製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞16S/18S/ITSアンプリコンシークエンス受託解析サービス（ショートリード） 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ ヒト全エクソームシークエンス ・ カスタムターゲットエンリッチメント ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ 真核生物用 RNA-Seq ・ 原核生物用 RNA-Seq ・ メタトランスクリプトームシークエンス ・ CircRNA-Seq ・ Exosome Small RNA-Seq ・ PacBio Iso-Seq ・ Long non-coding RNA-Seq ・ Small RNA-Seq ・ 全トランスクリプトームシークエンス ・ 全長mRNA-Seq(Nanopore) + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq ・ 全ゲノムバイサルファイトシークエンス（WGBS） ・ ChIP-Seq ・ RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） ・ ATAC-Seq ・ Hi-C クロマチン相互作用 + ゲノミクス解析 ・ ヒト/動植物全ゲノムシークエンス ・ 動植物 de novo ゲノムシークエンス ・ ゲノムワイド関連シークエンス ・ Hi-C Genome Assembly ・ SLAF-Seq + マイクロバイオミクス解析 ・ ショットガンメタゲノムシークエンス ・ メタゲノムシークエンス（ロングリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（ショートリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（Pacbio） ・ 細菌/真菌ゲノムリシークエンス ・ 細菌ゲノム de novo assembly ・ 真菌ゲノム de novo assembly + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ Biomarker Technologies社（BMKgene）　次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス 受託解析サービス（ショートリード） フィルジェンでは、BMKgene社との業務提携による次世代シークエンスシング（次世代シーケンシング/NGS）/16S/18S/ITSアンプリコンシークエンス受託解析サービスをご提供しています。 概要 16S、18S、および Internal Transcribed Spacer (ITS) 遺伝子マーカーを標的としたショートリードによるアンプリコンシークエンスは、微生物群集内の系統発生、分類、および種の存在量を解明する強力な手法です。このアプローチでは、ハウスキーピング遺伝子マーカーの超可変領域をシークエンシングします。1977 年にらによって分子指紋として初めて導入されたこの手法は、分離を必要としない解析を可能にすることで、マイクロバイオームプロファイリングに革命をもたらしました。16S (細菌)、18S (真菌)、および ITS (真菌) 遺伝子のシークエンシングにより、研究者は豊富な種だけでなく、希少種や未同定種も同定することができます。極めて重要なツールとして広く採用されているアンプリコンシークエンシングは、ヒトの口腔、腸、便およびそれ以外の多様な環境における微生物組成の差異を同定する上で重要な役割を果たしています。 特徴 ◆ シークエンスプラットフォーム： illumina Novaseq ◆ 16S、18S、ITS などの短いターゲット領域の増幅が可能 ◆ 増幅産物の柔軟な選択が可能 ◆ 複数の増幅ターゲットを対象にしたプロジェクト経験 特長 ◆ 単離不要： 環境サンプル中の微生物組成を迅速に同定 ◆ 高解像度： 環境サンプル中の低存在種の検出が可能 ◆ 包括的バイオインフォマティクス解析（有償オプション）： データベース、アノテーション、OTU/ASV といった多様な解析機能を搭載している最新の QIIME2 パッケージ（微生物生態学の定量的解析） ◆ 豊富な専門知識： BMKgene では、年間 15 万件のアンプリコンシークエンスプロジェクトを実施しており、10年以上の実績があります。熟練の技術を持つ解析チームによる包括的なコンテンツを提供します。 ◆ 解析完了後のサポート： プロジェクト完了後 3 か月のアフターサービス期間を設けています。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティングの支援、結果に関する疑問・ご質問にご対応いたします。 サービス内容 ご送付頂いた DNA サンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。 【シークエンスパラメータ】 ライブラリー種類 Amplicon シークエンスプラットフォーム Illumina NovaSeq シークエンス条件 PE250 推奨データ量 50/100/300K tags (Read Pairs) ※推奨データ量は、参考値です。 ※QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 【データ解析内容】 以下の解析が含まれます。 1. Raw データの品質管理 2. OTU クラスタリング/ノイズ除去（ASV） 3. OTU アノテーション 4. アルファ多様性解析： シャノン、シンプソン、ACE を含む複数の指標 5. ベータ多様性解析 6. 相関分析： 環境要因と OUT 組成および多様性の関係 7. 16S 機能遺伝子予測 ※パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 【作業内容】 1. サンプル QC チェック 2. ライブラリー作製 3. シークエンス作業 4. バイオインフォマティクス解析（有償オプション） 【解析データ例】 Histogram of taxonomic distribution taxonomic abundance clustering heat map Alpha diversity analysis： rarefaction curve beta diversity analysis： NMDS Intergroup analysis： LEFSE biomarker discovery 納品物 ・サンプル QC レポート ・FASTQ 形式のシークエンスデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申込み頂いた場合） ・プロジェクトレポート ※USB等の記録メディアにて納品いたします。 ※プロジェクトによって、納品物が変更される場合があります。 サンプル条件 サンプルタイプ 量(Qubit) 液量 濃度 純度（NanoDropTM) Genomicl DNA ≧0.6μg ≧40μL ≧2ng/μL O.D.260/280=1.6-2.5 ※ gDNA 抽出からの作業をご希望の場合はお問合せください。 ※ 色のついた不純物や粘性のある不溶性物質が含まれる DNA 溶液においては、ライブラリー調製の成功率が若干低くなります。そのため、この様なサンプルについては、少なくとも 1μg(Qubit) の DNA をお送りください。 1. DNase, RNase フリーの 1.5mL または 2mL（推奨）のチューブを使用してください。 2. gDNA は、凍結融解をできる限り避け、-20℃で TE Buffer にて保存してください。 3. RNase 処理を行い、DNA が分解されていないことを確認してください。 4. UV スペクトルベースの濃度測定法では、DNA 濃度が不正確になる場合がありますので、蛍光ベースの定量法でも確認して頂くことを強く推奨します。 ※UV スペクトルベースで測定した場合、上記よりも多いゲノム DNA を準備してください。 5. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 6. サンプルの最終的な品質は、業務提携先での QCチェックの結果に従います事、予めご了承ください。 価格・納期 【価格】 サービス名 データ量 1) サンプル数 税別単価　1） 型番 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス 受託解析サービス（ショートリード） 50K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 100K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 300K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス 受託解析サービス（ショートリード） バイオインフォマティクス解析付き 50K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 100K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 300K Tags 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 1) 海外へのサンプル輸送費用および HDD/USB 費用が別途必要です。 ※ カスタムのアンプリコンシークエンスにも対応可能です。ご希望の増幅領域がございましたら、ご相談ください。 【納期】 　約 1.5～2 ヶ月（バイオインフォマティクス解析付： 約 2～2.5 ヶ月） 　※納期は、QCチェック合格後となります。 　※年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 ご注意事項 （必ずご確認ください） ・ 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Biomarker Technologies(BMKGene)社にて実施されます。 ・ 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルをお引き受けできません。 ・ やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。 ・ サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 ・ ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。（サンプルは解析終了後に破棄されます。） ・ 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 ・ サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受入れが不能又は拒否されたりする場合もあります。 ※本サイトの情報は、Biomarker Technologies(BMKgene)社のホームページに掲載されている情報や画像を一部引用しています。 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) Filgen, Inc.　All Rights Reserved.