製品情報・受託サービス情報 What's New!　製品・サービス情報　ダウンロード　e-mail_news登録　　　　 会社情報 概要　ミッション　アクセス　リクルート　連絡先　ビジネスパートナー　ライセンス　個人情報保護方針 Home＞製品・サービス情報＞受託サービス＞次世代シークエンシング（概要）＞Small RNA-Seq 受託解析サービス（BMKgene） 製品・サービス情報 　　 受託サービス サービス別ラインナップ ・次世代シークエンシング + 概要 + 受託解析サービスの流れ + QCシート 対応アプリケーション + シングルセル解析 ・ シングルセルシークエンス ・ snRNA-Seq (10X Genomics Chromium) + 遺伝子パネル解析 ・ ヒト全エクソームシークエンス ・ カスタムターゲットエンリッチメント ・ リキッドバイオプシー用 OptiSeq がんパネル解析サービス + 空間トランスクリプトーム解析 ・ BMKMANU ・ 10x Genomics Visium + トランスクリプトミクス解析 ・ 真核生物用 RNA-Seq ・ 原核生物用 RNA-Seq ・ CircRNA-Seq ・ Exosome Small RNA-Seq ・ PacBio Iso-Seq ・ Long non-coding RNA-Seq ・ Small RNA-Seq ・ 全トランスクリプトームシークエンス ・ 全長mRNA-Seq(Nanopore) + トランスラトミクス解析 ・ Ribosome Profiling + エピゲノミクス解析 ・ tRNA-Seq ・ tRF＆tiRNA-Seq ・ (h)MeDIP-Seq with LncRNA Promoter ・ エピトランスクリプトームシークエンス ・ R-loop profiling ・ eccDNA-Seq ・ 全ゲノムバイサルファイトシークエンス（WGBS） ・ ChIP-Seq ・ RRBS（Reduced Representation Bisulfite Sequencing） ・ ATAC-Seq ・ Hi-C クロマチン相互作用 + ゲノミクス解析 ・ ヒト/動植物全ゲノムシークエンス ・ 動植物 de novo ゲノムシークエンス ・ ゲノムワイド関連シークエンス ・ Hi-C Genome Assembly ・ SLAF-Seq + メタゲノム解析 ・ ショットガンメタゲノムシークエンス + Hi-Cシークエンス解析 ・ Proximo Hi-C Genome Scaffolding ・ ProxiMeta Hi-C Metagenome Deconvolution ・ CytoTerra Cytogenomics ・ OncoTerra Oncology + 抗原特異的プロファイリング ・ HuScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 ・ MouseScan PhIP-Seq Antibody Profiling 解析 + Reptor 免疫レパートリーシークエンス解析 ・ Hybridoma Sequencing ・ Bulk B cell Sequencing ・ Display Library Sequencing 　　 科学機器 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 試薬・材料・消耗品 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ 　　 ソフトウェア 製品別ラインナップ メーカー別ラインナップ Biomarker Technologies社（BMKgene）　次世代シークエンシング(NGS)受託解析サービス Small RNA-Seq 受託解析サービス フィルジェンでは、BMKgene社との業務提携による次世代シークエンスシング（次世代シーケンシング/NGS）/Small RNA-Seq 受託解析サービスをご提供しています。 概要 Small RNA (sRNA) 分子には、microRNAs (miRNA)、small interfering RNAs (siRNA)、および piwi-interacting RNAs (piRNA) が含まれます。これらのうち、約 18-25 ヌクレオチドの長さの miRNA は、様々な細胞プロセスにおける極めて重要な調節的役割において、特に注目されています。組織特異的および段階特異的な発現パターンを持つ miRNA は、異なる生物種間で高い保存性を示します。 特徴 ◆ サイズ選択ステップを含むライブラリー調製 ◆ miRNA 予測とその標的を中心としたバイオインフォマティクス解析（有償オプション） 特長 ◆ 厳格な品質管理： サンプルおよびライブラリーの調製からシークエンシング、バイオインフォマティクスに至るまで、すべての段階にわたって管理ポイントを導入しています。この綿密なモニタリングにより、一貫して高品質の結果の提供を可能にします。 ◆ 豊富な専門知識： BMKgene では様々な研究領域で 300 以上の生物種の sRNA プロジェクトの成功実績があります。この豊富な経験をあらゆるプロジェクトに活かします。 ◆ 包括的なバイオインフォマティクス分析： 既知および新規の miRNA の同定、miRNA ターゲットの同定、および機能アノテーション付けと複数のデータベース（KEGG、GO）によるエンリッチメンチを可能にします。 ◆ 解析完了後のサポート： プロジェクト完了後 3 か月のアフターサービス期間を設けています。この期間中、プロジェクトのフォローアップ、トラブルシューティングの支援、結果に関する疑問・ご質問にご対応いたします。 