウェブサイトの情報を一部引用しています。
（サービス） HRM-MS ディスカバリープロテオミクスサービス / LiP-MS ターゲットデコンボリューション解析サービス
（試薬） iRT Kit / HRM Calibration Kit / PQ500 Reference Peptides / Sample Preparation Kit
（関連ソフトウェア） SpectronautTM / SpectroDiveTM / SpectroMine
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