製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞ATAC-Seq 受託解析サービス 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ ヒト全エクソームシークエンス ・ カスタムターゲットエンリッチメント ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ 真核生物用 RNA-Seq ・ 原核生物用 RNA-Seq ・ メタトランスクリプトームシークエンス ・ CircRNA-Seq ・ Exosome Small RNA-Seq ・ PacBio Iso-Seq ・ Long non-coding RNA-Seq ・ Small RNA-Seq ・ 全トランスクリプトームシークエンス ・ 全長mRNA-Seq(Nanopore) + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq ・ 全ゲノムバイサルファイトシークエンス（WGBS） ・ ChIP-Seq ・ RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） ・ ATAC-Seq ・ Hi-C クロマチン相互作用 + ゲノミクス解析 ・ ヒト/動植物全ゲノムシークエンス ・ 動植物 de novo ゲノムシークエンス ・ ゲノムワイド関連シークエンス ・ Hi-C Genome Assembly ・ SLAF-Seq + マイクロバイオミクス解析 ・ ショットガンメタゲノムシークエンス ・ メタゲノムシークエンス（ロングリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（ショートリード） ・ 16S/18S/ITS アンプリコンシークエンス（Pacbio） ・ 細菌/真菌ゲノムリシークエンス ・ 細菌ゲノム de novo assembly ・ 真菌ゲノム de novo assembly + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ Biomarker Technologies社（BMKgene）　次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス ATAC-Seq 受託解析サービス フィルジェンでは、BMKgene社との業務提携による次世代シークエンスシング（次世代シーケンシング/NGS）/ATAC-Seq 受託解析サービスをご提供しています。 概要 ATAC-Seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin Sequencing) は、ゲノムワイドなクロマチンアクセシビリティ解析に使用されるハイスループットシークエンス技術です。この手法により、遺伝子発現に対するグローバルなエピジェネティック制御の複雑なメカニズムをより深く理解できます。この方法では、高活性 Tn5 トランスポザーゼを使用して、シークエンシングアダプターを挿入することにより、オープンクロマチン領域の断片化とタグ付けを同時に行います。その後の PCR 増幅によりシークエンスライブラリーが作成され、特定の時空間条件下でオープンクロマチン領域を包括的に同定します。ATAC-Seq は、転写因子結合部位や特定のヒストン修飾領域のみに焦点を当てた方法とは異なり、アクセス可能なクロマチンランドスケープの全体像を提供します。これらのオープンクロマチン領域をシークエンスすることにより、ATAC-Seq は、活性制御配列および潜在的な転写因子結合部位である可能性が高い領域を明らかにし、ゲノム全体にわたる遺伝子発現の動的調節に関する貴重な知見を提供します。 特徴 ◆ DNA-タンパク質相互作用を維持するため、抽出された核酸ではなく組織サンプルが必要 ◆ ATAC 法には、組織解離、核の単離、Tn5 処理と精製、PCR増幅、サイズ選択、およびシークエンシングを含む ◆ Illumina NovaSeq でのシークエンシング 特長 ◆ 高感度：　少量のスタート細胞数で、ライブラリー調製およびシークエンシングが可能 ◆ 情報量の多い技術：　オープンなクロマチンゲノム上の位置や、転写因子結合部位の様な活性制御エレメントを多面的に明らかにします。 ◆ 優れた実験再現性：　テクニカルレプリケートは優れた再現性を示します。 ◆ 包括的なバイオインフォマティクス解析：　クロマチンのオープン領域とそれに対応する機能（プロモーター、UT、エクソン、イントロン）の同定だけでなく、サンプル間のクロマチンオープン領域間の差異の解析も可能です。 ◆ トランスクリプトミクス解析との連携が可能：　ATAC-Seq と RNA-Seq などの他のオミクスデータの統合分析も可能です（ご希望の場合はご相談ください）。 ◆ 豊富な専門知識： 10 年以上にわたる経験、高度なスキルを持つ分析チーム、包括的なコンテンツを提供します。 ◆ 解析完了後のサポート： プロジェクト完了後 3 か月のアフターサービス期間を設けています。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティングの支援、結果に関する疑問・ご質問にご対応いたします。 サービス内容 ご送付頂いたサンプルからのDNA抽出、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。 【シークエンス内容】 ライブラリー種類 シークエンス条件 推奨データ出力量 データQC ATAC-Seq Illumina PE150 ＞20M reads ゲノムサイズに依存 （例）Human：50M reads Q30≧85% ※推奨データ出力量は、参考値です。 ※QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 【データ解析内容】 以下の解析が含まれます： 1. Raw データの品質管理 2. 参照ゲノムへのマッピングに基づくピークコール 3. ピーク関連遺伝子のアノテーション 4. モチーフ解析： 転写因子結合部位（TFBS）の同定 5. 差分ピーク解析とアノテーション ※ パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 【作業内容】 1. サンプルの前処理： 組織分離（組織サンプルの場合）、核分離 2. 各サンプルの品質チェック 3. ライブラリー作製： Tn5 処理および精製、PCR増幅、サイズ選択 4. シークエンス作業 5. バイオインフォマティクス解析（有償オプション） 【解析データ例】 Heatmap on ATAC reads distribution at TSS and adjacent regions (±3 kb) Distribution of open chromatin region in different genome components Differential peak calling between groups 納品物 ・サンプル QC レポート ・FASTQ 形式のシークエンスデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（有償オプション） ・プロジェクトレポート ※USB等の記録メディアにて納品いたします。 ※プロジェクトによって、納品物が変更される場合があります。 サンプル条件 サンプル種類 必要量 細胞 ≧106 cells 新鮮組織 ≧200 mg 血液 ≧4 mL 1. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 2. サンプルの最終的な品質は、業務提携先での QCチェックの結果に従います事、予めご了承ください。 価格・納期 【価格】 サービス名 データ量 1) サンプル数 税別単価　2） 型番 ATAC-Seq 受託解析サービス  お問合せ 1サンプル以上 お問合せ お問合せ ATAC-Seq 受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付き  お問合せ 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 1) 上記以外のデータ量をご希望の場合には、お問合せください。 2) 海外へのサンプル輸送費用および HDD/USB 費用が別途必要です。 【納期】 　約 2～2.5 ヶ月（バイオインフォマティクス解析付： 約 2.5～3 ヶ月） 　※納期は、QCチェック合格後となります。 　※年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 ご注意事項 （必ずご確認ください） ・ 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Biomarker Technologies(BMKGene)社にて実施されます。 ・ 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルをお引き受けできません。 ・ やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。 ・ サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 ・ ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。（サンプルは解析終了後に破棄されます。） ・ 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 ・ サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受入れが不能又は拒否されたりする場合もあります。 ※本サイトの情報は、Biomarker Technologies(BMKgene)社のホームページに掲載されている情報や画像を一部引用しています。 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) Filgen, Inc.　All Rights Reserved.