製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞CytoTerra(TM) Cytogenomics 受託解析サービス 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ ヒト全エクソームシークエンス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ 真核生物用 RNA-Seq ・ 原核生物用 RNA-Seq ・ メタトランスクリプトームシークエンス ・ CircRNA-Seq ・ Exosome Small RNA-Seq ・ PacBio Iso-Seq ・ Long non-coding RNA-Seq ・ Small RNA-Seq ・ 全トランスクリプトームシークエンス ・ 全長mRNA-Seq(Nanopore) + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ tRNA Modification Seq(m1A/m3C/m1G/m2,2G) ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq ・ 全ゲノムバイサルファイトシークエンス（WGBS） ・ ChIP-Seq ・ RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） ・ ATAC-Seq ・ Hi-C クロマチン相互作用 + ゲノミクス解析 ・ ヒト/動植物全ゲノムシークエンス ・ 動植物 de novo ゲノムシークエンス ・ ゲノムワイド関連シークエンス ・ Hi-C Genome Assembly ・ SLAF-Seq + マイクロバイオミクス解析 ・ ショットガンメタゲノムシークエンス ・ メタゲノムシークエンス（ロングリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（ショートリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（Pacbio） ・ 細菌/真菌ゲノムリシークエンス ・ 細菌ゲノム de novo assembly ・ 真菌ゲノム de novo assembly + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C シークエンス ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 次世代シークエンシング(NGS)サービス CytoTerra® Cytogenomics 受託解析サービス ProximoTM Hi-C シークエンス/ProxiMetaTM Hi-C　メタゲノムデコンボリューション/ CytoTerra® Cytogenomics 遺伝子マップのトポグラフィーを明らかにする CytoTerra プラットフォームは、細胞遺伝学を新たなレベルへと引き上げます。Phase Genomics 独自の Genome Proximity MappingTM (GPM) テクノロジーと AI ベースの計算ツールを基盤とするこのプラットフォームは、従来のアプローチに伴うギャップや課題を解決し、ゲノムランドスケープの包括的な全体像を提供します。単一の NGS ベースのアッセイで、標準的な細胞遺伝学解析、FISH、CMA を組み合わせたものよりも高い解像度で、幅広い染色体異常を特徴づけることができます。 特徴 ● ブレークポイントコール（逆位、転座、挿入など）とリージョナルコール（欠失、重複、コピーニュートラルなヘテロ接合性喪失、倍数性など）を特定 ● サンプルデータとコントロールデータを同時に表示することで、バリアントを容易に特定 ● ユーザーフレンドリーな RUO プラットフォーム： バイオインフォマティクスの経験は不要 特長 ● 高解像度な NGS ベースの単一アッセイで、ゲノムワイドな染色体異常の検出。 ● 血液や FFPE 組織を含む多種多様なサンプルタイプからの包括的な細胞遺伝学的情報により、腫瘍学および遺伝病研究における新たな知見が得られる。 ● スケーラブル、迅速、費用対効果に優れ、細胞培養や専用機器は不要。 ● サンプルからレポートまでを統合したサービス： 高度な NGS 経験は不要 解析の概要 ◆遺伝子地図のトポグラフィーを明らかにする CytoTerra® Cytogenetics プラットフォームは、従来の細胞遺伝学のゲノムワイドな構造変異検出能力と、染色体マイクロアレイおよび FISH の分子レベルの精度を、単一の強力な NGS ベースのアッセイに統合します。 近接ライゲーションは、組織、血液、その他のサンプルから、短距離、長距離、超長距離の細胞内 DNA コンタクト（上図の黒い円弧）を捕捉するために使用されます。同一細胞に由来するキメラ接合部を回収し、ショートリードシークエンスライブラリーを作製後、ペアエンドシークエンスを行います。近接ライゲーションシグナルは、ゲノム上の任意の 2 つの遺伝子座間のゲノム距離が短くなるにつれて増加します。AI 駆動型の CytoTerra ソフトウェアは、この固有の情報を高い信頼性で推定し、主要タイプの染色体異常をゲノムワイドに検出することを可能にします。 ◆容易な解析を実現する統合バイオインフォマティクス CytoTerra® Curator は、細胞遺伝学的データの管理を簡素化します。バイオインフォマティクスに関する予備知識は必要ありません。Curator は、CytoTerra プラットフォームで生成されたデータをレビュー、修正、可視化できるデータキュレーションプラットフォームです。 データがCytoTerra プラットフォームにアップロードされると、Phase Genomic 社のバリアントコーラースイートによって処理され、染色体異常の可能性のある領域をハイライト表示するコールセットが生成されます。これらのコールセットは、Curator 上で視覚化および操作でき、ボタンをクリックするだけでレビューやレポート作成が可能です。 ・レビュー： CytoTerra プラットフォームで生成されたバリアントコールを表示し、コントロールゲノムと比較することで、ブレークポイントや領域バリアントの解釈を容易にします。 ・修正： Curator の組み込みツールを利用して、関心領域の選択、ヒートマップのアノテーション付け、染色体異常の特定などを行い、独自のコールセットを生成します。 ・レポート： 選択したコールセットから、論文発表に適した視覚化やレポートを作成します。 解析の流れ CytoTerra プラットフォームは、出生前または出生後の粗サンプルから始まり、標準的な ISCN （国際命名規約： International System for Human Cytogenetic Nomenclature）および塩基配列に基づいた表記法による包括的で実用的なレポート作成までを行う、Sample-to-Report の NGSベースのサイドゲノミクスアッセイを提供します。 生体試料からプロキシミティライゲーションライブラリを調製し、イルミナのプラットフォームでペアエンドシークエンスを実施します。その後、Phase Genomics 独自の計算ツールを用いて、完全自動化されたクラウドベースの解析が実行されます。 CytoTerra プラットフォームは、現在、包括的な Sample-to-Report サービスとして提供されていますが、ライブラリー調製キット（RUO）のご用意もございますので、ご興味がございましたら、お問合せください。 解析例 ◆高い特異性と感度で染色体異常を解析 細胞遺伝学、CMA、および/またはFISHによって既に解析済みの 124 の非特定化サンプル（羊膜、絨毛膜絨毛、およびリンパ球サンプルを含む）のセットを、CytoTerra プラットフォームを使用して解析しました。信頼度の高いすべてのコールは、カバレッジプロットと近接ライゲーションヒートマップ画像を使用して手動で確認しました。サイズが 50kb 未満（本解析時に任意に選択した検出限界）またはモザイク率が 25％ 未満のコールは、解析から除外しました。結果は上表にまとめられています。以前の細胞遺伝学的、CMA および/または FISH 法による解析の結果は、マニュアルキュレーション完了後にのみ解析者に公開されました。 ◆単一のアッセイで主要な構造変異クラスをすべて評価 不均衡型転座、均衡型転座、複合型転座など、様々な種類の染色体異常の代表例（可視化）。図の上段にある均衡型転座、不均衡型転座、および逆位は、近接相互作用マトリックス上の特定のパターンによって示され、CytoTerra プラットフォームの計算ツールを使用して検出することができます。重複、欠失および異数性（下段の例）も CytoTerra プラットフォームで検出され、カバレッジブロッティングスクリプトを使用して可視化することができます。 ⇒その他アプリケーションについて（次世代細胞遺伝学） 対応サンプル種類 クロマチン架橋処理済みサンプル 全血、リンパ球、白血病血液、線維芽細胞、新鮮凍結組織および FFPE 組織、骨髄吸引液、羊膜細胞（直接採取または培養）、絨毛膜絨毛（直接採取または培養）、胎児組織（POC：product of conception）および胎児剖検組織に対応。 その他サンプルタイプとの適合性については、お問合せください。 CytoTerraTM Cytogenomics の資料 ・Product-Brochure_CytoTerra_July-2024.pdf 価格 サービス内容 数量 税別単価 Cat.# CytoTerra® Cytogrenomics 受託解析サービス 1サンプル お問合せ お問合せ ご注意事項（必ずご確認ください） 【解析サービスに関して】 ・ 本サービスは、弊社の海外提携先（Phase Genomics社）にて解析を実施いたします。 ・ お預かりできるサンプルは、BSL2（バイオセーフティーレベル2）までのものに限らせて頂きます。感染性の著しく高いサンプル（HIV、HCV、HBV ウイルスに感染していることが確認されている患者由来の検体など９は、お受けできませんので、ご了承ください。 ・ ヒト臨床サンプルの場合、インフォームドコンセントを得たサンプルをご提供ください。 ・ ご提供頂くサンプルおよび本作業から生じる知的財産権・工業所有権・安全性・インフォームドコンセント等の問題については、弊社では一切の責を負いかねます。 ・ 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルはお引き受けできません。やむを得ない理由でキャンセルされる場合は、それまでの工程に応じた料金をご請求させて頂きます。QC結果等の問題でサンプルを再送する場合は、別途送料をご請求させて頂きます。 ・ 本確認事項を満たさない事で、別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。 【サンプルの送付および取り扱いに関して】 ・ サンプル発送は、必ず「サンプル送付方法およびご注意点（PDF）」をご参照の上、その内容に従って行ってください。 ・ 送付の際は、チューブをパラフィルムで覆い、キャップの緩みや中身の漏れがおきない様にしてください。 サンプルの入ったチューブに油性マジックでサンプル名を明記し、ビニールバック等に入れ、砕いたドライアイスとともに梱包してください。 ・ QCシートおよび免責事項同意書をご記入の上、サンプルと同封してご送付ください。これらのシートが同封されていない場合、またはご記入漏れがある場合、解析サービスの着手が遅れる場合がございますので、ご注意ください。 ・ 新鮮サンプルの場合、上記必要量のペレットを液体窒素凍結後、-80℃保存し、十分量のドライアイスを同梱の上、冷凍宅急便にて、凍結状態にてご送付ください。 ・ 本サービスは、海外での解析となりますので、お送り頂いたサンプルのご返却はできません。貴重なサンプル等はあらかじめご注意ください。 ・ 本確認事項を満たさない事で、別途費用が発生した場合、お客様に費用のご負担をお願いすることがあります。 ◆サンプル送付先　※土日祝祭日および営業時間外のサンプルの受け取りは不可 　フィルジェン株式会社　受託解析部　宛 　〒459-8011　名古屋市緑区定納山1丁目1409番地 　Tel 052-624-4388　Fax 052-624-4389 　営業時間： 9:00～18:00 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