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Home製品・サービス情報受託サービス次世代シークエンシング(概要)>single-cell nuclear RNA sequencing(snRNA-Seq)受託解析サービス

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CD Genomics社 次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス
single-cell nuclear RNA sequencing (snRNA-Seq)
受託解析サービス

本サービスは、CD Genomics社(アメリカ)との業務提携によって、ご提供いたします。


概要

長期保存組織、脳細胞、脂肪細胞などの単離が困難な細胞は、現在の酵素的・機械的方法では分離できず、多くの場合、他の細胞コンパートメントを損傷します。従って、単一核 RNA シークエンスが特に重要になります。
snRNA シークエンシングは、単一細胞レベルで開発された技術であり、高分解能のシングルセルシークエンシング手法を用いて、凍結サンプルの核を直接捕捉し、細胞の不均一性を正確に区別するとともに、個々の細胞の遺伝子構造や遺伝子発現状態を明らかにすることができます。snRNA シークエンスは特に、シングルセル実験では使用できない貴重な凍結細胞サンプルや不均一な細胞サンプルに関する課題を解決します。心肺疾患や神経発達の臨床治療や診断に役立ち、プレッシジョンメディシンの時代を加速させます。


ワークフロー

【snRNA シークエンシング】


【バイオインフォマティクス解析】



長所と短所

【長所】
◆解離しやすい細胞種の偏った回収を減らす
◆解離によって誘発される異常な転写反応を排除
◆凍結サンプルにも対応

【短所】
◆細胞質内の転写産物の損失


サンプル条件

サンプル種類: 凍結組織、培養細胞など
※-80℃保管、ドライアイス輸送


snRNA-Seq テクノロジーが選ばれる理由


シングルセル RNA シークエンス(scRNA-Seq)技術の急速な発展により、一定の時間における細胞の種類と組織の特定の細胞状態についての洞察が得られる様になりました。しかし、scRNA-Seq を成功させるには、高品質のサンプル入力、すなわち適切な細胞活性と細胞数を持つ臓器や固形組織の細胞懸濁液が必要であるため、超低温で保存された貴重な臨床サンプル(脳組織、腫瘍組織など)は、scRNA シークエンシングには適していません。幸いなことに、single-cell nuclear RNA sequencing (snRNA-Seq) 技術の発明により、上記の障害はほぼ解決されました。
snRNA-Seq 技術は、新鮮な組織サンプルに限らず、凍結サンプルにも適しているため、サンプルの適用性という点で、シングルセル RNA シークエンス技術よりも進んでいると考えられています。さらに、単一細胞核の調製は、単一細胞懸濁液の調製よりも簡単であり、酵素的解離や機械的ストレスによって誘発される偽細胞集団の生成を最小限に抑えられます。データ解析において、snRNA-Seq はイントロンおよび遺伝子間領域に関するデータ、細胞タイプ同定のためのより高い分解能、および比較的詳細な遺伝子情報をサポートします。

一方、シングルセルシークエンスには、サンプルの解離において以下の様な欠点があります。
1. scRNA-Seq は新鮮な組織サンプルにしか適用できないため、細胞が不活性化されている冷凍サンプルでは実施できません。
2. 解離の過程でストレス遺伝子の発現が誘導され、細胞に「人工的な転写ストレス応答」が生じるため、転写バイアスをもたらします。そのため、得られたデータはサンプルの転写状態を真に反映しておらず、結果の信頼性が大きく低下します。
3. 脳、心臓、腎臓など多くの固形組織では、プロテアーゼは分離しやすい細胞タイプを解離させる傾向があるため、分離しにくい細胞では情報の損失が観察されます。同時に、感受性の高い細胞は、過剰な解離のために断片化される可能性があります。そのため、解離プロpセスは組織内のすべての細胞タイプを効果的に捕捉することができず、結果の制度は大幅に低下します。



価格

サービス名 税別価格 Cat.#
single-cell nuclear RNA sequencing 受託解析サービス   お問合せ お問合せ


ご注意事項 - 必ずお読みください。


1. 解析サービスに関して
本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先(CD Genomics社)にて実施されます。
本サービスは医療用ではなく、研究用に限定して販売しております。医療品の製造、品質管理、各種診断、治療には使用しないでください。
2. 解析に利用する製品に関して
本サービスの仕様は、事前の予告なく変更される場合があります。
3. お見積りに関して
正式なお見積書は、直接販売の場合には直接ご提出いたしますが、代理店経由の場合は代理店よりご提出いたします。
4. サンプルの送付および取り扱いに関して
4.1 サンプルのご発送は、必ず、サンプル送付方法およびご注意点(PDF)の内容に従ってください。送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。サンプルの入ったチューブには、油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバッグ等に入れてください。
4.2 サンプルは、なるべく休日をはさまない様に、弊社営業時間内(土日祝日、年末年始等を除く、平日9時~18時)に到着する様にご発送ください。なお、ご発送時の送料はお客様負担となります。着払いでは受け取りできませんので、あらかじめご注意ください。
4.3 サンプル送付の際は、受託解析サービスQCシートおよび免責事項同意書を同封してください。これらが同封されていない、または記入漏れがある場合、解析サービスに着手できませんので、ご注意ください。
4.4 ご送付いただいたサンプルの RNA 品質チェックの結果、解析に必要な品質を満たさなかった場合、サンプルの再送をお願いする場合があります。なお、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。
4.5 弊社に起因しない(国内および国際輸送時など)サンプル喪失等に対する補償・保険制度はありませんので、貴重なサンプルをご提供頂く際はご注意ください。
4.6 お預かりできるサンプルは、BSL2(バイオセーフティーレベル2)までのものに限られます。感染性が著しく高いサンプル(HIV、HCV、HBVウイルス)に感染していることが確認されている患者由来の検体など)は、お預かりできませんので、予めご了承ください。ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得てからご提供ください。
4.7 ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。(サンプルは解析終了時に破棄されます。)
4.8 本確認事項を満たさない事で別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。
4.9 サンプル・業務等から生じた知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社は一切の責任を負わないものとします。
5. キャンセルに関して
本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルをお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。
6. 納品物に関して
納品物は、代理店経由でのお取引の場合、基本的に代理店を介してお送りします。納品データのバックアップは、必ずお客様にてお取りください。弊社でのデータ保管期間は、発送日から90日間です。弊社での保管期間を経過したデータは破棄されます。

※本サイトの情報は、CD Genomics社のHomepageの情報を一部引用しております。
お問い合わせ 受託解析部: biosupport@filgen.jp P.052-624-4388 https://filgen.jp/
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