製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞ナノポアシークエンシング受託解析 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ 全エクソームシークエンス ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ RNA-Seq + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling ・ エピゲノミクス解析 ・ ChIP-Seq + ヒト全ゲノムメチル化 ・ smallRNA-Seq ・ lncRNA-Seq ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq + ゲノミクス解析 ・ ヒト全ゲノムシークエンシング ・ ゲノムシークエンシング ・ PacBio ロングリード ・ ナノポアシークエンシング解析 + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノム ・ 微生物ゲノムアンプリコン + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング(NGS)サービス ナノポアシークエンシング 受託解析サービス フィルジェンでは、Novogene社との業務提携により、次世代シークエンス（次世代シーケンス）/ナノポアシークエンス受託解析サービスをご提供しております。 概要 本サービスは、Oxford Nanopore社製のPromethIONを採用した次世代シークエンスサービスです。PromethIONは、同社製品であるMinIONやGridIONの様にリアルタイム、ロングリード、ダイレクトなDNAシークエンスを行う技術を採用し、それらをより大規模に行うことのできる、最も高出力な装置です。群集規模のシークエンスや植物ゲノミクスの様な大規模プロジェクトに最適です。 【ナノポアシークエンスについて】 PromethIONの採用するシークエンステクノロジーは、電気泳動により一分子ずつナノポアを通過させるシークエンス技術です。ナノポアは超微細なサイズであるため、一度に1つの核酸重合体しか通過することができません。並んだ塩基がナノポアを通過する際、ポア内に置かれた2つのナノ電極対の間を通る電流が1塩基ずつ異なるため、その違いを測定し、シークエンスを行っていきます。     特長 リードが少ない場合や、大きな構造異変の検出が困難な場合、ゲノムが複雑でアセンブリが難しい場合などにナノポアシークエンスが有用なツールとなります。 ・ 統合計算により、リアルタイムのベースコール、およびそれ以降の解析が可能 ・ 48個のフローセルを搭載し、ハイスループットな実験が可能 ・ 最大1メガバイトまでの超ロングリードが可能 PromethION チャンネル数 144,000 サンプル量 10pg～1μg データ出力 6.2Tb（理論値） リード長 最大1Mb（サンプル品質に依存） 所要時間 48時間（平均時間）   【ライブラリーの構築について】 本サービスでは、1D Ligation Sequencing Kit（Oxford Nanopore Technologies）を使用し、ライブラリー調整を行います。この方法はバーコードの有無で2つのライブラリー構築方法に利用することができます。   サービス内容 ご送付いただいたDNAサンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。 【シークエンスプラットフォーム】 PromethION 【シークエンス量】 1サンプルあたり1Gb単位でご指定いただけます。 ※海洋生物、水生生物、昆虫サンプルは、データ量の保証対象外となりますこと、ご了承ください。 【作業内容】 1. サンプルQCチェック 2. ライブラリー作製 3. シークエンス作業 4. バイオインフォマティクス解析（ご希望の場合のみ） 納品物　 ・FASTQ形式のシークエンスデータ サンプル条件 サンプルタイプ 必要量 濃度（Qubit） 純度（NanoDropTM） 推奨量 必要最小量 HMW Genomic DNA （メインフラグメント＞40K） ≧20μg ≧10μg ≧100ng/μL O.D.260/280=1.8～2.0 O.D.260/230=2.0～2.2 no degradation or RNA contamination 1. EDTA、Mg2+、変性剤（グアニジン塩、フェノールなど）、洗浄剤（SDS、Triton-X100など）、組織からのコンタミ（ヘム、フミン酸、ポリフェノールなど）が無いものをご準備ください。 ※TrisAc、Tris-HCl、またはddH2Oは問題ありません。 2. 電気泳動を実施し、泳動写真を添付してください。 ※電気泳動は、次の条件を推奨します。 1.0% agarose gel; 1.0% TAE solution; 100V for 40 min. 3. RNase処理を行い、DNAが分解されていないことを確認してください。 4. DNase、RNaseフリーの1.5mL又は2mLのチューブを使用してください。（スクリューキャップ式を推奨します。） 5. DNAは、凍結融解をできる限り避け、4℃でTE bufferにて保存してください。 ※長期保存の場合は、-20℃または-80℃で保存してください。 6. UVスペクトルベースの濃度測定法では、不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの測定を強く推奨します。 ※UVスペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いサンプルを準備してください。 7. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 8. サンプルの最終的な品質は、業務提携先でのQCチェックの結果に従いますこと、あらかじめご了承ください。 9. プロジェクト内容によって、条件が変わる場合があります。 価格・納期 価格は、プロジェクトごとに異なりますので、詳しくは弊社までお問合せください。 お見積りの際は、以下の情報が必要です。 ・生物種 ・サンプル数 ・データ量 ・ご希望のインサートサイズ ・抽出方法 ・解析をご希望の場合、解析目的をお知らせください。 ご注意事項 ・ 本サービスの解析は、弊社の海外提携先（Novogene社）にて実施されます。 ・ 本サービスは海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。 ・ やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。 ・ 品質チェック（QCチェック）等の問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、提携先への再送料金をご負担頂きます。 ・ 余ったサンプルの返却は致しておりません。（サンプルは解析終了後に破棄されます。） ・ 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたしますので、必ずバックアップをお取りください。 ・ 動物検疫・国際条約等に該当するサンプルの場合、輸送手続きに日数を要する、又はお取扱いできないことがあります。 ※こうしたサンプルは、弊社提携先にて受け入れが不能、又は拒絶されたりする場合もございます。 　 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) 2004-2024 Filgen, Inc.　All Rights Reserved.