サービス内容 ご送付頂いた RNA サンプルを用いて、品質チェック（QCチェック）から次世代シークエンスまで実施いたします。さらに、オプションでバイオインフォマティクス解析にも対応いたします。 【シークエンスパラメーターとデータ解析内容】 シークエンス条件 Illumina Novaseq, SE50 ライブラリータイプ サイズ選択 推奨データ出力量 10M-20M reads データ品質管理 Q30≧85％ データ解析 1. データQC 2. sRNA の分類 3. 参照ゲノムへのアライメント 4. 既知および新規 miRNA の同定 5. miRNA の発現差解析 6. miRNA ターゲットの機能アノテーション ※ 推奨データ出力量は、参考値です。 ※ QCチェックに合格したサンプルは、シークエンス量の保証対象となります。 ※ パッケージの解析内容は、業務提携先のパイプラインの変更・更新等により、変更される場合があります。 【作業内容】 1. サンプル QC チェック 2. ライブラリー作製 3. シークエンス作業 4. バイオインフォマティクス解析（有償オプション） 【解析データ例】 Identification of miRNA： structure and depth Differential expression of miRNA - hiearchical clustering Functional annotation of target of defferentially expressed miRNAs 納品物 ・サンプル QC レポート ・FASTQ 形式のシークエンスデータ ・バイオインフォマティクス解析データ（バイオインフォマティクス解析をお申込み頂いた場合） ・プロジェクトレポート ※USB等の記録メディアにて納品いたします。 ※プロジェクトによって、納品物が変更される場合があります。 サンプル条件 サンプル種類 必要量 RIN（Agilent2100） 純度（NanoDropTM） Total RNA ≧1.6μg 液量：≧20μL 濃度：≧80ng/μL RIN≧6.0； 5.0≧28S/18S≧1.0； limited or no baseline elevation O.D.260/280：1.7-2.5 O.D.260/230：0.5-2.5 limited or no protein or DNA contamination shown on gel ※ Total RNA 抽出からの作業をご希望の場合は、お問合せください。 1. DNase, RNase フリーの 1.5mL または 2mL（推奨）のチューブを使用してください。 2. Total RNA は、RNase-free H2O に溶解し、-80℃以下で保存してください。 3. DNase 処理を行うことを強く推奨します。 4. サンプル送付先及び注意事項につきましては、「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 5. サンプルの最終的な品質は、業務提携先での QCチェックの結果に従います事、予めご了承ください。 価格・納期 【価格】 サービス名 リード数 1) サンプル数 税別単価　2） 型番 Small RNA-Seq 受託解析サービス  10M reads 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 20M reads 1サンプル以上 お問合せ お問合せ Small RNA-Seq 受託解析サービス バイオインフォマティクス解析付き  10M reads 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 20M reads 1サンプル以上 お問合せ お問合せ 1) ご希望の取得リード数がございましたらご相談ください。 2) 海外へのサンプル輸送費用および HDD/USB 費用が別途必要です。 【納期】 　約 2 ヶ月（バイオインフォマティクス解析付： 約 2.5 ～ 3 ヶ月） 　※納期は、QCチェック合格後となります。 　※年末年始、夏季休業、祝日、受注の集中状況等により、上記より日数を頂く場合がございますこと、予めご了承ください。 サービスの流れ 「受託解析サービスの流れ」をご参照ください。 ご注意事項 （必ずご確認ください） ・ 本サービスの解析作業は、弊社の海外提携先（Biomarker Technologies(BMKGene)社にて実施されます。 ・ 本サービスは、海外での解析という性質上、キャンセルをお引き受けできません。 ・ やむを得ない理由でキャンセルされる場合、それまでの工程に応じた料金を請求いたします。 ・ サンプルの品質チェック（QCチェック）の結果やライブラリー作製などの問題から、再度サンプルをお送り頂く場合、弊社提携先への送料をご負担いただきます。 ・ ご提供頂いたサンプルの返却は致しておりません。（サンプルは解析終了後に破棄されます。） ・ 生データを含む解析結果は、発送から90日後に消去いたします。 ・ サンプルの生物種又は状態によっては、動物検疫、法規制、国際条約などにより、輸出規制の対象となる場合があり、サンプル輸送に必要な手続きに日数を要したり、弊社提携先にて受入れが不能又は拒否されたりする場合もあります。 ※本サイトの情報は、Biomarker Technologies(BMKgene)社のホームページに掲載されている情報や画像を一部引用しています。 【お問合せ】 受託解析部 Phone 052-624-4388 https://filgen.jp/ Copyright (C) Filgen, Inc.　All Rights Reserved.